Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4PGT8

Protein Details
Accession Q4PGT8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-66GGPSSKRTTPTKPKKQATPKKKPDTTPTRIMPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-57TPTKPKKQATPKKKP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:2000001  P:regulation of DNA damage checkpoint  
KEGG uma:UMAG_00675  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MIESNDYEQERLKNIRENERLMKELGVMGGSSTIGGPSSKRTTPTKPKKQATPKKKPDTTPTRIMPSRSSARLAGHEADSETLKRKYEEEAEEARKVAEAAKRARHQPFDLSGMTGGELEEEAIMALESTLQGLANNTSSAAELVDTKDENKRRSANKPDPQFSTERRELEDILNKMTLKSAAKVTPKRIYSMAYHPSTDKDLVFVGDKEGSIGVWDAAPVAFASNRNGVKTADDQDEDAEERFPEGKAWTLQVHARSPVTCIKFDPVNHNSVLSSSYDSTVRKLDLATAKSEEIWAGEEDVLLSIFDVLSPSTHPSVYMDTPNPSLDERSMWIADHRGGLLHIDLRERTRRGNNTRRWQVCEKKIGAMSVNRLAPHCIATASLDQHIRLFDVRALASVVKQTADAPYNYKGVDADDLESAQTKAQFASSKARQACTSVDFSPRGDQLVGVSYDDVVKVWSMEPGSLFSEHGLKNRIATAKSNKPKGAVKKQVPDSASDTGPGLLSWLSRATPLGTKKDVAEAIKQEQDAPSPSLSKRPDDVLANPTRIPHNNQTGKWLTLFRAKWNQNALLEPHFTIGSMSRRAEVYAADGTLLRSLWDENLVTAVPAVTCMHPVLPARLVTGNASGRCTFWSPDP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.54
3 0.57
4 0.61
5 0.64
6 0.64
7 0.63
8 0.56
9 0.49
10 0.4
11 0.35
12 0.28
13 0.19
14 0.14
15 0.11
16 0.1
17 0.09
18 0.08
19 0.07
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.08
24 0.14
25 0.2
26 0.23
27 0.28
28 0.34
29 0.44
30 0.55
31 0.65
32 0.7
33 0.74
34 0.8
35 0.86
36 0.91
37 0.92
38 0.92
39 0.92
40 0.92
41 0.92
42 0.92
43 0.88
44 0.87
45 0.87
46 0.83
47 0.81
48 0.76
49 0.74
50 0.7
51 0.67
52 0.6
53 0.57
54 0.56
55 0.5
56 0.47
57 0.41
58 0.4
59 0.4
60 0.41
61 0.36
62 0.3
63 0.28
64 0.26
65 0.24
66 0.23
67 0.22
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.22
72 0.23
73 0.27
74 0.32
75 0.35
76 0.36
77 0.42
78 0.46
79 0.46
80 0.45
81 0.4
82 0.32
83 0.28
84 0.26
85 0.21
86 0.23
87 0.29
88 0.37
89 0.42
90 0.5
91 0.56
92 0.56
93 0.55
94 0.54
95 0.51
96 0.47
97 0.43
98 0.37
99 0.31
100 0.26
101 0.23
102 0.17
103 0.12
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.1
133 0.1
134 0.12
135 0.2
136 0.25
137 0.27
138 0.32
139 0.39
140 0.43
141 0.52
142 0.61
143 0.64
144 0.67
145 0.74
146 0.73
147 0.7
148 0.68
149 0.64
150 0.58
151 0.56
152 0.53
153 0.46
154 0.43
155 0.4
156 0.38
157 0.38
158 0.4
159 0.33
160 0.29
161 0.3
162 0.27
163 0.25
164 0.24
165 0.22
166 0.16
167 0.17
168 0.19
169 0.22
170 0.31
171 0.36
172 0.42
173 0.46
174 0.46
175 0.46
176 0.43
177 0.4
178 0.36
179 0.39
180 0.4
181 0.35
182 0.35
183 0.33
184 0.33
185 0.34
186 0.31
187 0.23
188 0.16
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.05
202 0.04
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.06
211 0.09
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.17
217 0.18
218 0.21
219 0.23
220 0.2
221 0.2
222 0.19
223 0.18
224 0.19
225 0.18
226 0.15
227 0.11
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.1
235 0.11
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.16
240 0.18
241 0.19
242 0.18
243 0.19
244 0.17
245 0.19
246 0.24
247 0.23
248 0.21
249 0.2
250 0.21
251 0.23
252 0.25
253 0.3
254 0.26
255 0.27
256 0.26
257 0.26
258 0.23
259 0.2
260 0.2
261 0.12
262 0.11
263 0.09
264 0.1
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.12
271 0.11
272 0.15
273 0.18
274 0.18
275 0.19
276 0.19
277 0.19
278 0.18
279 0.18
280 0.14
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.04
291 0.04
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.04
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.11
305 0.12
306 0.14
307 0.13
308 0.14
309 0.15
310 0.16
311 0.15
312 0.13
313 0.12
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.12
334 0.17
335 0.18
336 0.22
337 0.27
338 0.35
339 0.43
340 0.53
341 0.59
342 0.65
343 0.73
344 0.72
345 0.72
346 0.71
347 0.71
348 0.67
349 0.66
350 0.57
351 0.51
352 0.49
353 0.43
354 0.38
355 0.31
356 0.28
357 0.24
358 0.24
359 0.21
360 0.2
361 0.2
362 0.18
363 0.17
364 0.14
365 0.1
366 0.09
367 0.1
368 0.12
369 0.12
370 0.14
371 0.13
372 0.13
373 0.14
374 0.14
375 0.12
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.1
391 0.12
392 0.12
393 0.14
394 0.16
395 0.17
396 0.17
397 0.16
398 0.14
399 0.13
400 0.14
401 0.12
402 0.11
403 0.1
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.1
413 0.12
414 0.13
415 0.22
416 0.24
417 0.31
418 0.33
419 0.34
420 0.32
421 0.32
422 0.33
423 0.27
424 0.28
425 0.23
426 0.26
427 0.25
428 0.26
429 0.27
430 0.25
431 0.23
432 0.19
433 0.16
434 0.13
435 0.15
436 0.15
437 0.11
438 0.11
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.09
443 0.06
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.09
451 0.1
452 0.12
453 0.12
454 0.12
455 0.11
456 0.17
457 0.17
458 0.2
459 0.21
460 0.19
461 0.2
462 0.24
463 0.27
464 0.23
465 0.29
466 0.34
467 0.42
468 0.5
469 0.55
470 0.52
471 0.53
472 0.59
473 0.63
474 0.65
475 0.65
476 0.65
477 0.67
478 0.72
479 0.73
480 0.66
481 0.6
482 0.54
483 0.47
484 0.39
485 0.31
486 0.25
487 0.2
488 0.19
489 0.15
490 0.1
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.11
499 0.17
500 0.22
501 0.27
502 0.28
503 0.29
504 0.29
505 0.34
506 0.35
507 0.31
508 0.32
509 0.31
510 0.33
511 0.35
512 0.35
513 0.31
514 0.28
515 0.29
516 0.26
517 0.24
518 0.21
519 0.22
520 0.22
521 0.29
522 0.31
523 0.32
524 0.31
525 0.32
526 0.34
527 0.34
528 0.37
529 0.38
530 0.41
531 0.4
532 0.38
533 0.37
534 0.38
535 0.38
536 0.41
537 0.41
538 0.46
539 0.51
540 0.51
541 0.56
542 0.55
543 0.53
544 0.49
545 0.43
546 0.35
547 0.37
548 0.38
549 0.38
550 0.45
551 0.46
552 0.49
553 0.53
554 0.55
555 0.48
556 0.5
557 0.46
558 0.4
559 0.4
560 0.34
561 0.29
562 0.24
563 0.21
564 0.19
565 0.19
566 0.2
567 0.23
568 0.24
569 0.24
570 0.25
571 0.25
572 0.25
573 0.21
574 0.19
575 0.17
576 0.16
577 0.15
578 0.15
579 0.15
580 0.15
581 0.14
582 0.11
583 0.09
584 0.1
585 0.11
586 0.13
587 0.13
588 0.12
589 0.14
590 0.13
591 0.12
592 0.12
593 0.11
594 0.08
595 0.09
596 0.1
597 0.09
598 0.11
599 0.12
600 0.12
601 0.15
602 0.17
603 0.2
604 0.22
605 0.22
606 0.23
607 0.24
608 0.25
609 0.23
610 0.28
611 0.3
612 0.28
613 0.31
614 0.29
615 0.28
616 0.3
617 0.32