Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MDS5

Protein Details
Accession B8MDS5    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-113TSAYRRREPIRRDSLRRREALHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-124RRREPIRRDSLRRREALLKGKEGSRRRQ
182-187KSKNRE
191-207EKTRVSKEIRKSLKHAR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025952  R3H-assoc_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13902  R3H-assoc  
CDD cd02325  R3H  
Amino Acid Sequences MAIHPSLRTGRASTSNLTQQDISAWTEQAAASLQILDISDSVAQIEVINASTPIRGTANALSIPLDGPITATNKPSTPRVKIISKAADDTIGTSAYRRREPIRRDSLRRREALLKGKEGSRRRQRWENDRLLSNPWVQPPAPGDWSVQPTHPRHDPVPYYLAPLWDSHFAHKEQSKSLKQAKSKNREHEDEKTRVSKEIRKSLKHARAARGMLQDLEEDIRRFLEKWNDKQLERELDSVKDSEYEDSDDEIVFVGRNGQMHDAHSRQEKAKRINEGLQEGQKMVFESLAHDPGAVFGRWLVHSIATYYGLYTWSVTSGSPERRQAYVGLNPPVSSTHLADLTHGSSLRIKPGEPLPKPLWVQV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.43
3 0.42
4 0.43
5 0.38
6 0.31
7 0.3
8 0.29
9 0.26
10 0.2
11 0.18
12 0.16
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.13
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.06
32 0.07
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.12
44 0.14
45 0.16
46 0.16
47 0.17
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.12
52 0.1
53 0.07
54 0.07
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.15
59 0.16
60 0.19
61 0.21
62 0.28
63 0.32
64 0.34
65 0.39
66 0.43
67 0.47
68 0.49
69 0.54
70 0.54
71 0.49
72 0.46
73 0.4
74 0.35
75 0.3
76 0.27
77 0.2
78 0.14
79 0.12
80 0.11
81 0.15
82 0.18
83 0.2
84 0.22
85 0.27
86 0.35
87 0.42
88 0.51
89 0.58
90 0.62
91 0.7
92 0.77
93 0.82
94 0.8
95 0.76
96 0.7
97 0.66
98 0.64
99 0.64
100 0.58
101 0.52
102 0.47
103 0.49
104 0.53
105 0.51
106 0.54
107 0.55
108 0.58
109 0.61
110 0.68
111 0.71
112 0.74
113 0.78
114 0.77
115 0.71
116 0.66
117 0.61
118 0.56
119 0.5
120 0.44
121 0.36
122 0.28
123 0.26
124 0.22
125 0.22
126 0.21
127 0.21
128 0.19
129 0.17
130 0.18
131 0.18
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.24
136 0.24
137 0.28
138 0.29
139 0.3
140 0.27
141 0.32
142 0.31
143 0.28
144 0.31
145 0.27
146 0.28
147 0.25
148 0.25
149 0.2
150 0.19
151 0.17
152 0.16
153 0.17
154 0.15
155 0.17
156 0.17
157 0.2
158 0.22
159 0.22
160 0.23
161 0.3
162 0.3
163 0.35
164 0.42
165 0.43
166 0.47
167 0.54
168 0.6
169 0.62
170 0.67
171 0.7
172 0.67
173 0.67
174 0.66
175 0.66
176 0.63
177 0.57
178 0.53
179 0.48
180 0.43
181 0.42
182 0.41
183 0.38
184 0.38
185 0.43
186 0.46
187 0.44
188 0.49
189 0.56
190 0.61
191 0.62
192 0.61
193 0.57
194 0.56
195 0.55
196 0.54
197 0.47
198 0.4
199 0.32
200 0.26
201 0.21
202 0.15
203 0.15
204 0.11
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.12
211 0.21
212 0.27
213 0.32
214 0.43
215 0.46
216 0.46
217 0.49
218 0.52
219 0.48
220 0.43
221 0.42
222 0.33
223 0.3
224 0.31
225 0.27
226 0.22
227 0.16
228 0.15
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.06
240 0.05
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.11
246 0.12
247 0.14
248 0.2
249 0.19
250 0.22
251 0.26
252 0.28
253 0.31
254 0.37
255 0.43
256 0.46
257 0.51
258 0.54
259 0.54
260 0.57
261 0.57
262 0.56
263 0.53
264 0.48
265 0.43
266 0.37
267 0.32
268 0.27
269 0.23
270 0.18
271 0.13
272 0.09
273 0.12
274 0.15
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.17
281 0.14
282 0.1
283 0.09
284 0.12
285 0.12
286 0.14
287 0.13
288 0.11
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.13
293 0.13
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.13
304 0.2
305 0.27
306 0.31
307 0.38
308 0.4
309 0.4
310 0.42
311 0.4
312 0.39
313 0.4
314 0.41
315 0.4
316 0.38
317 0.37
318 0.37
319 0.35
320 0.32
321 0.27
322 0.22
323 0.2
324 0.21
325 0.21
326 0.22
327 0.23
328 0.21
329 0.21
330 0.2
331 0.18
332 0.21
333 0.23
334 0.29
335 0.28
336 0.27
337 0.29
338 0.38
339 0.47
340 0.44
341 0.5
342 0.46
343 0.52