Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C6A4D8

Protein Details
Accession A0A2C6A4D8    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
90-171QKVPRGLRRRTASHNPKRVARRLRARARREMAEDKTPVVEPRRRKPRTTRARIRAETAKRLAVLAARKRRRQQPKQAEAAGRHydrophilic
188-226GVVGRKPRPKIRRNQLNEPPRPPAKFRKRQINKTWLPTHHydrophilic
614-644GAEWELQRRRERRREWDRRPKSKRVAWAAVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-34KR
91-164KVPRGLRRRTASHNPKRVARRLRARARREMAEDKTPVVEPRRRKPRTTRARIRAETAKRLAVLAARKRRRQQPK
191-217GRKPRPKIRRNQLNEPPRPPAKFRKRQ
621-637RRRERRREWDRRPKSKR
Subcellular Location(s) mito 15.5, cyto_mito 13, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MAPKAPTTAAAPSKRSAAAAAHANGRGDGARQKRAKLHAARNIPVQPAEAALRDGELDLQAFVAAHEFEIKSLEQSMATSKAVGTSRAFQKVPRGLRRRTASHNPKRVARRLRARARREMAEDKTPVVEPRRRKPRTTRARIRAETAKRLAVLAARKRRRQQPKQAEAAGRDGQEPADADAAAARDAGVVGRKPRPKIRRNQLNEPPRPPAKFRKRQINKTWLPTHTWHAKRAHMTEPKNPLWRFAIPITPNDKIYRPTHRSQGERGTMVWDTSYMSTIGLYGRVAGIERVLRGLGISHDACWADKGRRWRMGTRTWSGMLSRETKGGGPHRRLVCPATVLWNPEPRDGRDGGASGRTAQRQVYLRVHPSAFLELFNELLRLTRMEKPHTYIEDLRFEIGSVELTGPASTEALLAVLTPYATDDVPKPRHAALFESLEGLTNPATLPANSLLSFSVQDPRLRYPPRRREFPGTLEAQMALLHTMAKWPAEEGLEPYGLFDRDARHRASCLPSQRSINRRRGQAAAGSLLRPTRADPPIPVVLVASRSASSTQTQGTWTLLAPWQCILPIWYGLVHVPLVSGLNPRFGGMNEAMQVAFERGLPWFPGDFTATDAGAEWELQRRRERRREWDRRPKSKRVAWAAVDLGAGRRGEVGDGLACDFELLFGLPRRREEKEEEEEQGTLHRPLTGRWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.39
3 0.33
4 0.26
5 0.26
6 0.3
7 0.31
8 0.32
9 0.32
10 0.32
11 0.3
12 0.28
13 0.24
14 0.19
15 0.25
16 0.26
17 0.34
18 0.38
19 0.43
20 0.49
21 0.55
22 0.62
23 0.64
24 0.68
25 0.68
26 0.72
27 0.71
28 0.71
29 0.69
30 0.61
31 0.52
32 0.44
33 0.34
34 0.29
35 0.27
36 0.2
37 0.17
38 0.14
39 0.14
40 0.12
41 0.12
42 0.11
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.12
59 0.14
60 0.14
61 0.11
62 0.12
63 0.15
64 0.16
65 0.16
66 0.15
67 0.14
68 0.18
69 0.19
70 0.21
71 0.2
72 0.25
73 0.31
74 0.36
75 0.37
76 0.34
77 0.42
78 0.48
79 0.55
80 0.58
81 0.6
82 0.6
83 0.69
84 0.74
85 0.71
86 0.71
87 0.73
88 0.74
89 0.76
90 0.81
91 0.77
92 0.78
93 0.8
94 0.81
95 0.8
96 0.78
97 0.79
98 0.79
99 0.85
100 0.87
101 0.85
102 0.86
103 0.82
104 0.77
105 0.74
106 0.71
107 0.65
108 0.62
109 0.57
110 0.47
111 0.43
112 0.39
113 0.36
114 0.36
115 0.37
116 0.38
117 0.47
118 0.57
119 0.59
120 0.66
121 0.72
122 0.76
123 0.81
124 0.84
125 0.84
126 0.83
127 0.89
128 0.84
129 0.8
130 0.79
131 0.74
132 0.71
133 0.64
134 0.56
135 0.45
136 0.43
137 0.37
138 0.32
139 0.34
140 0.34
141 0.42
142 0.47
143 0.54
144 0.62
145 0.71
146 0.78
147 0.8
148 0.82
149 0.83
150 0.84
151 0.85
152 0.84
153 0.79
154 0.7
155 0.65
156 0.57
157 0.47
158 0.38
159 0.3
160 0.23
161 0.19
162 0.18
163 0.13
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.09
177 0.14
178 0.21
179 0.26
180 0.31
181 0.41
182 0.51
183 0.57
184 0.66
185 0.72
186 0.76
187 0.79
188 0.85
189 0.85
190 0.86
191 0.85
192 0.78
193 0.74
194 0.68
195 0.63
196 0.59
197 0.6
198 0.6
199 0.63
200 0.66
201 0.7
202 0.75
203 0.82
204 0.87
205 0.86
206 0.82
207 0.8
208 0.8
209 0.71
210 0.65
211 0.58
212 0.54
213 0.53
214 0.5
215 0.47
216 0.44
217 0.47
218 0.47
219 0.48
220 0.5
221 0.49
222 0.5
223 0.5
224 0.55
225 0.55
226 0.59
227 0.55
228 0.49
229 0.44
230 0.41
231 0.38
232 0.31
233 0.33
234 0.26
235 0.31
236 0.33
237 0.31
238 0.31
239 0.3
240 0.3
241 0.27
242 0.3
243 0.35
244 0.36
245 0.38
246 0.44
247 0.48
248 0.5
249 0.5
250 0.55
251 0.48
252 0.43
253 0.4
254 0.35
255 0.29
256 0.26
257 0.21
258 0.12
259 0.1
260 0.09
261 0.1
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.13
291 0.12
292 0.14
293 0.23
294 0.28
295 0.35
296 0.38
297 0.42
298 0.46
299 0.52
300 0.56
301 0.51
302 0.47
303 0.41
304 0.39
305 0.33
306 0.3
307 0.25
308 0.22
309 0.19
310 0.17
311 0.17
312 0.17
313 0.2
314 0.25
315 0.29
316 0.29
317 0.35
318 0.37
319 0.37
320 0.38
321 0.36
322 0.29
323 0.23
324 0.2
325 0.18
326 0.17
327 0.19
328 0.19
329 0.23
330 0.23
331 0.25
332 0.27
333 0.23
334 0.26
335 0.23
336 0.22
337 0.17
338 0.17
339 0.14
340 0.13
341 0.12
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.13
346 0.12
347 0.16
348 0.17
349 0.21
350 0.24
351 0.25
352 0.27
353 0.29
354 0.29
355 0.25
356 0.23
357 0.21
358 0.17
359 0.14
360 0.12
361 0.09
362 0.1
363 0.09
364 0.08
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.09
370 0.13
371 0.16
372 0.2
373 0.21
374 0.25
375 0.29
376 0.29
377 0.3
378 0.3
379 0.31
380 0.31
381 0.3
382 0.27
383 0.22
384 0.2
385 0.17
386 0.12
387 0.09
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.08
411 0.16
412 0.19
413 0.21
414 0.23
415 0.23
416 0.26
417 0.25
418 0.26
419 0.21
420 0.22
421 0.21
422 0.2
423 0.19
424 0.17
425 0.16
426 0.13
427 0.1
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.06
433 0.08
434 0.09
435 0.11
436 0.1
437 0.11
438 0.1
439 0.1
440 0.11
441 0.1
442 0.15
443 0.15
444 0.18
445 0.2
446 0.24
447 0.31
448 0.36
449 0.44
450 0.49
451 0.58
452 0.63
453 0.68
454 0.7
455 0.71
456 0.71
457 0.67
458 0.63
459 0.55
460 0.48
461 0.41
462 0.36
463 0.27
464 0.21
465 0.16
466 0.09
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.1
479 0.12
480 0.12
481 0.12
482 0.12
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.11
487 0.13
488 0.19
489 0.23
490 0.25
491 0.24
492 0.26
493 0.3
494 0.34
495 0.36
496 0.39
497 0.41
498 0.43
499 0.48
500 0.54
501 0.59
502 0.63
503 0.67
504 0.64
505 0.64
506 0.63
507 0.59
508 0.54
509 0.49
510 0.43
511 0.37
512 0.33
513 0.28
514 0.26
515 0.23
516 0.21
517 0.17
518 0.17
519 0.19
520 0.21
521 0.22
522 0.22
523 0.27
524 0.3
525 0.3
526 0.28
527 0.21
528 0.18
529 0.18
530 0.17
531 0.13
532 0.1
533 0.11
534 0.12
535 0.13
536 0.13
537 0.14
538 0.15
539 0.15
540 0.16
541 0.16
542 0.16
543 0.15
544 0.14
545 0.14
546 0.16
547 0.16
548 0.16
549 0.15
550 0.14
551 0.13
552 0.13
553 0.12
554 0.11
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.11
559 0.11
560 0.12
561 0.11
562 0.08
563 0.07
564 0.07
565 0.08
566 0.08
567 0.13
568 0.12
569 0.16
570 0.16
571 0.16
572 0.17
573 0.16
574 0.2
575 0.16
576 0.18
577 0.16
578 0.17
579 0.16
580 0.15
581 0.16
582 0.12
583 0.11
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.1
588 0.11
589 0.12
590 0.12
591 0.12
592 0.14
593 0.15
594 0.15
595 0.16
596 0.17
597 0.15
598 0.14
599 0.14
600 0.13
601 0.11
602 0.12
603 0.1
604 0.16
605 0.2
606 0.25
607 0.34
608 0.41
609 0.51
610 0.61
611 0.69
612 0.72
613 0.8
614 0.86
615 0.89
616 0.92
617 0.93
618 0.94
619 0.94
620 0.93
621 0.92
622 0.88
623 0.86
624 0.85
625 0.82
626 0.74
627 0.71
628 0.62
629 0.53
630 0.46
631 0.36
632 0.28
633 0.22
634 0.19
635 0.13
636 0.13
637 0.12
638 0.12
639 0.12
640 0.12
641 0.1
642 0.11
643 0.12
644 0.11
645 0.1
646 0.1
647 0.09
648 0.07
649 0.06
650 0.06
651 0.09
652 0.15
653 0.22
654 0.25
655 0.32
656 0.37
657 0.41
658 0.46
659 0.5
660 0.53
661 0.55
662 0.58
663 0.56
664 0.53
665 0.49
666 0.43
667 0.39
668 0.33
669 0.27
670 0.22
671 0.21
672 0.19