Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YRB6

Protein Details
Accession A0A2C5YRB6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
432-452DVDFSKDKYIKQPKAKKAGAWHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 13.5, nucl 8, cyto_mito 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008921  DNA_pol3_clamp-load_cplx_C  
IPR013725  DNA_replication_fac_RFC1_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR012178  RFC1  
Gene Ontology GO:0005663  C:DNA replication factor C complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003689  F:DNA clamp loader activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006271  P:DNA strand elongation involved in DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF08519  RFC1  
CDD cd18140  HLD_clamp_RFC  
Amino Acid Sequences MNNTSLLGYFAGDGKAVDAMKKKLVLIMDEVDGMSAGDRGGVGALAKFCKKTEVPLILICNERRLPKMKPFDHVAFDIRFNRPTVDQVRSRIMTICHREGLKLPPPVVDALIEGSNKDIRQIINMISTAKLDQTSMSFDQGKAMTKAWEKHVVLKPWDICQKMLAGGLFLPTSKATLNDKIELYFNDHEFSFLMIQENYLRTKPLALNGKNYTKREENLKALELFDRAAESISDGDLVDRMIHGPQQHWSLMPTHAVFSTVRPASFIAGQLLGSNFTSWLGNFSKTGKLGRFVREIHSHMRLKSSGDHNEIRQQYFPLLWNRLVDRLQQEGTAAVGDVIELMDSYFLTREDFDAIKELGVGPMTEEEVQIETKTKAAFTRTYNSMTHPIPFMKASNVVAPKKQAKEAPDLEEAIEEEDDVEIVEAAEADDDDVDFSKDKYIKQPKAKKAGAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.12
3 0.12
4 0.16
5 0.2
6 0.23
7 0.27
8 0.29
9 0.28
10 0.28
11 0.3
12 0.28
13 0.26
14 0.26
15 0.23
16 0.21
17 0.21
18 0.18
19 0.15
20 0.13
21 0.09
22 0.06
23 0.05
24 0.05
25 0.04
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.07
31 0.1
32 0.14
33 0.16
34 0.18
35 0.18
36 0.24
37 0.24
38 0.28
39 0.35
40 0.37
41 0.38
42 0.42
43 0.45
44 0.42
45 0.47
46 0.41
47 0.38
48 0.36
49 0.35
50 0.35
51 0.37
52 0.4
53 0.44
54 0.54
55 0.51
56 0.54
57 0.58
58 0.58
59 0.57
60 0.54
61 0.49
62 0.4
63 0.42
64 0.41
65 0.37
66 0.34
67 0.31
68 0.3
69 0.27
70 0.32
71 0.32
72 0.34
73 0.36
74 0.38
75 0.44
76 0.42
77 0.42
78 0.38
79 0.37
80 0.38
81 0.41
82 0.4
83 0.37
84 0.37
85 0.37
86 0.37
87 0.41
88 0.39
89 0.37
90 0.34
91 0.31
92 0.32
93 0.31
94 0.28
95 0.21
96 0.14
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.14
103 0.13
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.15
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.17
113 0.15
114 0.16
115 0.14
116 0.12
117 0.11
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.13
122 0.14
123 0.16
124 0.17
125 0.16
126 0.2
127 0.21
128 0.22
129 0.19
130 0.19
131 0.2
132 0.23
133 0.26
134 0.27
135 0.34
136 0.32
137 0.4
138 0.45
139 0.46
140 0.44
141 0.47
142 0.44
143 0.41
144 0.46
145 0.38
146 0.31
147 0.27
148 0.26
149 0.21
150 0.21
151 0.15
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.09
162 0.11
163 0.18
164 0.2
165 0.22
166 0.22
167 0.22
168 0.23
169 0.22
170 0.24
171 0.2
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.1
179 0.08
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.13
190 0.13
191 0.18
192 0.25
193 0.25
194 0.31
195 0.35
196 0.44
197 0.46
198 0.47
199 0.45
200 0.38
201 0.39
202 0.4
203 0.39
204 0.35
205 0.32
206 0.33
207 0.3
208 0.28
209 0.27
210 0.2
211 0.15
212 0.11
213 0.09
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.1
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.15
240 0.13
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.16
247 0.15
248 0.14
249 0.14
250 0.14
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.09
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.05
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.12
270 0.14
271 0.16
272 0.18
273 0.21
274 0.18
275 0.23
276 0.27
277 0.3
278 0.33
279 0.32
280 0.35
281 0.37
282 0.39
283 0.37
284 0.41
285 0.4
286 0.36
287 0.38
288 0.34
289 0.31
290 0.34
291 0.36
292 0.33
293 0.36
294 0.38
295 0.36
296 0.43
297 0.44
298 0.4
299 0.35
300 0.3
301 0.25
302 0.24
303 0.27
304 0.25
305 0.25
306 0.25
307 0.26
308 0.26
309 0.29
310 0.28
311 0.28
312 0.24
313 0.25
314 0.24
315 0.22
316 0.21
317 0.17
318 0.16
319 0.12
320 0.09
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.15
341 0.15
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.07
349 0.07
350 0.09
351 0.09
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.12
358 0.11
359 0.13
360 0.14
361 0.14
362 0.15
363 0.19
364 0.24
365 0.26
366 0.32
367 0.34
368 0.38
369 0.38
370 0.39
371 0.41
372 0.37
373 0.35
374 0.31
375 0.29
376 0.27
377 0.28
378 0.25
379 0.22
380 0.24
381 0.24
382 0.27
383 0.34
384 0.34
385 0.36
386 0.42
387 0.47
388 0.47
389 0.51
390 0.48
391 0.45
392 0.51
393 0.53
394 0.51
395 0.47
396 0.44
397 0.39
398 0.36
399 0.32
400 0.24
401 0.19
402 0.13
403 0.09
404 0.08
405 0.08
406 0.07
407 0.06
408 0.04
409 0.05
410 0.05
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.07
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.17
424 0.19
425 0.22
426 0.32
427 0.42
428 0.51
429 0.61
430 0.71
431 0.74
432 0.82