FuNGI

B8MBQ8

Protein Details

Accession

B8MBQ8

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
334-354	GGTPIRKKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
446-474	LSGWQDRSKQAKRKGAKGKRGKNGNEVLG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
339-344	RKKKRK
453-467	SKQAKRKGAKGKRGK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRRWIDKKNATTYQLFHRSQQDPLIHDPTADDRVLHPVYGPKQGAPALSTTASSASHKTSRNLKELESEFSTENVRKNEGEAANYGIYYDDSKYDYMQHLRELGTAGGNSYFVEAAPDKAKGKGKGMKLEDALRDFSIDDSRSEIGGSASVYGSEYARSTASSYVRKPTYQDQQDVPDVIAGFQPNMDPRLREALEALDDEAFVDDEDDHDIFGELTRNAEEVDPEEFQDTLYEDEDDGWESDATEKAYPQTSDTKTAGQNDNEATVAQQHDPSEMPDHDKPVPDLAPENADWMREFAKFKKEGKTLNNTPAANPDAGTEKHTVASTLFTVGGTPIRKKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTEGLRLLDDRFERVEALYALDEEGEYDDASCADGASMISGMTGATGMTGMSAASSQAPSLVSRGGDYSNAPLPSNFDNVMDDFLSGWQDRSKQAKRKGAKGKRGKNGNEVLGIAMLDEIRQGLGPARVPARGKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.66
3	0.65
4	0.57
5	0.52
6	0.54
7	0.51
8	0.5
9	0.54
10	0.48
11	0.42
12	0.47
13	0.48
14	0.39
15	0.37
16	0.35
17	0.32
18	0.31
19	0.27
20	0.21
21	0.17
22	0.25
23	0.25
24	0.24
25	0.21
26	0.24
27	0.27
28	0.34
29	0.34
30	0.28
31	0.31
32	0.32
33	0.32
34	0.26
35	0.24
36	0.19
37	0.19
38	0.19
39	0.16
40	0.15
41	0.16
42	0.17
43	0.17
44	0.19
45	0.25
46	0.28
47	0.33
48	0.41
49	0.47
50	0.52
51	0.52
52	0.49
53	0.51
54	0.5
55	0.5
56	0.43
57	0.39
58	0.32
59	0.31
60	0.34
61	0.28
62	0.31
63	0.28
64	0.28
65	0.25
66	0.26
67	0.34
68	0.3
69	0.3
70	0.26
71	0.27
72	0.25
73	0.24
74	0.22
75	0.14
76	0.13
77	0.12
78	0.12
79	0.1
80	0.11
81	0.12
82	0.13
83	0.16
84	0.2
85	0.24
86	0.24
87	0.24
88	0.25
89	0.25
90	0.25
91	0.23
92	0.19
93	0.16
94	0.14
95	0.13
96	0.1
97	0.1
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.06
102	0.09
103	0.09
104	0.11
105	0.13
106	0.15
107	0.16
108	0.21
109	0.27
110	0.27
111	0.34
112	0.38
113	0.42
114	0.48
115	0.51
116	0.5
117	0.47
118	0.5
119	0.46
120	0.41
121	0.38
122	0.29
123	0.26
124	0.21
125	0.19
126	0.18
127	0.16
128	0.14
129	0.14
130	0.15
131	0.14
132	0.14
133	0.13
134	0.09
135	0.09
136	0.09
137	0.07
138	0.06
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.08
148	0.09
149	0.12
150	0.17
151	0.21
152	0.23
153	0.29
154	0.31
155	0.32
156	0.34
157	0.37
158	0.42
159	0.42
160	0.44
161	0.39
162	0.41
163	0.43
164	0.4
165	0.33
166	0.24
167	0.19
168	0.15
169	0.14
170	0.1
171	0.08
172	0.07
173	0.08
174	0.08
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.11
179	0.18
180	0.18
181	0.18
182	0.17
183	0.16
184	0.16
185	0.16
186	0.15
187	0.08
188	0.08
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.06
201	0.05
202	0.06
203	0.08
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.06
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.06
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.07
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.1
238	0.1
239	0.11
240	0.17
241	0.18
242	0.22
243	0.23
244	0.25
245	0.25
246	0.3
247	0.32
248	0.25
249	0.25
250	0.21
251	0.21
252	0.18
253	0.16
254	0.11
255	0.09
256	0.1
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.13
264	0.12
265	0.17
266	0.16
267	0.2
268	0.2
269	0.21
270	0.2
271	0.2
272	0.19
273	0.15
274	0.15
275	0.13
276	0.14
277	0.13
278	0.15
279	0.12
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.13
285	0.15
286	0.15
287	0.23
288	0.27
289	0.31
290	0.38
291	0.4
292	0.44
293	0.48
294	0.55
295	0.52
296	0.55
297	0.58
298	0.49
299	0.46
300	0.43
301	0.39
302	0.29
303	0.24
304	0.18
305	0.16
306	0.16
307	0.18
308	0.16
309	0.15
310	0.16
311	0.16
312	0.15
313	0.12
314	0.13
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.12
322	0.12
323	0.17
324	0.24
325	0.35
326	0.42
327	0.47
328	0.56
329	0.62
330	0.7
331	0.76
332	0.78
333	0.79
334	0.8
335	0.81
336	0.73
337	0.65
338	0.54
339	0.44
340	0.35
341	0.25
342	0.17
343	0.13
344	0.12
345	0.1
346	0.11
347	0.11
348	0.1
349	0.1
350	0.11
351	0.11
352	0.11
353	0.12
354	0.12
355	0.14
356	0.17
357	0.17
358	0.18
359	0.17
360	0.17
361	0.17
362	0.16
363	0.17
364	0.12
365	0.13
366	0.12
367	0.1
368	0.1
369	0.09
370	0.09
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.06
380	0.05
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.04
402	0.05
403	0.06
404	0.06
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.1
409	0.11
410	0.1
411	0.11
412	0.13
413	0.13
414	0.13
415	0.14
416	0.16
417	0.2
418	0.21
419	0.21
420	0.19
421	0.22
422	0.24
423	0.26
424	0.23
425	0.18
426	0.19
427	0.2
428	0.22
429	0.18
430	0.16
431	0.13
432	0.13
433	0.15
434	0.13
435	0.14
436	0.15
437	0.17
438	0.23
439	0.32
440	0.41
441	0.48
442	0.57
443	0.66
444	0.7
445	0.78
446	0.83
447	0.84
448	0.85
449	0.87
450	0.87
451	0.87
452	0.9
453	0.85
454	0.83
455	0.8
456	0.74
457	0.65
458	0.56
459	0.47
460	0.37
461	0.31
462	0.22
463	0.14
464	0.1
465	0.07
466	0.07
467	0.06
468	0.05
469	0.06
470	0.06
471	0.09
472	0.13
473	0.15
474	0.2
475	0.22
476	0.27

B8MBQ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer