Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CRJ4

Protein Details
Accession A0A0D1CRJ4    Localization Confidence Low Confidence Score 8.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-292QTLSGKKSKGKKERQIEQLDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-283KKSKGKK
Subcellular Location(s) cysk 23, nucl 2.5, cyto_nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004854  Ufd1-like  
IPR042299  Ufd1-like_Nn  
Gene Ontology GO:0000837  C:Doa10p ubiquitin ligase complex  
GO:0000839  C:Hrd1p ubiquitin ligase ERAD-L complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030894  C:replisome  
GO:1990112  C:RQC complex  
GO:0034098  C:VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPase complex  
GO:0031593  F:polyubiquitin modification-dependent protein binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0071629  P:cytoplasm protein quality control by the ubiquitin-proteasome system  
GO:0006274  P:DNA replication termination  
GO:0071712  P:ER-associated misfolded protein catabolic process  
GO:0072671  P:mitochondria-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0070651  P:nonfunctional rRNA decay  
GO:1900182  P:positive regulation of protein localization to nucleus  
GO:0072665  P:protein localization to vacuole  
GO:0030970  P:retrograde protein transport, ER to cytosol  
GO:1990116  P:ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0030433  P:ubiquitin-dependent ERAD pathway  
KEGG uma:UMAG_02572  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03152  UFD1  
Amino Acid Sequences MSMFGGLDGGFARFMQNGMDPRFPRPPRAYDEYFKAYSMAMLPGKERLNVSYGGKIIMPPSALAHLTNLEIESPWFFELRTTGASEVRRTHAGVLEFIADEGHVHLPAWMMRTLGLSEGDPIRLTGATLPKGKMVKIQPQTVDFLEISDPKAVLEQAFRNFSALTPGDIVEISYNCLTFEILIMEITPDADGISIIETDLEVDFAAPKGYVEPTPQPRPPPPTMASKLNIDSSRVESIPPTRTSTPGSLTGTSATGGSGMATPSGPFRGSGQTLSGKKSKGKKERQIEQLDPFSMIRRTDMPRIVTNDTQLTEKKIPAALNLPFGKLFFGYEIIPVGGKVDGTVKEKKTESFGGAGTTLSGRAPRPKPQEKDNSTPTASAASSGYTLGGGRVLGESSRSSRYATPTSSDGRSLNESRREVIEIDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.15
4 0.21
5 0.25
6 0.33
7 0.34
8 0.39
9 0.49
10 0.5
11 0.54
12 0.54
13 0.56
14 0.56
15 0.63
16 0.64
17 0.59
18 0.65
19 0.62
20 0.57
21 0.51
22 0.43
23 0.35
24 0.29
25 0.25
26 0.23
27 0.18
28 0.18
29 0.18
30 0.23
31 0.25
32 0.26
33 0.25
34 0.21
35 0.22
36 0.25
37 0.26
38 0.25
39 0.24
40 0.23
41 0.22
42 0.21
43 0.19
44 0.17
45 0.15
46 0.11
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.14
52 0.13
53 0.13
54 0.13
55 0.12
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.13
68 0.13
69 0.14
70 0.19
71 0.21
72 0.24
73 0.26
74 0.27
75 0.27
76 0.26
77 0.27
78 0.26
79 0.25
80 0.22
81 0.19
82 0.18
83 0.16
84 0.15
85 0.13
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.1
95 0.12
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.09
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.09
112 0.11
113 0.14
114 0.18
115 0.21
116 0.22
117 0.25
118 0.26
119 0.26
120 0.29
121 0.3
122 0.35
123 0.37
124 0.42
125 0.4
126 0.41
127 0.43
128 0.37
129 0.34
130 0.25
131 0.2
132 0.17
133 0.15
134 0.15
135 0.13
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.11
142 0.13
143 0.15
144 0.18
145 0.18
146 0.18
147 0.18
148 0.17
149 0.19
150 0.16
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.12
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.06
198 0.08
199 0.14
200 0.2
201 0.25
202 0.27
203 0.3
204 0.33
205 0.39
206 0.39
207 0.39
208 0.35
209 0.39
210 0.41
211 0.41
212 0.39
213 0.35
214 0.34
215 0.33
216 0.3
217 0.24
218 0.21
219 0.19
220 0.2
221 0.18
222 0.16
223 0.14
224 0.17
225 0.2
226 0.21
227 0.22
228 0.21
229 0.23
230 0.25
231 0.26
232 0.25
233 0.24
234 0.25
235 0.21
236 0.2
237 0.19
238 0.17
239 0.15
240 0.13
241 0.08
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.12
256 0.13
257 0.14
258 0.16
259 0.22
260 0.24
261 0.27
262 0.29
263 0.28
264 0.33
265 0.41
266 0.48
267 0.52
268 0.6
269 0.66
270 0.72
271 0.79
272 0.83
273 0.82
274 0.76
275 0.71
276 0.65
277 0.56
278 0.48
279 0.39
280 0.32
281 0.26
282 0.22
283 0.18
284 0.18
285 0.22
286 0.26
287 0.3
288 0.31
289 0.33
290 0.38
291 0.41
292 0.38
293 0.36
294 0.33
295 0.29
296 0.29
297 0.25
298 0.26
299 0.24
300 0.24
301 0.24
302 0.24
303 0.24
304 0.23
305 0.28
306 0.23
307 0.28
308 0.29
309 0.28
310 0.24
311 0.24
312 0.23
313 0.17
314 0.16
315 0.09
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.1
328 0.13
329 0.17
330 0.25
331 0.26
332 0.31
333 0.33
334 0.34
335 0.35
336 0.35
337 0.33
338 0.29
339 0.27
340 0.24
341 0.23
342 0.21
343 0.17
344 0.14
345 0.12
346 0.1
347 0.12
348 0.12
349 0.21
350 0.26
351 0.34
352 0.44
353 0.54
354 0.58
355 0.66
356 0.74
357 0.73
358 0.78
359 0.76
360 0.72
361 0.64
362 0.59
363 0.5
364 0.42
365 0.35
366 0.27
367 0.2
368 0.14
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.1
382 0.12
383 0.15
384 0.19
385 0.2
386 0.22
387 0.25
388 0.32
389 0.36
390 0.36
391 0.36
392 0.37
393 0.41
394 0.41
395 0.41
396 0.35
397 0.33
398 0.37
399 0.39
400 0.42
401 0.46
402 0.46
403 0.45
404 0.47
405 0.45
406 0.39