Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8LYH8

Protein Details
Accession B8LYH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-65NGANAKSKAPNQNQNQKQKQPQKPKATDATAHydrophilic
72-96KLSPAEMKKKQKAEKAARRAREKLEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-97EMKKKQKAEKAARRAREKLER
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.5, cyto 10, nucl 9, mito 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000649  IF-2B-related  
IPR042529  IF_2B-like_C  
IPR037171  NagB/RpiA_transferase-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01008  IF-2B  
Amino Acid Sequences MSSPEQSQAPPATATQNPPATNSSASQTPPTDAQNGANAKSKAPNQNQNQKQKQPQKPKATDATAADGSGEKLSPAEMKKKQKAEKAARRAREKLEREGGAAAGAGAAGGAQQGAQQGAVQGGPVQTPRRPQQGGRDGLASTPRGPRFAGGARGTPLPTPTETKKKEDKNVAVFGHLYGIPRRSTIAGAAKEVHPAVLALGLQIRDYVICGSSARCVATLIAFKRVIESYTTPIGTSLARHLTTHLSHQITYLSTCRPLSISQGNAIRALKLSISSIDPSVPEATAKTELCEFINNFIREKITVADQVIATSATQKIQDGDVIVTFAGSSIVKQTLITAHKQGKKFRVSVIDSRPLFEGKNLARALSSAGLDVQYSLIHGISHAMKDATKVFLGAHAMTGNGRLYSRVGTALVAMSAKERSGGAEIPVIVCCETVKFTDRVALDSIVVNEIADADELITKQPLSQVTGRPDPHKTVDEKPGKKGNNQNVTDGIASLTLDQNAPSPLTGWKDTPNLQLLNIMHDVTPAEYVDMVVTEMGSLPPSAVPIVHRMSTNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.38
4 0.36
5 0.38
6 0.39
7 0.37
8 0.36
9 0.33
10 0.29
11 0.26
12 0.28
13 0.29
14 0.28
15 0.28
16 0.28
17 0.3
18 0.29
19 0.27
20 0.27
21 0.3
22 0.32
23 0.32
24 0.36
25 0.34
26 0.33
27 0.38
28 0.43
29 0.46
30 0.52
31 0.59
32 0.61
33 0.71
34 0.79
35 0.83
36 0.86
37 0.85
38 0.87
39 0.88
40 0.88
41 0.89
42 0.9
43 0.9
44 0.87
45 0.86
46 0.84
47 0.78
48 0.72
49 0.64
50 0.6
51 0.49
52 0.42
53 0.34
54 0.26
55 0.23
56 0.18
57 0.15
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.14
62 0.17
63 0.26
64 0.33
65 0.43
66 0.52
67 0.61
68 0.68
69 0.71
70 0.77
71 0.79
72 0.82
73 0.83
74 0.84
75 0.83
76 0.83
77 0.82
78 0.79
79 0.78
80 0.73
81 0.7
82 0.69
83 0.61
84 0.55
85 0.5
86 0.42
87 0.31
88 0.26
89 0.16
90 0.08
91 0.06
92 0.04
93 0.03
94 0.02
95 0.02
96 0.02
97 0.02
98 0.02
99 0.03
100 0.04
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.11
112 0.14
113 0.16
114 0.23
115 0.28
116 0.35
117 0.37
118 0.39
119 0.47
120 0.53
121 0.55
122 0.5
123 0.47
124 0.39
125 0.38
126 0.38
127 0.29
128 0.22
129 0.25
130 0.25
131 0.24
132 0.24
133 0.23
134 0.24
135 0.26
136 0.31
137 0.26
138 0.27
139 0.27
140 0.29
141 0.29
142 0.25
143 0.22
144 0.17
145 0.17
146 0.2
147 0.24
148 0.33
149 0.35
150 0.42
151 0.5
152 0.55
153 0.61
154 0.66
155 0.67
156 0.64
157 0.67
158 0.61
159 0.53
160 0.46
161 0.38
162 0.31
163 0.24
164 0.19
165 0.14
166 0.16
167 0.15
168 0.15
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.17
173 0.22
174 0.2
175 0.22
176 0.23
177 0.23
178 0.23
179 0.23
180 0.18
181 0.11
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.04
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.1
206 0.14
207 0.14
208 0.18
209 0.18
210 0.18
211 0.19
212 0.19
213 0.18
214 0.15
215 0.16
216 0.14
217 0.17
218 0.17
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.16
230 0.17
231 0.19
232 0.22
233 0.19
234 0.19
235 0.19
236 0.19
237 0.16
238 0.17
239 0.16
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.15
247 0.16
248 0.16
249 0.18
250 0.21
251 0.22
252 0.23
253 0.22
254 0.18
255 0.15
256 0.14
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.08
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.12
280 0.13
281 0.21
282 0.21
283 0.21
284 0.2
285 0.21
286 0.18
287 0.19
288 0.15
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.09
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.07
321 0.07
322 0.12
323 0.14
324 0.16
325 0.2
326 0.27
327 0.33
328 0.38
329 0.43
330 0.45
331 0.48
332 0.48
333 0.46
334 0.46
335 0.46
336 0.49
337 0.5
338 0.51
339 0.46
340 0.45
341 0.43
342 0.35
343 0.31
344 0.24
345 0.24
346 0.16
347 0.23
348 0.22
349 0.21
350 0.2
351 0.2
352 0.21
353 0.16
354 0.15
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.05
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.11
374 0.13
375 0.12
376 0.11
377 0.11
378 0.1
379 0.11
380 0.13
381 0.12
382 0.11
383 0.09
384 0.1
385 0.09
386 0.11
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.09
392 0.1
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.08
406 0.07
407 0.08
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.13
412 0.13
413 0.13
414 0.14
415 0.13
416 0.11
417 0.1
418 0.09
419 0.07
420 0.09
421 0.1
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.2
426 0.2
427 0.21
428 0.22
429 0.21
430 0.18
431 0.18
432 0.19
433 0.14
434 0.13
435 0.11
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.06
440 0.05
441 0.04
442 0.06
443 0.07
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.12
449 0.13
450 0.16
451 0.21
452 0.27
453 0.33
454 0.41
455 0.43
456 0.44
457 0.47
458 0.47
459 0.47
460 0.46
461 0.44
462 0.43
463 0.51
464 0.57
465 0.56
466 0.59
467 0.63
468 0.61
469 0.65
470 0.68
471 0.68
472 0.68
473 0.66
474 0.62
475 0.55
476 0.54
477 0.46
478 0.36
479 0.26
480 0.16
481 0.14
482 0.12
483 0.12
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.11
488 0.12
489 0.13
490 0.11
491 0.11
492 0.14
493 0.19
494 0.21
495 0.22
496 0.25
497 0.3
498 0.34
499 0.38
500 0.4
501 0.36
502 0.34
503 0.38
504 0.33
505 0.32
506 0.31
507 0.26
508 0.2
509 0.19
510 0.2
511 0.15
512 0.16
513 0.11
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.08
519 0.08
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.09
532 0.11
533 0.16
534 0.2
535 0.22