Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8MC50

Protein Details
Accession B8MC50    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-57GIIDSSRSRKKIRRHNENDLKEELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
560-592RGRGQPRGGGPRGGGQGRGGPQGGQGRGRGQPA
Subcellular Location(s) cyto 9.5, nucl 9, cyto_mito 7.5, mito 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MTEVLLSRLAQLRLGLDALDASSYDARLIEEEEGIIDSSRSRKKIRRHNENDLKEELEDEFLTPSPRFSPSWLNKLQRRWDVSIDYQDIFEVAPTQTRTIIRFNREGLEGRVTGYHEVTVPASSATAKNSTSLLRRPAARADFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEAIAEMESEMQANEQQRGIKKQGLDRIIKFGTEDGLLQVPPGFTRGLNLKKPESKAAEEDDQEVEKTLDQEEGIKVDRPETDGNVQEYKKDEDEMASEDEEEEDIDSLLPVEFPAFEPRSQLLAATAQKGGREWAHVVDVNKEISNFHDLVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFEDVGILTGDVQISPESSCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDTERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPVPLEHYLWSGKSMHKIVDANKRFIEKGWKEADDILSGRDKQKAQKAAEAQAQSQVSQRGAQQGRGRGQPRGGGPRGGGQGRGGPQGGQGRGRGQPANRGTGNIARTGRGGGRTTAAQDRNVWVHLVQHLRKENLLPACVFVFSKKRCEENANSLSNQDFCTAAEKSAIHMIIEKSLARLKPEDRVLPQILRLRELLSRGVAVHHGGLLPIMKEIVEILFARTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGKGFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGYVIIVTTGRDEAPPAGALRRMMLGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQVQLSEASLSKIKREPCTYCDVDLAACHQASVEYEKLTRDLHLGLITSPVGKRLFMIKRLVVYRKDGIRTAGIIVREGISGGEPNIQVLEIGAVSDKRHPSDILPFLPRFRPFFRDLPTSSADMSLKVCRIPLADVECVTNTLVKVTGPIWYLNIKKESLKFGDKELSKYAASWESPSWDELDWDRVKELQVREILLKRQEQAAIAQGCHCLSCPDFLKHFEMQHDEWQVKENISQLRQLMSDQNLQLLPDYEQRVEVLKELGFVDADSRVLLKGKVACEIHSADELVLTELILENVLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTENDPTLTPRLEKGKEAIIRIADKVNDFQILHQVILSSEDSNDFTSKPRFGLMEVVYEWAKGMSFNRITDLTDVMEGTIVRTITRLDETCREVKNAAKLVGDPTLYLKMQQAQEMIKRDVIFAASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.16
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.09
7 0.08
8 0.09
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.13
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.12
22 0.11
23 0.09
24 0.1
25 0.18
26 0.25
27 0.29
28 0.37
29 0.44
30 0.54
31 0.65
32 0.74
33 0.78
34 0.8
35 0.87
36 0.9
37 0.9
38 0.85
39 0.78
40 0.69
41 0.57
42 0.49
43 0.38
44 0.3
45 0.22
46 0.18
47 0.16
48 0.14
49 0.17
50 0.16
51 0.17
52 0.16
53 0.19
54 0.19
55 0.21
56 0.31
57 0.36
58 0.45
59 0.53
60 0.59
61 0.63
62 0.71
63 0.77
64 0.74
65 0.73
66 0.68
67 0.66
68 0.63
69 0.62
70 0.61
71 0.56
72 0.48
73 0.41
74 0.36
75 0.3
76 0.24
77 0.18
78 0.12
79 0.09
80 0.13
81 0.15
82 0.16
83 0.2
84 0.22
85 0.25
86 0.32
87 0.39
88 0.41
89 0.44
90 0.45
91 0.44
92 0.45
93 0.46
94 0.4
95 0.38
96 0.32
97 0.28
98 0.28
99 0.26
100 0.25
101 0.22
102 0.19
103 0.14
104 0.15
105 0.15
106 0.13
107 0.12
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.12
112 0.14
113 0.16
114 0.16
115 0.17
116 0.18
117 0.22
118 0.26
119 0.3
120 0.34
121 0.36
122 0.39
123 0.41
124 0.47
125 0.47
126 0.48
127 0.44
128 0.45
129 0.44
130 0.41
131 0.4
132 0.32
133 0.29
134 0.23
135 0.21
136 0.15
137 0.11
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.09
160 0.11
161 0.13
162 0.15
163 0.19
164 0.24
165 0.3
166 0.34
167 0.35
168 0.38
169 0.42
170 0.48
171 0.52
172 0.54
173 0.5
174 0.53
175 0.49
176 0.45
177 0.39
178 0.31
179 0.25
180 0.19
181 0.17
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.1
189 0.11
190 0.1
191 0.08
192 0.12
193 0.2
194 0.26
195 0.32
196 0.37
197 0.43
198 0.49
199 0.53
200 0.58
201 0.54
202 0.51
203 0.49
204 0.5
205 0.48
206 0.42
207 0.42
208 0.36
209 0.32
210 0.28
211 0.25
212 0.19
213 0.14
214 0.14
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.12
219 0.12
220 0.14
221 0.15
222 0.17
223 0.17
224 0.18
225 0.19
226 0.2
227 0.22
228 0.23
229 0.26
230 0.26
231 0.3
232 0.34
233 0.33
234 0.31
235 0.33
236 0.32
237 0.29
238 0.26
239 0.23
240 0.18
241 0.2
242 0.21
243 0.2
244 0.17
245 0.16
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.11
250 0.08
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.07
262 0.14
263 0.16
264 0.16
265 0.19
266 0.2
267 0.22
268 0.21
269 0.2
270 0.14
271 0.18
272 0.2
273 0.19
274 0.21
275 0.19
276 0.19
277 0.2
278 0.21
279 0.16
280 0.17
281 0.16
282 0.15
283 0.18
284 0.21
285 0.21
286 0.22
287 0.23
288 0.22
289 0.21
290 0.19
291 0.16
292 0.16
293 0.19
294 0.17
295 0.15
296 0.17
297 0.16
298 0.18
299 0.19
300 0.17
301 0.14
302 0.16
303 0.16
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.15
311 0.17
312 0.19
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.15
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.1
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.08
354 0.1
355 0.11
356 0.18
357 0.19
358 0.21
359 0.23
360 0.26
361 0.26
362 0.3
363 0.38
364 0.38
365 0.46
366 0.47
367 0.52
368 0.54
369 0.55
370 0.61
371 0.53
372 0.48
373 0.45
374 0.46
375 0.4
376 0.35
377 0.33
378 0.22
379 0.21
380 0.17
381 0.1
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.06
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.1
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.09
420 0.07
421 0.06
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.08
428 0.1
429 0.11
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.06
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.16
466 0.22
467 0.26
468 0.29
469 0.34
470 0.37
471 0.39
472 0.45
473 0.41
474 0.41
475 0.45
476 0.52
477 0.51
478 0.51
479 0.49
480 0.45
481 0.46
482 0.4
483 0.33
484 0.31
485 0.35
486 0.33
487 0.34
488 0.35
489 0.33
490 0.32
491 0.31
492 0.26
493 0.2
494 0.2
495 0.2
496 0.16
497 0.19
498 0.21
499 0.26
500 0.35
501 0.37
502 0.36
503 0.36
504 0.37
505 0.34
506 0.33
507 0.37
508 0.28
509 0.31
510 0.32
511 0.31
512 0.31
513 0.32
514 0.31
515 0.23
516 0.22
517 0.17
518 0.15
519 0.16
520 0.16
521 0.19
522 0.2
523 0.23
524 0.29
525 0.36
526 0.34
527 0.39
528 0.41
529 0.41
530 0.44
531 0.4
532 0.34
533 0.31
534 0.29
535 0.24
536 0.23
537 0.2
538 0.15
539 0.15
540 0.15
541 0.2
542 0.2
543 0.25
544 0.27
545 0.31
546 0.34
547 0.39
548 0.4
549 0.33
550 0.33
551 0.32
552 0.32
553 0.34
554 0.32
555 0.27
556 0.25
557 0.28
558 0.29
559 0.26
560 0.23
561 0.15
562 0.17
563 0.17
564 0.18
565 0.14
566 0.11
567 0.14
568 0.18
569 0.18
570 0.17
571 0.16
572 0.17
573 0.19
574 0.22
575 0.21
576 0.18
577 0.25
578 0.25
579 0.3
580 0.27
581 0.26
582 0.25
583 0.26
584 0.27
585 0.23
586 0.22
587 0.17
588 0.17
589 0.17
590 0.17
591 0.15
592 0.16
593 0.11
594 0.12
595 0.12
596 0.14
597 0.19
598 0.19
599 0.18
600 0.17
601 0.19
602 0.18
603 0.19
604 0.16
605 0.11
606 0.11
607 0.14
608 0.19
609 0.19
610 0.23
611 0.25
612 0.25
613 0.26
614 0.25
615 0.26
616 0.22
617 0.21
618 0.16
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.13
623 0.1
624 0.16
625 0.16
626 0.23
627 0.24
628 0.26
629 0.27
630 0.33
631 0.35
632 0.38
633 0.43
634 0.39
635 0.37
636 0.35
637 0.34
638 0.29
639 0.25
640 0.16
641 0.1
642 0.07
643 0.1
644 0.1
645 0.1
646 0.11
647 0.1
648 0.1
649 0.13
650 0.13
651 0.09
652 0.11
653 0.11
654 0.1
655 0.11
656 0.1
657 0.09
658 0.12
659 0.13
660 0.12
661 0.14
662 0.14
663 0.19
664 0.22
665 0.24
666 0.22
667 0.27
668 0.28
669 0.25
670 0.29
671 0.28
672 0.26
673 0.24
674 0.23
675 0.19
676 0.19
677 0.2
678 0.16
679 0.12
680 0.12
681 0.1
682 0.1
683 0.09
684 0.08
685 0.07
686 0.06
687 0.06
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.04
696 0.04
697 0.04
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.07
705 0.07
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.06
710 0.07
711 0.06
712 0.08
713 0.07
714 0.08
715 0.07
716 0.07
717 0.07
718 0.06
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.07
724 0.07
725 0.07
726 0.07
727 0.08
728 0.1
729 0.12
730 0.18
731 0.19
732 0.24
733 0.25
734 0.25
735 0.28
736 0.31
737 0.31
738 0.34
739 0.35
740 0.32
741 0.33
742 0.33
743 0.29
744 0.26
745 0.23
746 0.17
747 0.14
748 0.13
749 0.1
750 0.11
751 0.09
752 0.08
753 0.09
754 0.11
755 0.11
756 0.12
757 0.12
758 0.12
759 0.12
760 0.12
761 0.11
762 0.09
763 0.09
764 0.08
765 0.07
766 0.06
767 0.06
768 0.05
769 0.04
770 0.04
771 0.05
772 0.05
773 0.05
774 0.06
775 0.06
776 0.07
777 0.08
778 0.08
779 0.08
780 0.09
781 0.09
782 0.09
783 0.1
784 0.09
785 0.08
786 0.12
787 0.13
788 0.15
789 0.17
790 0.19
791 0.21
792 0.24
793 0.25
794 0.24
795 0.28
796 0.32
797 0.33
798 0.37
799 0.36
800 0.38
801 0.38
802 0.36
803 0.32
804 0.25
805 0.22
806 0.15
807 0.13
808 0.09
809 0.07
810 0.06
811 0.05
812 0.06
813 0.06
814 0.07
815 0.09
816 0.11
817 0.13
818 0.14
819 0.14
820 0.15
821 0.16
822 0.18
823 0.17
824 0.2
825 0.2
826 0.2
827 0.21
828 0.2
829 0.19
830 0.17
831 0.17
832 0.15
833 0.15
834 0.15
835 0.16
836 0.16
837 0.16
838 0.17
839 0.17
840 0.14
841 0.12
842 0.12
843 0.11
844 0.12
845 0.15
846 0.14
847 0.16
848 0.2
849 0.24
850 0.27
851 0.32
852 0.34
853 0.34
854 0.42
855 0.41
856 0.38
857 0.35
858 0.3
859 0.24
860 0.21
861 0.2
862 0.14
863 0.12
864 0.1
865 0.09
866 0.09
867 0.1
868 0.13
869 0.12
870 0.11
871 0.12
872 0.13
873 0.14
874 0.15
875 0.14
876 0.12
877 0.12
878 0.12
879 0.12
880 0.11
881 0.1
882 0.11
883 0.1
884 0.1
885 0.1
886 0.12
887 0.12
888 0.11
889 0.12
890 0.19
891 0.24
892 0.27
893 0.31
894 0.29
895 0.34
896 0.39
897 0.44
898 0.37
899 0.38
900 0.39
901 0.39
902 0.4
903 0.37
904 0.33
905 0.3
906 0.28
907 0.26
908 0.23
909 0.18
910 0.16
911 0.15
912 0.14
913 0.12
914 0.11
915 0.09
916 0.06
917 0.07
918 0.07
919 0.09
920 0.09
921 0.09
922 0.09
923 0.09
924 0.08
925 0.07
926 0.07
927 0.04
928 0.04
929 0.05
930 0.05
931 0.07
932 0.12
933 0.14
934 0.15
935 0.17
936 0.17
937 0.19
938 0.26
939 0.31
940 0.3
941 0.34
942 0.34
943 0.35
944 0.4
945 0.4
946 0.36
947 0.34
948 0.35
949 0.35
950 0.39
951 0.42
952 0.44
953 0.43
954 0.43
955 0.42
956 0.38
957 0.33
958 0.31
959 0.26
960 0.2
961 0.2
962 0.18
963 0.17
964 0.16
965 0.15
966 0.13
967 0.14
968 0.15
969 0.17
970 0.18
971 0.19
972 0.19
973 0.2
974 0.2
975 0.19
976 0.18
977 0.15
978 0.11
979 0.1
980 0.1
981 0.08
982 0.09
983 0.09
984 0.12
985 0.12
986 0.12
987 0.13
988 0.18
989 0.21
990 0.24
991 0.27
992 0.25
993 0.28
994 0.3
995 0.35
996 0.35
997 0.39
998 0.35
999 0.37
1000 0.43
1001 0.41
1002 0.42
1003 0.39
1004 0.37
1005 0.3
1006 0.29
1007 0.29
1008 0.25
1009 0.24
1010 0.23
1011 0.2
1012 0.21
1013 0.21
1014 0.22
1015 0.2
1016 0.16
1017 0.17
1018 0.15
1019 0.23
1020 0.21
1021 0.21
1022 0.21
1023 0.21
1024 0.22
1025 0.27
1026 0.27
1027 0.25
1028 0.25
1029 0.26
1030 0.31
1031 0.34
1032 0.37
1033 0.36
1034 0.37
1035 0.33
1036 0.34
1037 0.33
1038 0.29
1039 0.26
1040 0.29
1041 0.26
1042 0.24
1043 0.23
1044 0.22
1045 0.2
1046 0.2
1047 0.18
1048 0.12
1049 0.11
1050 0.16
1051 0.19
1052 0.23
1053 0.25
1054 0.29
1055 0.34
1056 0.35
1057 0.37
1058 0.35
1059 0.36
1060 0.34
1061 0.38
1062 0.39
1063 0.35
1064 0.31
1065 0.34
1066 0.32
1067 0.27
1068 0.25
1069 0.24
1070 0.26
1071 0.27
1072 0.3
1073 0.26
1074 0.27
1075 0.26
1076 0.27
1077 0.27
1078 0.24
1079 0.28
1080 0.25
1081 0.27
1082 0.25
1083 0.25
1084 0.24
1085 0.2
1086 0.19
1087 0.19
1088 0.22
1089 0.19
1090 0.19
1091 0.2
1092 0.22
1093 0.21
1094 0.2
1095 0.16
1096 0.14
1097 0.15
1098 0.15
1099 0.15
1100 0.12
1101 0.11
1102 0.11
1103 0.09
1104 0.09
1105 0.08
1106 0.08
1107 0.08
1108 0.1
1109 0.1
1110 0.13
1111 0.16
1112 0.17
1113 0.24
1114 0.24
1115 0.25
1116 0.27
1117 0.29
1118 0.27
1119 0.24
1120 0.24
1121 0.17
1122 0.17
1123 0.16
1124 0.13
1125 0.11
1126 0.09
1127 0.07
1128 0.07
1129 0.07
1130 0.06
1131 0.05
1132 0.04
1133 0.04
1134 0.05
1135 0.04
1136 0.04
1137 0.05
1138 0.06
1139 0.06
1140 0.06
1141 0.06
1142 0.06
1143 0.06
1144 0.06
1145 0.06
1146 0.04
1147 0.04
1148 0.05
1149 0.05
1150 0.05
1151 0.06
1152 0.05
1153 0.1
1154 0.11
1155 0.17
1156 0.21
1157 0.23
1158 0.24
1159 0.27
1160 0.31
1161 0.33
1162 0.35
1163 0.31
1164 0.32
1165 0.38
1166 0.39
1167 0.38
1168 0.37
1169 0.39
1170 0.41
1171 0.42
1172 0.41
1173 0.38
1174 0.38
1175 0.37
1176 0.38
1177 0.32
1178 0.29
1179 0.29
1180 0.27
1181 0.26
1182 0.24
1183 0.23
1184 0.27
1185 0.26
1186 0.24
1187 0.22
1188 0.2
1189 0.16
1190 0.19
1191 0.2
1192 0.12
1193 0.11
1194 0.13
1195 0.14
1196 0.16
1197 0.17
1198 0.15
1199 0.18
1200 0.23
1201 0.24
1202 0.23
1203 0.25
1204 0.23
1205 0.23
1206 0.3
1207 0.27
1208 0.27
1209 0.26
1210 0.28
1211 0.25
1212 0.24
1213 0.23
1214 0.15
1215 0.14
1216 0.1
1217 0.12
1218 0.18
1219 0.21
1220 0.22
1221 0.25
1222 0.26
1223 0.28
1224 0.28
1225 0.28
1226 0.2
1227 0.18
1228 0.17
1229 0.14
1230 0.14
1231 0.12
1232 0.11
1233 0.13
1234 0.11
1235 0.1
1236 0.11
1237 0.12
1238 0.13
1239 0.19
1240 0.2
1241 0.22
1242 0.28
1243 0.34
1244 0.4
1245 0.42
1246 0.42
1247 0.39
1248 0.42
1249 0.46
1250 0.46
1251 0.43
1252 0.37
1253 0.36
1254 0.37
1255 0.39
1256 0.34
1257 0.26
1258 0.23
1259 0.25
1260 0.24
1261 0.24
1262 0.24
1263 0.26
1264 0.28
1265 0.31
1266 0.31
1267 0.31
1268 0.38
1269 0.43
1270 0.42
1271 0.4
1272 0.38
1273 0.36
1274 0.33
1275 0.29
1276 0.23