Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8M5P9

Protein Details
Accession B8M5P9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-310YIKPQEEKGKRERQRKEKNFLEVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-126PAQRHGKRDAPKEAPSAPPTAPRGGARGGRGGR
293-304EKGKRERQRKEK
317-348PRGRGNGPRGGGRGGRGRGGRGDGPRREGGRG
Subcellular Location(s) extr 17, E.R. 4, golg 2, mito 1, cyto 1, pero 1, vacu 1, cyto_mito 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADVRSKVRCDFTSLFIAVLHQLLIATDVLLDRICTSFSVLSSSLPKQAAYFVSRLHHPRKFLTSSSFSCDIGNDPELDSDREPEPPTKTIDKPAQRHGKRDAPKEAPSAPPTAPRGGARGGRGGRGNGNDDAFRDRNAGSYNNRNRPVDEVKEAGRRGFRGRDDRGARTRTDRHPVRTAHTDTEKQVGQGWGAKKGDAEWNDEKAGEAIAKAEENEPQTPLEGGELAAAEEAADKAKSYAEYLAEQAATKRGELGVKEARAPNEGSKDKKWQNAKELKRDGDEEAYIKPQEEKGKRERQRKEKNFLEVDMRFVEQPRGRGNGPRGGGRGGRGRGGRGDGPRREGGRGGASAGPTVQVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.3
4 0.3
5 0.23
6 0.2
7 0.15
8 0.08
9 0.08
10 0.07
11 0.08
12 0.07
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.11
24 0.12
25 0.12
26 0.16
27 0.15
28 0.17
29 0.22
30 0.23
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.21
35 0.24
36 0.26
37 0.24
38 0.24
39 0.22
40 0.24
41 0.3
42 0.37
43 0.42
44 0.42
45 0.42
46 0.46
47 0.5
48 0.51
49 0.48
50 0.49
51 0.47
52 0.46
53 0.49
54 0.46
55 0.39
56 0.35
57 0.32
58 0.27
59 0.24
60 0.23
61 0.16
62 0.15
63 0.16
64 0.18
65 0.19
66 0.17
67 0.16
68 0.16
69 0.19
70 0.2
71 0.23
72 0.25
73 0.25
74 0.29
75 0.32
76 0.34
77 0.38
78 0.45
79 0.5
80 0.51
81 0.58
82 0.64
83 0.61
84 0.65
85 0.64
86 0.65
87 0.64
88 0.66
89 0.65
90 0.6
91 0.61
92 0.6
93 0.56
94 0.51
95 0.46
96 0.42
97 0.34
98 0.33
99 0.32
100 0.29
101 0.28
102 0.24
103 0.24
104 0.24
105 0.27
106 0.23
107 0.27
108 0.26
109 0.27
110 0.28
111 0.27
112 0.26
113 0.25
114 0.27
115 0.22
116 0.22
117 0.19
118 0.19
119 0.24
120 0.21
121 0.19
122 0.18
123 0.16
124 0.17
125 0.18
126 0.21
127 0.2
128 0.29
129 0.38
130 0.44
131 0.48
132 0.47
133 0.45
134 0.47
135 0.49
136 0.42
137 0.36
138 0.3
139 0.3
140 0.34
141 0.34
142 0.3
143 0.26
144 0.24
145 0.25
146 0.27
147 0.29
148 0.31
149 0.34
150 0.41
151 0.44
152 0.48
153 0.51
154 0.48
155 0.45
156 0.43
157 0.46
158 0.42
159 0.48
160 0.46
161 0.45
162 0.5
163 0.5
164 0.48
165 0.49
166 0.47
167 0.41
168 0.4
169 0.37
170 0.31
171 0.33
172 0.28
173 0.22
174 0.21
175 0.17
176 0.14
177 0.16
178 0.16
179 0.18
180 0.18
181 0.18
182 0.15
183 0.17
184 0.21
185 0.18
186 0.24
187 0.21
188 0.23
189 0.23
190 0.23
191 0.22
192 0.17
193 0.16
194 0.09
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.09
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.09
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.14
236 0.13
237 0.12
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.19
243 0.21
244 0.22
245 0.26
246 0.28
247 0.28
248 0.28
249 0.29
250 0.27
251 0.29
252 0.33
253 0.34
254 0.35
255 0.44
256 0.47
257 0.53
258 0.58
259 0.56
260 0.62
261 0.67
262 0.71
263 0.72
264 0.74
265 0.7
266 0.64
267 0.6
268 0.52
269 0.45
270 0.39
271 0.3
272 0.24
273 0.25
274 0.22
275 0.2
276 0.19
277 0.2
278 0.28
279 0.32
280 0.37
281 0.44
282 0.54
283 0.63
284 0.71
285 0.77
286 0.79
287 0.85
288 0.87
289 0.87
290 0.84
291 0.85
292 0.78
293 0.71
294 0.68
295 0.57
296 0.51
297 0.43
298 0.37
299 0.29
300 0.26
301 0.32
302 0.26
303 0.29
304 0.3
305 0.32
306 0.32
307 0.39
308 0.43
309 0.42
310 0.42
311 0.43
312 0.41
313 0.4
314 0.41
315 0.38
316 0.41
317 0.35
318 0.39
319 0.35
320 0.36
321 0.35
322 0.39
323 0.4
324 0.41
325 0.49
326 0.47
327 0.52
328 0.56
329 0.55
330 0.52
331 0.48
332 0.43
333 0.39
334 0.35
335 0.32
336 0.28
337 0.26
338 0.24
339 0.22
340 0.19
341 0.14
342 0.15
343 0.16
344 0.16
345 0.2
346 0.24
347 0.27
348 0.29
349 0.29