Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8M375

Protein Details
Accession B8M375    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
330-353TEVRPVQDKRDKKGKKNGHGGGGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
338-369KRDKKGKKNGHGGGGGNKNSPHGTVGGGKHKG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034215  RBM42_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12383  RRM_RBM42  
Amino Acid Sequences MSLPPPPGLSKPSSLPPRPPSSFKPAYSSAPSYSSPGTTTTATPSHGARASPATTGYSAFTAFAPRAVASAQPYRSNSPAVAAVSQPTTAYQGPAVPGYSAPTYQNPQQSYQAGAQSYYGQQPGYGDSQYGASPIPQIANPFPVPGQERKGYGRDSGMDPEMEAQIAQWQSAYMTNPNEDSPATITQAKAAGRPGASAPSSTNSGTPTYSASASHTPVPRAGGESESKTVIRSGGGQTWSDPTLLEWDPAHFRLFVGNLAGEVTDDSLKKAFSRYPSIQKARVIRDKRTEKSKGYGFVSFSDGDDYFKAAREMQGKYIGSHPVLLRRAMTEVRPVQDKRDKKGKKNGHGGGGGNKNSPHGTVGGGKHKGDGVKKQGYTRVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.56
3 0.59
4 0.64
5 0.66
6 0.68
7 0.65
8 0.65
9 0.69
10 0.62
11 0.6
12 0.55
13 0.55
14 0.55
15 0.53
16 0.45
17 0.41
18 0.4
19 0.37
20 0.34
21 0.29
22 0.24
23 0.22
24 0.22
25 0.2
26 0.2
27 0.21
28 0.22
29 0.22
30 0.23
31 0.22
32 0.24
33 0.25
34 0.24
35 0.22
36 0.24
37 0.24
38 0.23
39 0.23
40 0.2
41 0.18
42 0.19
43 0.18
44 0.14
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.13
56 0.14
57 0.21
58 0.23
59 0.27
60 0.3
61 0.33
62 0.34
63 0.34
64 0.3
65 0.25
66 0.25
67 0.21
68 0.2
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.15
73 0.13
74 0.11
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.1
84 0.1
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.15
90 0.18
91 0.23
92 0.29
93 0.28
94 0.3
95 0.33
96 0.32
97 0.32
98 0.32
99 0.3
100 0.24
101 0.22
102 0.2
103 0.18
104 0.18
105 0.17
106 0.15
107 0.12
108 0.11
109 0.12
110 0.13
111 0.14
112 0.12
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.08
119 0.06
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.1
125 0.1
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.15
131 0.18
132 0.19
133 0.23
134 0.21
135 0.23
136 0.25
137 0.28
138 0.27
139 0.25
140 0.24
141 0.22
142 0.22
143 0.22
144 0.2
145 0.16
146 0.15
147 0.14
148 0.13
149 0.1
150 0.08
151 0.05
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.07
158 0.09
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.14
175 0.14
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.12
188 0.12
189 0.12
190 0.11
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.18
202 0.19
203 0.18
204 0.18
205 0.19
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.14
210 0.14
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.14
216 0.14
217 0.12
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.14
222 0.16
223 0.15
224 0.16
225 0.18
226 0.18
227 0.15
228 0.13
229 0.09
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.11
234 0.12
235 0.15
236 0.16
237 0.17
238 0.12
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.1
257 0.12
258 0.15
259 0.17
260 0.26
261 0.31
262 0.4
263 0.5
264 0.55
265 0.57
266 0.59
267 0.62
268 0.62
269 0.66
270 0.61
271 0.59
272 0.64
273 0.69
274 0.69
275 0.71
276 0.69
277 0.63
278 0.66
279 0.64
280 0.59
281 0.54
282 0.51
283 0.44
284 0.39
285 0.38
286 0.31
287 0.26
288 0.23
289 0.2
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.13
297 0.17
298 0.21
299 0.23
300 0.24
301 0.31
302 0.3
303 0.31
304 0.33
305 0.33
306 0.28
307 0.3
308 0.28
309 0.28
310 0.3
311 0.3
312 0.27
313 0.25
314 0.28
315 0.26
316 0.26
317 0.28
318 0.3
319 0.33
320 0.39
321 0.39
322 0.44
323 0.51
324 0.56
325 0.55
326 0.62
327 0.67
328 0.69
329 0.79
330 0.81
331 0.82
332 0.86
333 0.84
334 0.8
335 0.76
336 0.7
337 0.68
338 0.65
339 0.58
340 0.5
341 0.44
342 0.39
343 0.35
344 0.33
345 0.25
346 0.18
347 0.18
348 0.22
349 0.28
350 0.35
351 0.38
352 0.37
353 0.37
354 0.4
355 0.42
356 0.41
357 0.44
358 0.45
359 0.49
360 0.53
361 0.56