Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4PGU6

Protein Details
Accession Q4PGU6    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-322IRLMWGRSRPVKRNEENECKKAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.833, cyto_mito 5.166, mito 4.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0036002  F:pre-mRNA binding  
GO:0017070  F:U6 snRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG uma:UMAG_00667  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSSLTEDLETPILCESCLGPNPYIRMTKDPRGKSCKVCTRPFTVFRWNPGAGSRFKKTEICATCAKVKNVCQTCILDLQYGLPVQVRDAALGIKSDAGPTSSDKAKAYFADTMEKQLEATVGSSSRAGQELVRKAARREIDYKRDRPVQSQKLCSAFARGRCERGDSCPFKHQLPTDDQLPGLQPSSNINYPYSPTSSSPSKQAVAKILTSSTSSVGLPPPSDASVRSLFISNLPPEHLEEPSIRQFFLDLAPPLQAQDIKSITLVRASNCAFVNFATRDHAELAARRCEPKMRLGDKEIRLMWGRSRPVKRNEENECKKAEVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.16
4 0.21
5 0.24
6 0.23
7 0.26
8 0.3
9 0.34
10 0.38
11 0.35
12 0.39
13 0.43
14 0.51
15 0.57
16 0.62
17 0.66
18 0.7
19 0.74
20 0.73
21 0.77
22 0.78
23 0.77
24 0.77
25 0.73
26 0.73
27 0.74
28 0.71
29 0.66
30 0.67
31 0.62
32 0.59
33 0.61
34 0.53
35 0.46
36 0.45
37 0.44
38 0.39
39 0.41
40 0.4
41 0.36
42 0.38
43 0.4
44 0.38
45 0.43
46 0.41
47 0.39
48 0.4
49 0.41
50 0.47
51 0.5
52 0.5
53 0.46
54 0.47
55 0.52
56 0.52
57 0.5
58 0.44
59 0.41
60 0.4
61 0.39
62 0.35
63 0.26
64 0.21
65 0.2
66 0.18
67 0.16
68 0.14
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.13
73 0.12
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.11
79 0.1
80 0.08
81 0.07
82 0.08
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.1
87 0.14
88 0.15
89 0.17
90 0.17
91 0.19
92 0.2
93 0.19
94 0.2
95 0.19
96 0.18
97 0.23
98 0.22
99 0.24
100 0.23
101 0.22
102 0.19
103 0.16
104 0.15
105 0.09
106 0.1
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.15
117 0.18
118 0.22
119 0.25
120 0.26
121 0.26
122 0.3
123 0.31
124 0.29
125 0.33
126 0.35
127 0.43
128 0.49
129 0.52
130 0.52
131 0.57
132 0.55
133 0.55
134 0.58
135 0.57
136 0.55
137 0.56
138 0.54
139 0.48
140 0.49
141 0.41
142 0.36
143 0.3
144 0.29
145 0.32
146 0.3
147 0.3
148 0.29
149 0.33
150 0.29
151 0.31
152 0.36
153 0.32
154 0.34
155 0.37
156 0.39
157 0.36
158 0.38
159 0.34
160 0.29
161 0.3
162 0.29
163 0.25
164 0.24
165 0.23
166 0.2
167 0.19
168 0.16
169 0.12
170 0.09
171 0.07
172 0.09
173 0.13
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.16
179 0.18
180 0.18
181 0.16
182 0.15
183 0.18
184 0.22
185 0.22
186 0.25
187 0.25
188 0.26
189 0.26
190 0.27
191 0.28
192 0.26
193 0.26
194 0.22
195 0.2
196 0.18
197 0.17
198 0.16
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.14
212 0.15
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.16
218 0.2
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.16
223 0.18
224 0.19
225 0.18
226 0.15
227 0.15
228 0.19
229 0.25
230 0.25
231 0.22
232 0.21
233 0.21
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.13
238 0.13
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.16
243 0.16
244 0.12
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.16
251 0.2
252 0.21
253 0.16
254 0.21
255 0.22
256 0.25
257 0.25
258 0.25
259 0.2
260 0.19
261 0.24
262 0.2
263 0.2
264 0.2
265 0.2
266 0.21
267 0.22
268 0.23
269 0.2
270 0.24
271 0.28
272 0.3
273 0.32
274 0.33
275 0.33
276 0.38
277 0.38
278 0.41
279 0.47
280 0.46
281 0.5
282 0.56
283 0.63
284 0.6
285 0.65
286 0.57
287 0.51
288 0.49
289 0.45
290 0.44
291 0.43
292 0.47
293 0.49
294 0.57
295 0.62
296 0.68
297 0.76
298 0.78
299 0.79
300 0.82
301 0.83
302 0.84
303 0.8
304 0.75