Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2C6AJ42

Protein Details
Accession A0A2C6AJ42    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-131WEWVDERMDRRKRQREEREQAEREEAcidic
167-186LTGKNRRSKQALRSQRRFYAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9.5cyto_mito 9.5, cyto 8.5, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13428  TPR_14  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MTSRRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPARDGPSEDQIKEALAKRAAQLGIAPEGKDGKKGKDEDGDDDDEARYQDPDNEVGLFAGGVYDKDDEEADRIWEWVDERMDRRKRQREEREQAEREEYERNNPKIQQQFSDLKRALSTVTDDEWASLPEVGDLTGKNRRSKQALRSQRRFYAVPDSVLAAARDSTEMGTTVADDGVASGPGDAGDGTMTNFAEIGAARDKVLKSRLEQASQAAGAETGSATSIDPQGYITSLNKMQMNGAQAQVGDINRVRELLQSVVKTNPSNALGWIAAARLEELAGKIVAARKTIDKGCSQCPKSEDAWLENIRLNHESANAKVIARRAIESNPRSVRLWVEAMKLENMTSNKKRVVRQALDHVPESEALWKEAVNLEEDPNDARLMLAKATELIPLSVDLWLALARLETPEKAQLVLNKARKAIPTSHEIWIAGGRLLEQRGLSDKANVIKRAVQILTRESAMPARIEWIAAAEKCEEEGAPVTCQNIIHETLGWNLDESSDLKTTWKEDAKASINRGKYETARAIYAYALRVFVNSKSTWMEAADLERNHGSRASLWQLLEKAVEACPASEELWMMLAKEKWQSGEVDGARLVLKRAFQNNPDNENIWLSAVKLESENGDVEQARQLLLVARDKAPTDRVWMKSVVFERVQGLPEAALDMVLQALVLFPAAAKLWMLKGQIYEDLGQTAQARQAYAAGVKAVPKSVPLWLLLARLEERSGATVKARSVLDRARLAAPRSGELWCESVRLERRAGNLAQARAMMARAQHEVPKSGLLWVEQIWQLEARTQRKPRSLEAIKKVDNDPLLFVGVARIFWADRKLDKAQNWFEKALVLDPDRGDSWAWYYRFLCQHGTDDKRHEVVNKCLQVEPRHGEHWQAVAKDPRNAGKRSDEILKLVAANLEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.33
3 0.28
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.36
40 0.35
41 0.29
42 0.27
43 0.23
44 0.27
45 0.27
46 0.26
47 0.21
48 0.27
49 0.27
50 0.32
51 0.33
52 0.32
53 0.38
54 0.41
55 0.44
56 0.47
57 0.5
58 0.49
59 0.51
60 0.49
61 0.42
62 0.4
63 0.35
64 0.28
65 0.26
66 0.2
67 0.15
68 0.12
69 0.15
70 0.16
71 0.18
72 0.18
73 0.18
74 0.17
75 0.16
76 0.15
77 0.11
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.05
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.16
97 0.18
98 0.21
99 0.25
100 0.36
101 0.44
102 0.52
103 0.62
104 0.67
105 0.73
106 0.8
107 0.86
108 0.88
109 0.89
110 0.9
111 0.9
112 0.84
113 0.78
114 0.73
115 0.63
116 0.53
117 0.51
118 0.42
119 0.41
120 0.47
121 0.47
122 0.47
123 0.48
124 0.54
125 0.55
126 0.57
127 0.5
128 0.48
129 0.53
130 0.5
131 0.58
132 0.51
133 0.43
134 0.4
135 0.37
136 0.31
137 0.24
138 0.24
139 0.17
140 0.18
141 0.18
142 0.17
143 0.18
144 0.18
145 0.17
146 0.14
147 0.12
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.12
155 0.19
156 0.23
157 0.3
158 0.35
159 0.41
160 0.48
161 0.55
162 0.61
163 0.65
164 0.71
165 0.75
166 0.79
167 0.8
168 0.78
169 0.75
170 0.66
171 0.59
172 0.58
173 0.49
174 0.42
175 0.36
176 0.31
177 0.27
178 0.27
179 0.24
180 0.14
181 0.12
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.08
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.15
220 0.15
221 0.18
222 0.23
223 0.23
224 0.22
225 0.32
226 0.36
227 0.35
228 0.36
229 0.34
230 0.32
231 0.3
232 0.27
233 0.17
234 0.13
235 0.1
236 0.09
237 0.07
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.09
251 0.12
252 0.13
253 0.16
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.18
258 0.2
259 0.18
260 0.17
261 0.15
262 0.13
263 0.13
264 0.15
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.14
274 0.14
275 0.17
276 0.17
277 0.18
278 0.2
279 0.22
280 0.21
281 0.21
282 0.21
283 0.19
284 0.18
285 0.17
286 0.16
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.09
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.06
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.14
307 0.19
308 0.22
309 0.23
310 0.23
311 0.26
312 0.33
313 0.41
314 0.41
315 0.4
316 0.4
317 0.41
318 0.38
319 0.4
320 0.35
321 0.27
322 0.32
323 0.3
324 0.3
325 0.28
326 0.27
327 0.24
328 0.22
329 0.21
330 0.14
331 0.17
332 0.17
333 0.15
334 0.17
335 0.16
336 0.15
337 0.16
338 0.17
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.2
344 0.28
345 0.28
346 0.35
347 0.33
348 0.35
349 0.35
350 0.34
351 0.3
352 0.25
353 0.26
354 0.2
355 0.2
356 0.19
357 0.19
358 0.19
359 0.18
360 0.15
361 0.15
362 0.15
363 0.2
364 0.21
365 0.24
366 0.29
367 0.33
368 0.36
369 0.41
370 0.49
371 0.46
372 0.47
373 0.52
374 0.53
375 0.51
376 0.49
377 0.41
378 0.32
379 0.28
380 0.24
381 0.19
382 0.14
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.12
388 0.12
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.11
395 0.09
396 0.09
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.11
429 0.13
430 0.18
431 0.25
432 0.28
433 0.28
434 0.29
435 0.3
436 0.3
437 0.3
438 0.29
439 0.24
440 0.24
441 0.26
442 0.26
443 0.25
444 0.24
445 0.21
446 0.18
447 0.16
448 0.11
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.09
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.13
461 0.18
462 0.21
463 0.21
464 0.2
465 0.21
466 0.21
467 0.23
468 0.22
469 0.18
470 0.17
471 0.18
472 0.18
473 0.15
474 0.14
475 0.12
476 0.12
477 0.11
478 0.1
479 0.08
480 0.09
481 0.08
482 0.08
483 0.07
484 0.08
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.08
489 0.08
490 0.08
491 0.09
492 0.07
493 0.05
494 0.07
495 0.07
496 0.08
497 0.08
498 0.09
499 0.09
500 0.1
501 0.09
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.09
506 0.1
507 0.1
508 0.11
509 0.1
510 0.08
511 0.07
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.1
519 0.11
520 0.12
521 0.16
522 0.18
523 0.17
524 0.18
525 0.24
526 0.29
527 0.32
528 0.34
529 0.35
530 0.34
531 0.34
532 0.34
533 0.31
534 0.26
535 0.28
536 0.27
537 0.23
538 0.21
539 0.2
540 0.19
541 0.17
542 0.17
543 0.14
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.1
548 0.1
549 0.11
550 0.13
551 0.11
552 0.13
553 0.13
554 0.14
555 0.14
556 0.13
557 0.13
558 0.1
559 0.13
560 0.16
561 0.14
562 0.16
563 0.16
564 0.16
565 0.16
566 0.16
567 0.13
568 0.1
569 0.14
570 0.15
571 0.17
572 0.17
573 0.18
574 0.19
575 0.19
576 0.18
577 0.14
578 0.12
579 0.09
580 0.11
581 0.09
582 0.08
583 0.08
584 0.09
585 0.09
586 0.08
587 0.08
588 0.06
589 0.08
590 0.08
591 0.07
592 0.09
593 0.09
594 0.1
595 0.13
596 0.13
597 0.13
598 0.14
599 0.15
600 0.13
601 0.2
602 0.19
603 0.18
604 0.17
605 0.17
606 0.17
607 0.16
608 0.16
609 0.1
610 0.12
611 0.15
612 0.21
613 0.24
614 0.29
615 0.38
616 0.42
617 0.45
618 0.44
619 0.41
620 0.36
621 0.34
622 0.29
623 0.2
624 0.15
625 0.11
626 0.11
627 0.1
628 0.09
629 0.08
630 0.09
631 0.09
632 0.1
633 0.1
634 0.08
635 0.1
636 0.1
637 0.1
638 0.12
639 0.12
640 0.1
641 0.09
642 0.09
643 0.11
644 0.13
645 0.17
646 0.17
647 0.18
648 0.19
649 0.2
650 0.22
651 0.22
652 0.2
653 0.22
654 0.27
655 0.28
656 0.3
657 0.31
658 0.3
659 0.32
660 0.34
661 0.32
662 0.25
663 0.24
664 0.23
665 0.24
666 0.24
667 0.19
668 0.17
669 0.12
670 0.11
671 0.11
672 0.08
673 0.06
674 0.05
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.03
679 0.02
680 0.03
681 0.02
682 0.03
683 0.02
684 0.02
685 0.03
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.05
690 0.07
691 0.1
692 0.11
693 0.11
694 0.12
695 0.14
696 0.16
697 0.17
698 0.16
699 0.14
700 0.14
701 0.13
702 0.13
703 0.12
704 0.12
705 0.13
706 0.12
707 0.12
708 0.11
709 0.12
710 0.12
711 0.12
712 0.12
713 0.1
714 0.1
715 0.12
716 0.13
717 0.13
718 0.12
719 0.13
720 0.13
721 0.15
722 0.15
723 0.14
724 0.15
725 0.15
726 0.17
727 0.16
728 0.17
729 0.16
730 0.15
731 0.15
732 0.13
733 0.12
734 0.13
735 0.14
736 0.13
737 0.15
738 0.17
739 0.17
740 0.21
741 0.21
742 0.2
743 0.24
744 0.28
745 0.31
746 0.31
747 0.33
748 0.33
749 0.36
750 0.37
751 0.36
752 0.33
753 0.28
754 0.27
755 0.25
756 0.22
757 0.2
758 0.21
759 0.17
760 0.17
761 0.15
762 0.21
763 0.27
764 0.28
765 0.29
766 0.29
767 0.32
768 0.37
769 0.37
770 0.37
771 0.37
772 0.35
773 0.33
774 0.3
775 0.28
776 0.23
777 0.23
778 0.16
779 0.12
780 0.14
781 0.16
782 0.18
783 0.21
784 0.22
785 0.24
786 0.24
787 0.24
788 0.22
789 0.21
790 0.2
791 0.17
792 0.17
793 0.15
794 0.18
795 0.17
796 0.17
797 0.16
798 0.16
799 0.16
800 0.19
801 0.26
802 0.27
803 0.35
804 0.43
805 0.49
806 0.56
807 0.6
808 0.6
809 0.64
810 0.68
811 0.69
812 0.7
813 0.72
814 0.68
815 0.68
816 0.65
817 0.59
818 0.53
819 0.44
820 0.36
821 0.28
822 0.25
823 0.2
824 0.19
825 0.17
826 0.14
827 0.13
828 0.11
829 0.11
830 0.1
831 0.13
832 0.17
833 0.17
834 0.19
835 0.26
836 0.32
837 0.38
838 0.43
839 0.5
840 0.56
841 0.61
842 0.64
843 0.58
844 0.52
845 0.47
846 0.43
847 0.37
848 0.33
849 0.26
850 0.25
851 0.24
852 0.27
853 0.25
854 0.26
855 0.22
856 0.18
857 0.21
858 0.24
859 0.24
860 0.26
861 0.26
862 0.32
863 0.37
864 0.39
865 0.39
866 0.33
867 0.4
868 0.45
869 0.5
870 0.49
871 0.51
872 0.54
873 0.51
874 0.51
875 0.51
876 0.48
877 0.51
878 0.55
879 0.54
880 0.51
881 0.53
882 0.57
883 0.55
884 0.57
885 0.53
886 0.48
887 0.46
888 0.45
889 0.44
890 0.41
891 0.42
892 0.39
893 0.34
894 0.36
895 0.41
896 0.45
897 0.47
898 0.49
899 0.51
900 0.53
901 0.54
902 0.52
903 0.51
904 0.52
905 0.51
906 0.54
907 0.48
908 0.44
909 0.44
910 0.4
911 0.32
912 0.28