FuNGI

A0A2C6AL66

Protein Details

Accession

A0A2C6AL66

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-36	GGQNGIPRTKKKPNPLRPLRKTPRTVNPLV	Hydrophilic
183-209	APVAKETNPKRPKKQKEEKTTFNRAPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-31	PRTKKKPNPLRPLRKTPRT
40-42	RKP
190-202	NPKRPKKQKEEKT
498-501	KKSK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPGGQNGIPRTKKKPNPLRPLRKTPRTVNPLVATSRKPPAKANRNASPNPQPPHAAFNRTAIDELRKQHGGWSEPPPKYQYSDIPIMTTKRAILAGARYHVLNFRQSGLNDKPIDPTDQDTFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKMDESETPQVDEKEIERQAQMKAEREAQRAIDQAKIAPVAKETNPKRPKKQKEEKTTFNRAPKSEAAKRESDIRYEEALPWHLEDADGKNVWIGTYVAALSEANVAFMIDKSVFRMIPLEKWYKFMAKPPFQPFTIDEAEAFMNKKMDVGRWVMKDEERKAGQNDLEATRRLLYGRGQMVKTESDTFKAASRLEKLDHDELDMSGDEFQDDDEAPNFERNDDEDAKESKDRIRREQLGANLFGDGNEQEVDKELQEQLREELERQKYGKATKKALIKRDREDIYESDNSEDKPWSSSSDEDSSDEEDENKEEDKKESEAKDGTTETKDKSKAAAAKGATTPQGKQKQGDLLKKSKSLKRAGSPALSEEPG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.66
3	0.72
4	0.75
5	0.78
6	0.79
7	0.83
8	0.89
9	0.92
10	0.91
11	0.94
12	0.94
13	0.93
14	0.9
15	0.88
16	0.87
17	0.84
18	0.78
19	0.75
20	0.69
21	0.64
22	0.61
23	0.57
24	0.5
25	0.46
26	0.52
27	0.48
28	0.45
29	0.49
30	0.55
31	0.6
32	0.66
33	0.7
34	0.7
35	0.75
36	0.76
37	0.75
38	0.75
39	0.73
40	0.68
41	0.62
42	0.57
43	0.5
44	0.55
45	0.51
46	0.47
47	0.4
48	0.41
49	0.41
50	0.38
51	0.38
52	0.31
53	0.33
54	0.32
55	0.35
56	0.35
57	0.33
58	0.32
59	0.35
60	0.39
61	0.37
62	0.37
63	0.43
64	0.47
65	0.47
66	0.5
67	0.49
68	0.45
69	0.44
70	0.43
71	0.39
72	0.35
73	0.4
74	0.37
75	0.36
76	0.38
77	0.37
78	0.34
79	0.29
80	0.23
81	0.19
82	0.19
83	0.16
84	0.15
85	0.19
86	0.21
87	0.22
88	0.23
89	0.21
90	0.22
91	0.25
92	0.25
93	0.23
94	0.2
95	0.21
96	0.24
97	0.24
98	0.3
99	0.3
100	0.36
101	0.34
102	0.34
103	0.35
104	0.32
105	0.35
106	0.29
107	0.29
108	0.24
109	0.25
110	0.25
111	0.24
112	0.24
113	0.22
114	0.22
115	0.18
116	0.22
117	0.29
118	0.34
119	0.39
120	0.41
121	0.47
122	0.53
123	0.62
124	0.63
125	0.63
126	0.61
127	0.6
128	0.65
129	0.63
130	0.58
131	0.52
132	0.5
133	0.45
134	0.43
135	0.39
136	0.32
137	0.32
138	0.33
139	0.31
140	0.27
141	0.24
142	0.21
143	0.2
144	0.19
145	0.15
146	0.19
147	0.2
148	0.2
149	0.19
150	0.21
151	0.21
152	0.26
153	0.28
154	0.24
155	0.25
156	0.32
157	0.36
158	0.36
159	0.37
160	0.33
161	0.32
162	0.32
163	0.31
164	0.25
165	0.2
166	0.18
167	0.17
168	0.17
169	0.16
170	0.13
171	0.13
172	0.14
173	0.16
174	0.25
175	0.26
176	0.35
177	0.44
178	0.51
179	0.6
180	0.67
181	0.75
182	0.77
183	0.85
184	0.85
185	0.87
186	0.89
187	0.88
188	0.86
189	0.85
190	0.8
191	0.76
192	0.71
193	0.61
194	0.57
195	0.52
196	0.51
197	0.48
198	0.48
199	0.45
200	0.42
201	0.42
202	0.46
203	0.41
204	0.36
205	0.32
206	0.28
207	0.26
208	0.25
209	0.26
210	0.19
211	0.19
212	0.17
213	0.15
214	0.13
215	0.1
216	0.09
217	0.09
218	0.1
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.09
226	0.07
227	0.04
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.06
242	0.04
243	0.05
244	0.06
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.1
249	0.1
250	0.13
251	0.18
252	0.22
253	0.21
254	0.24
255	0.25
256	0.26
257	0.26
258	0.3
259	0.34
260	0.34
261	0.41
262	0.44
263	0.46
264	0.42
265	0.44
266	0.39
267	0.35
268	0.32
269	0.25
270	0.19
271	0.18
272	0.17
273	0.16
274	0.15
275	0.1
276	0.08
277	0.08
278	0.1
279	0.09
280	0.1
281	0.12
282	0.15
283	0.2
284	0.2
285	0.22
286	0.22
287	0.24
288	0.29
289	0.29
290	0.31
291	0.28
292	0.29
293	0.29
294	0.31
295	0.28
296	0.25
297	0.25
298	0.21
299	0.22
300	0.2
301	0.2
302	0.17
303	0.17
304	0.15
305	0.14
306	0.13
307	0.17
308	0.21
309	0.25
310	0.24
311	0.25
312	0.26
313	0.26
314	0.26
315	0.24
316	0.2
317	0.17
318	0.18
319	0.18
320	0.18
321	0.2
322	0.19
323	0.17
324	0.2
325	0.2
326	0.21
327	0.23
328	0.26
329	0.27
330	0.26
331	0.24
332	0.22
333	0.19
334	0.19
335	0.16
336	0.11
337	0.09
338	0.08
339	0.07
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.09
348	0.13
349	0.13
350	0.12
351	0.13
352	0.13
353	0.19
354	0.2
355	0.21
356	0.21
357	0.23
358	0.26
359	0.27
360	0.27
361	0.27
362	0.31
363	0.35
364	0.39
365	0.47
366	0.49
367	0.52
368	0.56
369	0.57
370	0.55
371	0.52
372	0.44
373	0.35
374	0.29
375	0.24
376	0.2
377	0.13
378	0.09
379	0.08
380	0.08
381	0.07
382	0.09
383	0.1
384	0.09
385	0.11
386	0.12
387	0.14
388	0.15
389	0.16
390	0.16
391	0.19
392	0.2
393	0.2
394	0.27
395	0.29
396	0.33
397	0.33
398	0.35
399	0.36
400	0.43
401	0.51
402	0.5
403	0.51
404	0.52
405	0.61
406	0.64
407	0.69
408	0.71
409	0.69
410	0.67
411	0.7
412	0.67
413	0.6
414	0.57
415	0.5
416	0.47
417	0.43
418	0.38
419	0.32
420	0.32
421	0.3
422	0.27
423	0.27
424	0.21
425	0.19
426	0.19
427	0.2
428	0.2
429	0.22
430	0.25
431	0.28
432	0.28
433	0.27
434	0.28
435	0.27
436	0.26
437	0.24
438	0.2
439	0.17
440	0.17
441	0.17
442	0.17
443	0.18
444	0.18
445	0.21
446	0.23
447	0.26
448	0.32
449	0.32
450	0.36
451	0.35
452	0.35
453	0.37
454	0.36
455	0.36
456	0.34
457	0.36
458	0.33
459	0.38
460	0.39
461	0.35
462	0.36
463	0.4
464	0.41
465	0.41
466	0.45
467	0.38
468	0.41
469	0.43
470	0.43
471	0.41
472	0.37
473	0.36
474	0.39
475	0.47
476	0.45
477	0.45
478	0.47
479	0.52
480	0.58
481	0.64
482	0.63
483	0.63
484	0.66
485	0.71
486	0.74
487	0.71
488	0.7
489	0.7
490	0.7
491	0.7
492	0.73
493	0.73
494	0.7
495	0.66
496	0.63

A0A2C6AL66

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer