Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MDR1

Protein Details
Accession B8MDR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
796-818AKQTTLYKYYRRRLERTLNQSTVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 3, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047546  Rcat_RBR_RNF216  
IPR047544  RING-HC_RBR_RNF216  
IPR044066  TRIAD_supradom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
CDD cd20353  Rcat_RBR_RNF216  
cd16630  RING-HC_RBR_RNF216  
Amino Acid Sequences MSPSEPRFTSPLRNTRGGSPNVRDATTATGSNTLNPTDITTRTTSPRPSTPISATINEALRNNPFGSTSRSRALEAEVQAITSLLEHDERRADLEDRNRSIVILAALFPDVRIEVFRELLMRFDGKSRLHVCVEQLLRHKKQWVQGRWNIPLDRKDDNSNNNNNAVGPGLSADNYVVVAPEELFRSETYKNTVKAVLCKEFSGLSRSTIDGVLAEVNFSYTRARPTLKELSRKGWRATISNLNPFRRKKDNTKDDNPLIIWERFRDGDGTGLAIPRLRQKTGSDELDNEIQEALIAPLLRERKETQEYQDYRLASEINEKDAMAENALYECQCCLDDVAFEQVSACSSDQGHMICFNCIRRTLHEAVFGQGWDNSVDPERSTLKCVAPVSHGVCEGHLDSMLVKRAILSEKAGSETYHKFEDRLASEALLISNLKLVRCPFCSYAEIDPIFHPSSISASGFPTGGISWRFRRGNLISTILTTILLLDLIPLLFLPFLITFLLYPRTAAAIFRVSLQNLCLRTRSPRFTCKNPSCRQVSCMTCHKNWRDPHTCEEPLQQSLRTTVEAARTAAVKRTCPRCNLSFVKSSGCNKLTCICGYSMCYICRKALNGPSSRRQQQQGAVRNPFVAGREDDNNNAADAEADEGDSGYKHFCEHFRVNPGTRCTECNKCELYFAEDEEVIARKAGEQAEREWRLRQSLMIDNANNTNNNDNNNNNPNNQNQNQRPGKQILNANLPLRWQDNQSQKLGNRHPDLYRIPTMYNHHHNRSWQYWLIEVWKEGRWKWELQGMADKLVEAKQTTLYKYYRRRLERTLNQSTVRLGLQYLIEIKVKVFIKPNSTSPPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.63
3 0.68
4 0.64
5 0.63
6 0.59
7 0.61
8 0.58
9 0.56
10 0.48
11 0.41
12 0.4
13 0.35
14 0.31
15 0.23
16 0.25
17 0.25
18 0.28
19 0.29
20 0.23
21 0.21
22 0.2
23 0.23
24 0.21
25 0.22
26 0.22
27 0.24
28 0.27
29 0.31
30 0.37
31 0.4
32 0.42
33 0.47
34 0.5
35 0.51
36 0.53
37 0.52
38 0.54
39 0.52
40 0.48
41 0.44
42 0.43
43 0.41
44 0.37
45 0.34
46 0.29
47 0.27
48 0.29
49 0.26
50 0.22
51 0.21
52 0.21
53 0.28
54 0.31
55 0.34
56 0.36
57 0.37
58 0.38
59 0.37
60 0.4
61 0.38
62 0.33
63 0.33
64 0.27
65 0.25
66 0.24
67 0.22
68 0.17
69 0.11
70 0.1
71 0.07
72 0.1
73 0.1
74 0.13
75 0.16
76 0.16
77 0.19
78 0.22
79 0.22
80 0.25
81 0.34
82 0.41
83 0.42
84 0.44
85 0.41
86 0.38
87 0.36
88 0.32
89 0.25
90 0.16
91 0.13
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.13
104 0.15
105 0.14
106 0.16
107 0.17
108 0.16
109 0.14
110 0.18
111 0.23
112 0.22
113 0.3
114 0.31
115 0.33
116 0.34
117 0.35
118 0.33
119 0.36
120 0.38
121 0.35
122 0.42
123 0.46
124 0.48
125 0.5
126 0.54
127 0.49
128 0.54
129 0.59
130 0.6
131 0.6
132 0.64
133 0.69
134 0.7
135 0.72
136 0.69
137 0.64
138 0.6
139 0.54
140 0.51
141 0.46
142 0.47
143 0.47
144 0.51
145 0.55
146 0.57
147 0.56
148 0.52
149 0.5
150 0.42
151 0.36
152 0.28
153 0.19
154 0.11
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.13
173 0.15
174 0.16
175 0.21
176 0.26
177 0.27
178 0.28
179 0.32
180 0.31
181 0.36
182 0.41
183 0.4
184 0.36
185 0.35
186 0.33
187 0.31
188 0.3
189 0.27
190 0.22
191 0.18
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.1
207 0.09
208 0.13
209 0.16
210 0.18
211 0.19
212 0.26
213 0.36
214 0.4
215 0.48
216 0.49
217 0.54
218 0.61
219 0.64
220 0.58
221 0.53
222 0.49
223 0.43
224 0.45
225 0.46
226 0.42
227 0.47
228 0.52
229 0.52
230 0.58
231 0.57
232 0.58
233 0.57
234 0.59
235 0.6
236 0.65
237 0.7
238 0.72
239 0.77
240 0.79
241 0.73
242 0.69
243 0.59
244 0.51
245 0.44
246 0.37
247 0.3
248 0.22
249 0.22
250 0.19
251 0.19
252 0.17
253 0.13
254 0.13
255 0.12
256 0.13
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.16
263 0.19
264 0.18
265 0.2
266 0.21
267 0.28
268 0.34
269 0.38
270 0.31
271 0.3
272 0.32
273 0.33
274 0.31
275 0.24
276 0.18
277 0.13
278 0.11
279 0.1
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.09
285 0.11
286 0.12
287 0.15
288 0.16
289 0.22
290 0.27
291 0.29
292 0.31
293 0.39
294 0.4
295 0.42
296 0.44
297 0.38
298 0.33
299 0.32
300 0.27
301 0.17
302 0.23
303 0.19
304 0.17
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.19
309 0.18
310 0.11
311 0.1
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.07
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.06
334 0.07
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.11
341 0.11
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.17
346 0.18
347 0.18
348 0.25
349 0.28
350 0.27
351 0.3
352 0.29
353 0.27
354 0.27
355 0.24
356 0.17
357 0.14
358 0.12
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.1
366 0.12
367 0.12
368 0.15
369 0.18
370 0.17
371 0.2
372 0.21
373 0.2
374 0.18
375 0.22
376 0.21
377 0.19
378 0.19
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.13
383 0.09
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.09
389 0.08
390 0.07
391 0.07
392 0.09
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.1
398 0.12
399 0.13
400 0.11
401 0.14
402 0.15
403 0.16
404 0.17
405 0.17
406 0.15
407 0.16
408 0.2
409 0.17
410 0.18
411 0.16
412 0.14
413 0.14
414 0.14
415 0.12
416 0.09
417 0.07
418 0.05
419 0.07
420 0.08
421 0.07
422 0.09
423 0.1
424 0.12
425 0.15
426 0.18
427 0.17
428 0.19
429 0.21
430 0.22
431 0.22
432 0.24
433 0.22
434 0.2
435 0.19
436 0.2
437 0.19
438 0.16
439 0.14
440 0.09
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.06
451 0.07
452 0.09
453 0.11
454 0.13
455 0.2
456 0.21
457 0.21
458 0.27
459 0.27
460 0.3
461 0.3
462 0.31
463 0.24
464 0.24
465 0.25
466 0.19
467 0.17
468 0.11
469 0.08
470 0.05
471 0.04
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.06
488 0.09
489 0.08
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.09
497 0.1
498 0.12
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.13
503 0.15
504 0.15
505 0.16
506 0.15
507 0.15
508 0.22
509 0.28
510 0.35
511 0.36
512 0.44
513 0.48
514 0.55
515 0.65
516 0.68
517 0.72
518 0.69
519 0.71
520 0.66
521 0.62
522 0.58
523 0.54
524 0.48
525 0.43
526 0.47
527 0.46
528 0.43
529 0.51
530 0.52
531 0.52
532 0.54
533 0.58
534 0.58
535 0.56
536 0.59
537 0.58
538 0.56
539 0.49
540 0.5
541 0.43
542 0.38
543 0.36
544 0.3
545 0.23
546 0.23
547 0.22
548 0.17
549 0.16
550 0.15
551 0.17
552 0.17
553 0.17
554 0.16
555 0.17
556 0.17
557 0.21
558 0.21
559 0.22
560 0.27
561 0.35
562 0.38
563 0.42
564 0.46
565 0.44
566 0.5
567 0.51
568 0.49
569 0.47
570 0.44
571 0.44
572 0.43
573 0.43
574 0.43
575 0.39
576 0.35
577 0.3
578 0.32
579 0.31
580 0.26
581 0.25
582 0.19
583 0.18
584 0.2
585 0.22
586 0.22
587 0.21
588 0.23
589 0.23
590 0.24
591 0.25
592 0.24
593 0.26
594 0.3
595 0.36
596 0.4
597 0.45
598 0.51
599 0.57
600 0.61
601 0.6
602 0.57
603 0.54
604 0.54
605 0.57
606 0.59
607 0.59
608 0.58
609 0.53
610 0.5
611 0.46
612 0.39
613 0.31
614 0.24
615 0.18
616 0.17
617 0.21
618 0.22
619 0.23
620 0.23
621 0.22
622 0.19
623 0.17
624 0.13
625 0.09
626 0.08
627 0.08
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.06
636 0.06
637 0.07
638 0.1
639 0.12
640 0.19
641 0.24
642 0.29
643 0.36
644 0.42
645 0.47
646 0.51
647 0.53
648 0.52
649 0.48
650 0.47
651 0.44
652 0.47
653 0.44
654 0.44
655 0.43
656 0.37
657 0.39
658 0.36
659 0.36
660 0.29
661 0.29
662 0.24
663 0.21
664 0.2
665 0.19
666 0.18
667 0.13
668 0.12
669 0.1
670 0.08
671 0.12
672 0.15
673 0.17
674 0.18
675 0.22
676 0.32
677 0.37
678 0.38
679 0.38
680 0.38
681 0.38
682 0.36
683 0.34
684 0.29
685 0.32
686 0.36
687 0.37
688 0.36
689 0.34
690 0.38
691 0.38
692 0.35
693 0.29
694 0.29
695 0.26
696 0.29
697 0.31
698 0.29
699 0.34
700 0.41
701 0.43
702 0.41
703 0.42
704 0.45
705 0.5
706 0.52
707 0.55
708 0.52
709 0.59
710 0.63
711 0.63
712 0.63
713 0.59
714 0.58
715 0.54
716 0.55
717 0.51
718 0.51
719 0.53
720 0.49
721 0.44
722 0.42
723 0.38
724 0.35
725 0.3
726 0.26
727 0.29
728 0.37
729 0.41
730 0.44
731 0.48
732 0.49
733 0.57
734 0.61
735 0.62
736 0.57
737 0.57
738 0.55
739 0.55
740 0.55
741 0.52
742 0.5
743 0.44
744 0.4
745 0.41
746 0.45
747 0.47
748 0.52
749 0.53
750 0.54
751 0.56
752 0.6
753 0.62
754 0.6
755 0.58
756 0.53
757 0.46
758 0.42
759 0.41
760 0.41
761 0.35
762 0.34
763 0.3
764 0.29
765 0.32
766 0.31
767 0.35
768 0.33
769 0.33
770 0.35
771 0.38
772 0.36
773 0.35
774 0.44
775 0.39
776 0.38
777 0.35
778 0.32
779 0.27
780 0.27
781 0.25
782 0.17
783 0.16
784 0.2
785 0.24
786 0.27
787 0.32
788 0.35
789 0.42
790 0.51
791 0.59
792 0.63
793 0.67
794 0.71
795 0.74
796 0.8
797 0.81
798 0.81
799 0.82
800 0.78
801 0.73
802 0.68
803 0.6
804 0.52
805 0.42
806 0.33
807 0.23
808 0.19
809 0.16
810 0.17
811 0.18
812 0.18
813 0.19
814 0.18
815 0.18
816 0.23
817 0.23
818 0.25
819 0.3
820 0.32
821 0.38
822 0.42
823 0.48