Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8LTJ6

Protein Details
Accession B8LTJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
362-384ILAQGIRTKHRRRTKAATTSSESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
425-429KGPRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 11.833, mito 10, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MSYALEAKKRKFTRVLESLSKPLATSDGGAKPIKDPLMAARERLADATTSPSIKRVRVGEGIVDNLTTKTTVSRILRTTSSSTNLRPNFVPWDRERFLERLETFRPVTRWTSQPAPINEVEWAKRGWTCTDYMRVACVGGCGASIVVKLPEEVDDFEDLDSEKVQERKEVRQKVVEEYRKLLSDGHKETCLWRNKSCDATIHRLPITNTDTAINALRERYLKISKMRDQLPSNETIELPEQLSLEEIISQLPPNFPESEKGESSQETNTSGKEIDYRSFTFAFFGWDVVKDGSSGLLECRACFRRLGLWLYKPKEEGKEPVYDKLPVHTEHMDYCPWINGTAQSGTGTTTDKPENLLGGWQILAQGIRTKHRRRTKAATTSSESLAVDSDNLSLDSTATDEATQRAKDREWWSKLRRVREALHVKGPRKSVSGEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.7
3 0.68
4 0.7
5 0.68
6 0.62
7 0.55
8 0.45
9 0.36
10 0.3
11 0.22
12 0.19
13 0.2
14 0.21
15 0.26
16 0.27
17 0.27
18 0.26
19 0.31
20 0.3
21 0.24
22 0.21
23 0.24
24 0.32
25 0.32
26 0.32
27 0.3
28 0.31
29 0.32
30 0.31
31 0.25
32 0.16
33 0.16
34 0.2
35 0.2
36 0.2
37 0.19
38 0.25
39 0.27
40 0.28
41 0.33
42 0.3
43 0.32
44 0.35
45 0.36
46 0.35
47 0.33
48 0.34
49 0.29
50 0.26
51 0.21
52 0.17
53 0.16
54 0.11
55 0.09
56 0.08
57 0.1
58 0.17
59 0.2
60 0.25
61 0.28
62 0.31
63 0.33
64 0.35
65 0.38
66 0.35
67 0.37
68 0.35
69 0.35
70 0.41
71 0.41
72 0.4
73 0.37
74 0.36
75 0.39
76 0.39
77 0.42
78 0.37
79 0.44
80 0.42
81 0.44
82 0.45
83 0.37
84 0.36
85 0.37
86 0.35
87 0.31
88 0.32
89 0.34
90 0.32
91 0.34
92 0.34
93 0.28
94 0.32
95 0.31
96 0.32
97 0.32
98 0.36
99 0.38
100 0.43
101 0.42
102 0.43
103 0.39
104 0.36
105 0.35
106 0.32
107 0.28
108 0.22
109 0.2
110 0.16
111 0.17
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.18
116 0.19
117 0.25
118 0.26
119 0.25
120 0.25
121 0.22
122 0.2
123 0.18
124 0.15
125 0.09
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.09
150 0.12
151 0.12
152 0.17
153 0.2
154 0.29
155 0.39
156 0.45
157 0.44
158 0.48
159 0.5
160 0.52
161 0.59
162 0.56
163 0.48
164 0.44
165 0.43
166 0.38
167 0.36
168 0.31
169 0.26
170 0.27
171 0.29
172 0.28
173 0.28
174 0.27
175 0.3
176 0.35
177 0.39
178 0.35
179 0.34
180 0.37
181 0.39
182 0.42
183 0.4
184 0.38
185 0.34
186 0.37
187 0.37
188 0.35
189 0.33
190 0.32
191 0.31
192 0.3
193 0.28
194 0.22
195 0.19
196 0.16
197 0.16
198 0.15
199 0.16
200 0.11
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.14
207 0.15
208 0.18
209 0.24
210 0.3
211 0.35
212 0.4
213 0.43
214 0.44
215 0.44
216 0.45
217 0.42
218 0.38
219 0.33
220 0.28
221 0.25
222 0.2
223 0.19
224 0.14
225 0.12
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.13
244 0.16
245 0.2
246 0.21
247 0.21
248 0.21
249 0.2
250 0.21
251 0.19
252 0.17
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.14
260 0.15
261 0.14
262 0.18
263 0.19
264 0.21
265 0.21
266 0.21
267 0.18
268 0.17
269 0.18
270 0.14
271 0.13
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.12
276 0.12
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.17
287 0.19
288 0.2
289 0.2
290 0.21
291 0.21
292 0.25
293 0.31
294 0.31
295 0.36
296 0.44
297 0.47
298 0.48
299 0.45
300 0.45
301 0.44
302 0.41
303 0.39
304 0.34
305 0.39
306 0.39
307 0.41
308 0.4
309 0.38
310 0.35
311 0.33
312 0.34
313 0.26
314 0.28
315 0.26
316 0.25
317 0.24
318 0.26
319 0.23
320 0.2
321 0.19
322 0.17
323 0.16
324 0.15
325 0.13
326 0.12
327 0.15
328 0.15
329 0.14
330 0.13
331 0.12
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.11
336 0.15
337 0.16
338 0.16
339 0.18
340 0.18
341 0.18
342 0.16
343 0.17
344 0.14
345 0.12
346 0.12
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.08
352 0.13
353 0.15
354 0.23
355 0.33
356 0.41
357 0.5
358 0.6
359 0.68
360 0.71
361 0.78
362 0.81
363 0.82
364 0.83
365 0.8
366 0.77
367 0.72
368 0.65
369 0.57
370 0.46
371 0.36
372 0.28
373 0.21
374 0.14
375 0.11
376 0.1
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.12
389 0.17
390 0.19
391 0.21
392 0.24
393 0.26
394 0.34
395 0.41
396 0.49
397 0.52
398 0.6
399 0.64
400 0.7
401 0.75
402 0.76
403 0.76
404 0.72
405 0.69
406 0.7
407 0.73
408 0.69
409 0.73
410 0.72
411 0.68
412 0.67
413 0.67
414 0.6
415 0.53