Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3CGT1

Protein Details
Accession A0A2H3CGT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
544-568GVYSAPPPIPPKRRKPPAVPARSAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
553-561PPKRRKPPA
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MSLAMEDDFGIVYVVENAQQFWSELDDILTMPRGAPPTLQQLDGMMSRWLGICGIYHELYLQTPLQLEHAVDLLLDSELWAFHSERMCENLTETAKSNTDPHAQLVTFNVLLRYGQRKTDFFRAQKRWGTLVPLLMDHTLVEIDENEDGVIEAKLRLVGVRLLYEVCRWQKLSVAELRVFDDSFIDYLFDLVEQTRHVQDETFNYSVIRLIVAFNEQFMVASICDREQSGVEKNRVLRVLMRRLGSSKTFGENMIFMLNRAQRTPDDLCMQLLVLKLIYLLFTTKGTEEYFYTNDLCVLVDVFLREVVDLDEDSESLRHTYLRVLHPLLTKTQLKDVPYKRPQIKYALESLVRDSRIHDINPTTKRLVERCLGGQWCVQLKKSDDVSRSSTPSDTVAPSRSHLGLPASVDGVGSGTPGKSLKSSRSAENLVAKGVNGMNGSKVTRVGAVRRPSNASAGSFSGVATAAPSPSTSKPPIPHPRRKGTASSEHVERLHIERPSHSHYIDLSAQSDAGGEPARTKHRKPPPAPVAVSAPSSPAFRQPGVYSAPPPIPPKRRKPPAVPARSAGHATVFETIKTSAASPLTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.09
3 0.1
4 0.1
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.11
9 0.14
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.13
16 0.15
17 0.11
18 0.11
19 0.13
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.19
24 0.27
25 0.29
26 0.29
27 0.26
28 0.25
29 0.27
30 0.27
31 0.24
32 0.15
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.1
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.15
46 0.15
47 0.17
48 0.15
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.13
53 0.14
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.06
67 0.08
68 0.09
69 0.12
70 0.16
71 0.18
72 0.19
73 0.23
74 0.24
75 0.23
76 0.24
77 0.27
78 0.25
79 0.26
80 0.26
81 0.26
82 0.25
83 0.26
84 0.26
85 0.24
86 0.28
87 0.27
88 0.28
89 0.29
90 0.28
91 0.27
92 0.27
93 0.26
94 0.2
95 0.2
96 0.17
97 0.13
98 0.13
99 0.17
100 0.21
101 0.2
102 0.25
103 0.29
104 0.31
105 0.36
106 0.46
107 0.51
108 0.52
109 0.6
110 0.62
111 0.66
112 0.69
113 0.67
114 0.6
115 0.53
116 0.52
117 0.43
118 0.4
119 0.32
120 0.27
121 0.25
122 0.21
123 0.19
124 0.14
125 0.12
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.18
153 0.18
154 0.2
155 0.21
156 0.2
157 0.24
158 0.25
159 0.29
160 0.28
161 0.3
162 0.29
163 0.29
164 0.31
165 0.27
166 0.25
167 0.2
168 0.15
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.12
187 0.16
188 0.21
189 0.2
190 0.19
191 0.18
192 0.18
193 0.18
194 0.16
195 0.12
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.1
216 0.17
217 0.22
218 0.24
219 0.27
220 0.28
221 0.31
222 0.31
223 0.28
224 0.27
225 0.28
226 0.34
227 0.35
228 0.35
229 0.32
230 0.33
231 0.35
232 0.31
233 0.27
234 0.21
235 0.19
236 0.19
237 0.18
238 0.17
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.1
243 0.08
244 0.12
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.15
249 0.13
250 0.19
251 0.2
252 0.19
253 0.19
254 0.18
255 0.18
256 0.17
257 0.16
258 0.13
259 0.11
260 0.08
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.08
308 0.14
309 0.16
310 0.19
311 0.2
312 0.23
313 0.25
314 0.26
315 0.25
316 0.24
317 0.24
318 0.21
319 0.26
320 0.25
321 0.25
322 0.33
323 0.36
324 0.41
325 0.45
326 0.53
327 0.54
328 0.55
329 0.56
330 0.54
331 0.54
332 0.46
333 0.45
334 0.4
335 0.35
336 0.32
337 0.32
338 0.28
339 0.25
340 0.23
341 0.19
342 0.2
343 0.21
344 0.21
345 0.2
346 0.2
347 0.27
348 0.3
349 0.32
350 0.29
351 0.29
352 0.32
353 0.31
354 0.31
355 0.26
356 0.25
357 0.23
358 0.27
359 0.26
360 0.24
361 0.23
362 0.22
363 0.25
364 0.24
365 0.23
366 0.22
367 0.24
368 0.28
369 0.32
370 0.34
371 0.31
372 0.34
373 0.39
374 0.38
375 0.38
376 0.34
377 0.29
378 0.25
379 0.24
380 0.22
381 0.18
382 0.17
383 0.19
384 0.18
385 0.19
386 0.21
387 0.2
388 0.18
389 0.18
390 0.17
391 0.15
392 0.15
393 0.15
394 0.12
395 0.11
396 0.11
397 0.09
398 0.08
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.04
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.1
407 0.13
408 0.17
409 0.25
410 0.28
411 0.31
412 0.36
413 0.38
414 0.39
415 0.43
416 0.39
417 0.32
418 0.29
419 0.25
420 0.22
421 0.19
422 0.17
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.13
427 0.13
428 0.12
429 0.12
430 0.11
431 0.14
432 0.16
433 0.2
434 0.26
435 0.33
436 0.36
437 0.38
438 0.42
439 0.4
440 0.41
441 0.38
442 0.32
443 0.27
444 0.25
445 0.23
446 0.18
447 0.16
448 0.13
449 0.11
450 0.09
451 0.08
452 0.07
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.1
457 0.13
458 0.19
459 0.21
460 0.26
461 0.3
462 0.4
463 0.51
464 0.57
465 0.66
466 0.69
467 0.75
468 0.77
469 0.78
470 0.75
471 0.72
472 0.72
473 0.67
474 0.63
475 0.56
476 0.54
477 0.5
478 0.43
479 0.38
480 0.31
481 0.31
482 0.3
483 0.28
484 0.27
485 0.32
486 0.38
487 0.4
488 0.36
489 0.32
490 0.29
491 0.33
492 0.34
493 0.3
494 0.24
495 0.21
496 0.2
497 0.18
498 0.18
499 0.12
500 0.1
501 0.1
502 0.09
503 0.11
504 0.17
505 0.27
506 0.32
507 0.36
508 0.44
509 0.54
510 0.64
511 0.66
512 0.73
513 0.72
514 0.76
515 0.75
516 0.68
517 0.63
518 0.55
519 0.52
520 0.41
521 0.34
522 0.26
523 0.26
524 0.23
525 0.24
526 0.26
527 0.24
528 0.27
529 0.26
530 0.29
531 0.33
532 0.35
533 0.3
534 0.31
535 0.34
536 0.35
537 0.4
538 0.45
539 0.5
540 0.57
541 0.66
542 0.72
543 0.79
544 0.83
545 0.87
546 0.88
547 0.89
548 0.89
549 0.84
550 0.78
551 0.72
552 0.66
553 0.59
554 0.49
555 0.4
556 0.31
557 0.27
558 0.28
559 0.24
560 0.2
561 0.2
562 0.2
563 0.18
564 0.18
565 0.18
566 0.16