Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MSA4

Protein Details
Accession B8MSA4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-417LRTAIQKEDQKHKRTKKVITEEASHydrophilic
453-474PPTCSDCHRISHTRRQCPNRTSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR006600  HTH_CenpB_DNA-bd_dom  
IPR007889  HTH_Psq  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
PF05225  HTH_psq  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51253  HTH_CENPB  
Amino Acid Sequences METALELLGSPLKIEKYLIKQEGLKESAIRDLQSSKIQSGCKAARVYGLPRTSLQGRLKGRRPLAESNATKRKLTSTEEETLIKRVLSLTKRGYPPRPIFIENWANLLLANRGSDGPIERVGINWKSTFINRHPEVKSVYYRGFHYQQAKCEDRKVIQPWFELVRTTIAEYGIDSSDIYNFDETGFAMGLIKSAKVIIGAETTNKEAFVLQPGKREWVTAIEAVNSTGTRTVGRYRLFILDGHGSHSTPEFDTTCIENNIISLCMPAHTSHLCQPLDISIFSPLKKSYYKHNGFAATGLIPLNPGRVLEKLNIQLKTPTPPGSSHGTSQSQSSCFQTPSNPHELKQHSIAVKKRLDPLFSSPSNPTLVKLNQVYKSCEIAWHNATLLAQENMELRTAIQKEDQKHKRTKKVITEEASLIRGEAQSFIDESNAANQLAASLVSVEDGLPRRRAPPTCSDCHRISHTRRQCPNRTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.21
3 0.27
4 0.37
5 0.4
6 0.41
7 0.44
8 0.49
9 0.55
10 0.51
11 0.44
12 0.36
13 0.34
14 0.37
15 0.35
16 0.3
17 0.24
18 0.25
19 0.27
20 0.32
21 0.33
22 0.29
23 0.32
24 0.34
25 0.33
26 0.4
27 0.39
28 0.39
29 0.38
30 0.36
31 0.36
32 0.38
33 0.4
34 0.39
35 0.39
36 0.35
37 0.34
38 0.38
39 0.35
40 0.4
41 0.41
42 0.41
43 0.47
44 0.54
45 0.61
46 0.65
47 0.67
48 0.65
49 0.66
50 0.66
51 0.64
52 0.65
53 0.64
54 0.65
55 0.69
56 0.64
57 0.59
58 0.52
59 0.49
60 0.44
61 0.44
62 0.42
63 0.39
64 0.42
65 0.44
66 0.46
67 0.42
68 0.4
69 0.35
70 0.28
71 0.21
72 0.18
73 0.23
74 0.23
75 0.29
76 0.32
77 0.39
78 0.46
79 0.53
80 0.57
81 0.59
82 0.61
83 0.62
84 0.6
85 0.56
86 0.51
87 0.52
88 0.54
89 0.45
90 0.42
91 0.35
92 0.3
93 0.26
94 0.25
95 0.19
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.11
102 0.12
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.13
107 0.14
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.18
112 0.19
113 0.2
114 0.22
115 0.27
116 0.26
117 0.34
118 0.34
119 0.42
120 0.41
121 0.43
122 0.44
123 0.43
124 0.43
125 0.38
126 0.38
127 0.33
128 0.34
129 0.36
130 0.35
131 0.35
132 0.4
133 0.39
134 0.41
135 0.47
136 0.49
137 0.45
138 0.47
139 0.45
140 0.38
141 0.43
142 0.42
143 0.4
144 0.38
145 0.38
146 0.36
147 0.35
148 0.33
149 0.26
150 0.22
151 0.19
152 0.16
153 0.16
154 0.14
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.13
196 0.19
197 0.18
198 0.23
199 0.24
200 0.26
201 0.26
202 0.26
203 0.2
204 0.17
205 0.18
206 0.15
207 0.15
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.12
212 0.09
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.1
219 0.15
220 0.16
221 0.17
222 0.18
223 0.19
224 0.19
225 0.18
226 0.17
227 0.15
228 0.15
229 0.16
230 0.15
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.12
235 0.09
236 0.1
237 0.08
238 0.08
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.11
243 0.11
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.08
255 0.09
256 0.11
257 0.15
258 0.22
259 0.21
260 0.21
261 0.2
262 0.2
263 0.2
264 0.19
265 0.15
266 0.13
267 0.15
268 0.15
269 0.17
270 0.15
271 0.17
272 0.2
273 0.2
274 0.25
275 0.35
276 0.39
277 0.41
278 0.45
279 0.44
280 0.41
281 0.4
282 0.32
283 0.21
284 0.17
285 0.14
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.1
295 0.11
296 0.15
297 0.21
298 0.26
299 0.27
300 0.26
301 0.28
302 0.28
303 0.31
304 0.3
305 0.27
306 0.23
307 0.23
308 0.26
309 0.29
310 0.3
311 0.27
312 0.3
313 0.29
314 0.28
315 0.29
316 0.29
317 0.24
318 0.24
319 0.25
320 0.22
321 0.21
322 0.21
323 0.24
324 0.27
325 0.31
326 0.39
327 0.37
328 0.35
329 0.43
330 0.45
331 0.44
332 0.41
333 0.41
334 0.35
335 0.41
336 0.45
337 0.45
338 0.47
339 0.46
340 0.51
341 0.48
342 0.46
343 0.43
344 0.45
345 0.44
346 0.41
347 0.41
348 0.34
349 0.34
350 0.35
351 0.31
352 0.25
353 0.24
354 0.24
355 0.26
356 0.3
357 0.34
358 0.36
359 0.39
360 0.43
361 0.39
362 0.41
363 0.36
364 0.36
365 0.32
366 0.32
367 0.31
368 0.28
369 0.26
370 0.24
371 0.23
372 0.19
373 0.19
374 0.14
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.11
379 0.12
380 0.11
381 0.09
382 0.15
383 0.16
384 0.17
385 0.22
386 0.27
387 0.33
388 0.44
389 0.53
390 0.55
391 0.64
392 0.72
393 0.77
394 0.8
395 0.83
396 0.83
397 0.84
398 0.85
399 0.79
400 0.75
401 0.68
402 0.62
403 0.54
404 0.43
405 0.33
406 0.25
407 0.2
408 0.16
409 0.13
410 0.12
411 0.11
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.11
416 0.11
417 0.14
418 0.15
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.12
424 0.11
425 0.07
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.06
431 0.1
432 0.16
433 0.2
434 0.23
435 0.25
436 0.29
437 0.36
438 0.41
439 0.42
440 0.48
441 0.52
442 0.57
443 0.63
444 0.65
445 0.6
446 0.61
447 0.64
448 0.63
449 0.63
450 0.66
451 0.69
452 0.73
453 0.81
454 0.84