Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C5YML3

Protein Details
Accession A0A2C5YML3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
163-182HDPGEKRRGRRDNRHYRDRGBasic
382-401GRQDPGKRPRTCFRKRGEDIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-188EKRRGRRDNRHYRDRGGDRRRD
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MGDARDIGAQMLFTFSADDILCSEETGEPGEVSEALSPKDGAGELKTVVPSKIYIRGLESLHTDDLEAYLRMHCGAAYRIEWIDDTSANLVFGSDPTAREAIESLSSVAITNAKAIAVGELLPAKPFSGRPDISLHVRFALQSDKKRAGSAIRSRYYLLHPEHDPGEKRRGRRDNRHYRDRGGDRRRDDAKRDGSGIYGTPTYEASMYDDVPQSTERRRYSDLEHRSETYVRHNHGKELFRGRPALRDRSASPRRLDDGQEHEGILMTSRSNRLRARSITRRLSTINRAKELFPRRSSDRSGQLSRLENCIGTASLREEDMPNIVTCPDTPPAGVFSIRGLASQRLDRQSDFVIKGQAKSAKELFPDKLGSKNVGKELPEVGRQDPGKRPRTCFRKRGEDIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.1
7 0.13
8 0.13
9 0.11
10 0.13
11 0.11
12 0.12
13 0.14
14 0.14
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.1
19 0.1
20 0.13
21 0.12
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.12
26 0.14
27 0.14
28 0.12
29 0.12
30 0.14
31 0.13
32 0.16
33 0.18
34 0.18
35 0.18
36 0.17
37 0.17
38 0.18
39 0.25
40 0.25
41 0.24
42 0.26
43 0.3
44 0.29
45 0.29
46 0.3
47 0.25
48 0.24
49 0.23
50 0.19
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.12
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.12
63 0.14
64 0.13
65 0.16
66 0.15
67 0.16
68 0.16
69 0.15
70 0.15
71 0.12
72 0.13
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.07
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.12
115 0.19
116 0.19
117 0.21
118 0.25
119 0.28
120 0.32
121 0.34
122 0.3
123 0.23
124 0.23
125 0.21
126 0.18
127 0.24
128 0.24
129 0.27
130 0.32
131 0.37
132 0.37
133 0.38
134 0.38
135 0.34
136 0.38
137 0.41
138 0.45
139 0.41
140 0.42
141 0.42
142 0.43
143 0.41
144 0.39
145 0.32
146 0.27
147 0.26
148 0.27
149 0.28
150 0.29
151 0.3
152 0.26
153 0.34
154 0.34
155 0.36
156 0.44
157 0.52
158 0.57
159 0.65
160 0.72
161 0.74
162 0.79
163 0.86
164 0.8
165 0.74
166 0.74
167 0.71
168 0.7
169 0.68
170 0.66
171 0.58
172 0.62
173 0.65
174 0.59
175 0.55
176 0.53
177 0.5
178 0.44
179 0.43
180 0.36
181 0.3
182 0.27
183 0.23
184 0.16
185 0.11
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.15
202 0.21
203 0.21
204 0.24
205 0.28
206 0.29
207 0.34
208 0.42
209 0.46
210 0.45
211 0.45
212 0.43
213 0.42
214 0.41
215 0.36
216 0.35
217 0.32
218 0.29
219 0.35
220 0.34
221 0.36
222 0.41
223 0.43
224 0.4
225 0.43
226 0.43
227 0.38
228 0.42
229 0.38
230 0.39
231 0.42
232 0.43
233 0.36
234 0.37
235 0.37
236 0.44
237 0.5
238 0.47
239 0.45
240 0.41
241 0.42
242 0.41
243 0.41
244 0.35
245 0.35
246 0.34
247 0.32
248 0.28
249 0.25
250 0.23
251 0.2
252 0.16
253 0.1
254 0.06
255 0.08
256 0.12
257 0.14
258 0.19
259 0.22
260 0.26
261 0.32
262 0.38
263 0.46
264 0.51
265 0.58
266 0.62
267 0.61
268 0.59
269 0.56
270 0.56
271 0.57
272 0.56
273 0.53
274 0.48
275 0.48
276 0.47
277 0.52
278 0.55
279 0.53
280 0.48
281 0.47
282 0.49
283 0.52
284 0.57
285 0.54
286 0.55
287 0.54
288 0.54
289 0.52
290 0.52
291 0.53
292 0.5
293 0.47
294 0.38
295 0.31
296 0.27
297 0.25
298 0.2
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.13
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.14
315 0.14
316 0.12
317 0.12
318 0.13
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.13
323 0.12
324 0.15
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.17
329 0.2
330 0.25
331 0.31
332 0.32
333 0.35
334 0.35
335 0.35
336 0.37
337 0.4
338 0.37
339 0.33
340 0.36
341 0.36
342 0.36
343 0.39
344 0.41
345 0.35
346 0.38
347 0.4
348 0.36
349 0.38
350 0.42
351 0.38
352 0.37
353 0.41
354 0.37
355 0.39
356 0.38
357 0.39
358 0.39
359 0.42
360 0.43
361 0.42
362 0.42
363 0.38
364 0.41
365 0.4
366 0.4
367 0.38
368 0.34
369 0.37
370 0.38
371 0.42
372 0.46
373 0.51
374 0.55
375 0.59
376 0.65
377 0.67
378 0.76
379 0.8
380 0.8
381 0.79
382 0.81