Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8LWT4

Protein Details
Accession B8LWT4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-176AFSLAKYKLRKEKKYLKRFTIVHydrophilic
549-571HVQARGVNSRKKRKLDVGDNGTPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.833, mito_nucl 9.166, cyto 9, nucl 8.5, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MDSVVQPHQYVAVRMSSGMYKLVKAAPNTTILLGKYGSFYTNHIIGRPFHQTYELLPTPEEDGYSLRVVPAAELHAEALISEGSAEVDGLIEEPPESGSAGQQPIRSNRDINDDGSAQTLTWEEIEDLKRNTTGAGKEIIDKLLESHSTIDKKTAFSLAKYKLRKEKKYLKRFTIVPLDVNILTEYMLEQKEAHRIMELRHELIGLLGCWGNVHHSGNLENVEPNGRYLVIDDTGGLVVAAMAERMGILHPPGEDEEDEEVDDGLVLKEEETSEVPTQSDPANEHRHTGEQKARPQTRPHAKRQPMTAKQNSITVIHPHSQPNLSLLKYFGYDTEEPNVSHPLFEHLKLATWLQVLDPEADNIYSEKPEEVDEATLKTYKPRQRGTYHRKHARWARVRRVVDEIRAGGYDGLVVASVMDPDSILRHLVPLLSGGASIAVYSPSVEPLTLLMDLYSTARRSAYISKKADLEKERRSIDLDNMDVDLPSVESQLASEFSLDPTLVLAPMLQTSRVREWQVLPGRTHPLMSGRGGAEGYIFHGIRAIPQSQHVQARGVNSRKKRKLDVGDNGTPDDGSTPVAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.19
4 0.18
5 0.22
6 0.21
7 0.18
8 0.21
9 0.26
10 0.29
11 0.29
12 0.32
13 0.29
14 0.32
15 0.32
16 0.31
17 0.28
18 0.24
19 0.24
20 0.2
21 0.18
22 0.17
23 0.16
24 0.17
25 0.14
26 0.17
27 0.19
28 0.24
29 0.24
30 0.24
31 0.26
32 0.27
33 0.3
34 0.36
35 0.33
36 0.28
37 0.3
38 0.29
39 0.28
40 0.36
41 0.34
42 0.27
43 0.25
44 0.25
45 0.26
46 0.25
47 0.23
48 0.14
49 0.13
50 0.15
51 0.16
52 0.15
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.06
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.03
74 0.04
75 0.04
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.06
85 0.08
86 0.12
87 0.16
88 0.18
89 0.21
90 0.26
91 0.32
92 0.37
93 0.38
94 0.36
95 0.35
96 0.41
97 0.4
98 0.36
99 0.33
100 0.29
101 0.27
102 0.26
103 0.24
104 0.15
105 0.13
106 0.12
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.12
112 0.15
113 0.19
114 0.2
115 0.21
116 0.21
117 0.2
118 0.21
119 0.2
120 0.19
121 0.17
122 0.19
123 0.19
124 0.22
125 0.23
126 0.23
127 0.18
128 0.17
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.12
133 0.13
134 0.18
135 0.2
136 0.2
137 0.23
138 0.22
139 0.23
140 0.24
141 0.28
142 0.23
143 0.23
144 0.31
145 0.35
146 0.42
147 0.45
148 0.5
149 0.54
150 0.62
151 0.67
152 0.69
153 0.72
154 0.75
155 0.82
156 0.84
157 0.81
158 0.77
159 0.72
160 0.69
161 0.68
162 0.58
163 0.48
164 0.4
165 0.36
166 0.3
167 0.28
168 0.22
169 0.12
170 0.11
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.16
179 0.17
180 0.16
181 0.15
182 0.16
183 0.17
184 0.26
185 0.26
186 0.21
187 0.21
188 0.21
189 0.18
190 0.18
191 0.17
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.13
205 0.14
206 0.13
207 0.11
208 0.1
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.05
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.08
260 0.09
261 0.09
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.14
269 0.21
270 0.21
271 0.23
272 0.22
273 0.26
274 0.26
275 0.29
276 0.32
277 0.3
278 0.36
279 0.44
280 0.48
281 0.48
282 0.51
283 0.56
284 0.59
285 0.6
286 0.63
287 0.64
288 0.66
289 0.66
290 0.7
291 0.71
292 0.68
293 0.7
294 0.66
295 0.59
296 0.54
297 0.53
298 0.46
299 0.37
300 0.3
301 0.24
302 0.22
303 0.2
304 0.21
305 0.2
306 0.21
307 0.2
308 0.19
309 0.19
310 0.19
311 0.16
312 0.14
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.1
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.17
322 0.17
323 0.17
324 0.18
325 0.21
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.15
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.13
334 0.14
335 0.15
336 0.15
337 0.11
338 0.1
339 0.1
340 0.08
341 0.1
342 0.09
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.1
360 0.11
361 0.12
362 0.13
363 0.12
364 0.15
365 0.23
366 0.27
367 0.34
368 0.4
369 0.46
370 0.52
371 0.64
372 0.7
373 0.73
374 0.78
375 0.8
376 0.75
377 0.77
378 0.78
379 0.78
380 0.77
381 0.76
382 0.76
383 0.75
384 0.75
385 0.69
386 0.68
387 0.6
388 0.53
389 0.46
390 0.36
391 0.28
392 0.26
393 0.24
394 0.16
395 0.13
396 0.1
397 0.06
398 0.05
399 0.04
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.04
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.05
428 0.06
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.07
434 0.09
435 0.08
436 0.08
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.09
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.11
445 0.11
446 0.15
447 0.24
448 0.31
449 0.38
450 0.41
451 0.43
452 0.48
453 0.51
454 0.55
455 0.54
456 0.53
457 0.52
458 0.56
459 0.55
460 0.51
461 0.51
462 0.46
463 0.44
464 0.41
465 0.34
466 0.27
467 0.27
468 0.26
469 0.22
470 0.2
471 0.14
472 0.09
473 0.08
474 0.08
475 0.06
476 0.06
477 0.07
478 0.08
479 0.09
480 0.08
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.08
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.09
494 0.1
495 0.11
496 0.12
497 0.17
498 0.23
499 0.28
500 0.3
501 0.31
502 0.33
503 0.41
504 0.48
505 0.49
506 0.46
507 0.45
508 0.49
509 0.46
510 0.44
511 0.36
512 0.32
513 0.3
514 0.29
515 0.29
516 0.23
517 0.24
518 0.23
519 0.21
520 0.17
521 0.13
522 0.14
523 0.15
524 0.14
525 0.13
526 0.15
527 0.15
528 0.18
529 0.22
530 0.23
531 0.18
532 0.23
533 0.28
534 0.32
535 0.38
536 0.36
537 0.35
538 0.34
539 0.4
540 0.46
541 0.49
542 0.52
543 0.57
544 0.67
545 0.72
546 0.77
547 0.79
548 0.79
549 0.81
550 0.83
551 0.83
552 0.81
553 0.8
554 0.75
555 0.68
556 0.59
557 0.48
558 0.37
559 0.28
560 0.19