FuNGI

A0A0D1DYB0

Protein Details

Accession

A0A0D1DYB0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
329-351	IEENNARRLRKRRRTGKFPVPPE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
335-345	RRLRKRRRTGK
464-468	RSRRS

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 7, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0003682 F:chromatin binding GO:0000993 F:RNA polymerase II complex binding GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	uma:UMAG_04610 -
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSYPNANGAGPGATAAGSSSRSKRELIDRVRYPNPIPVPPYPPKLVKIRTEPSRYANPHFADRLASQQPIPLMVDVHAGMPIDLANFQNLWEGDLSEVVVPAQAKLEPKHLDDADAFLLQDFAANLPPTASSNSTSGAIGLITSLKASDDPASQATLQAALQQRHVQSLGPGAKAALAADDVTWLRRTEYLSAQQKNAQQQVHKPKVTERIDVSRQAQLAKIQNSFTDAQKPLSSLVHPHKKGVKAEKVFDFLPDPETWATDYQVVRFIDHPGRIINGVPQPDPRLDVALLRPVNAADGEQRVSYYLPAGEHVPEDPEAPMTLIDNRDIEENNARRLRKRRRTGKFPVPPEAGDDDDDIDDENRPEPKLLKKDYATPFKLSRDYVPKDSTESAHDVLLLTLDDGIPDVDPDADVDPIKGIKSAPAQTEDEDDLFGEDDDDAQDGADSRLDSTLPPQSEFERQKRSRRSAATKGKERSEQPDGQGLTSESRPKARAYYHKVGMRFTLRVWRSRFANNEKLRNRDRRYPGKWDAIILSNRELQENEKLRRLHARSQVDDVGELEPYEPEDEFEEALVQDEAAEVTSNRAAEHLFEERDEAVERADGHVDATARSRASDEDDQVDEQINDDGEDDRSDDDEDEDDDEDGTVDGDEELAALRAEAGEAGQVLGQDVGGGGRQSRTRRAAAAPSESDTLAAARDVEDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.07
3	0.08
4	0.1
5	0.15
6	0.2
7	0.25
8	0.27
9	0.29
10	0.34
11	0.42
12	0.49
13	0.53
14	0.59
15	0.61
16	0.66
17	0.7
18	0.68
19	0.61
20	0.59
21	0.56
22	0.51
23	0.49
24	0.47
25	0.51
26	0.53
27	0.57
28	0.54
29	0.53
30	0.53
31	0.57
32	0.58
33	0.58
34	0.6
35	0.63
36	0.67
37	0.7
38	0.7
39	0.67
40	0.7
41	0.67
42	0.64
43	0.63
44	0.57
45	0.56
46	0.53
47	0.48
48	0.41
49	0.37
50	0.38
51	0.33
52	0.32
53	0.26
54	0.27
55	0.26
56	0.24
57	0.24
58	0.17
59	0.15
60	0.13
61	0.15
62	0.13
63	0.13
64	0.12
65	0.1
66	0.09
67	0.09
68	0.08
69	0.07
70	0.08
71	0.08
72	0.08
73	0.08
74	0.09
75	0.13
76	0.13
77	0.14
78	0.13
79	0.13
80	0.12
81	0.12
82	0.13
83	0.08
84	0.08
85	0.07
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.09
90	0.1
91	0.14
92	0.16
93	0.23
94	0.24
95	0.26
96	0.33
97	0.32
98	0.32
99	0.29
100	0.3
101	0.25
102	0.23
103	0.2
104	0.13
105	0.13
106	0.1
107	0.1
108	0.08
109	0.06
110	0.09
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.1
115	0.11
116	0.14
117	0.15
118	0.14
119	0.15
120	0.16
121	0.17
122	0.16
123	0.15
124	0.12
125	0.1
126	0.08
127	0.07
128	0.06
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.06
134	0.07
135	0.09
136	0.1
137	0.12
138	0.13
139	0.15
140	0.14
141	0.15
142	0.14
143	0.13
144	0.11
145	0.15
146	0.19
147	0.18
148	0.21
149	0.25
150	0.25
151	0.26
152	0.26
153	0.21
154	0.17
155	0.24
156	0.25
157	0.21
158	0.2
159	0.18
160	0.18
161	0.18
162	0.17
163	0.09
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.07
168	0.07
169	0.09
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.12
174	0.15
175	0.16
176	0.22
177	0.3
178	0.37
179	0.4
180	0.41
181	0.44
182	0.46
183	0.49
184	0.49
185	0.43
186	0.37
187	0.44
188	0.53
189	0.57
190	0.55
191	0.49
192	0.49
193	0.56
194	0.56
195	0.52
196	0.45
197	0.44
198	0.46
199	0.5
200	0.47
201	0.4
202	0.37
203	0.33
204	0.3
205	0.27
206	0.3
207	0.29
208	0.28
209	0.25
210	0.24
211	0.27
212	0.28
213	0.24
214	0.25
215	0.22
216	0.22
217	0.23
218	0.23
219	0.21
220	0.21
221	0.2
222	0.19
223	0.27
224	0.35
225	0.35
226	0.39
227	0.43
228	0.46
229	0.52
230	0.55
231	0.55
232	0.49
233	0.53
234	0.52
235	0.49
236	0.44
237	0.39
238	0.32
239	0.23
240	0.22
241	0.17
242	0.16
243	0.13
244	0.14
245	0.14
246	0.13
247	0.13
248	0.14
249	0.15
250	0.13
251	0.19
252	0.18
253	0.18
254	0.18
255	0.21
256	0.21
257	0.21
258	0.22
259	0.16
260	0.17
261	0.16
262	0.16
263	0.16
264	0.15
265	0.16
266	0.16
267	0.17
268	0.18
269	0.18
270	0.19
271	0.15
272	0.14
273	0.13
274	0.14
275	0.13
276	0.18
277	0.18
278	0.17
279	0.17
280	0.14
281	0.15
282	0.13
283	0.12
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.09
290	0.09
291	0.08
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.07
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.08
300	0.09
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.08
310	0.07
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.09
315	0.09
316	0.1
317	0.16
318	0.17
319	0.22
320	0.27
321	0.27
322	0.32
323	0.42
324	0.51
325	0.54
326	0.63
327	0.67
328	0.72
329	0.81
330	0.84
331	0.85
332	0.83
333	0.76
334	0.73
335	0.64
336	0.55
337	0.49
338	0.41
339	0.31
340	0.23
341	0.19
342	0.13
343	0.11
344	0.1
345	0.08
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.09
353	0.11
354	0.17
355	0.24
356	0.27
357	0.31
358	0.31
359	0.39
360	0.46
361	0.52
362	0.48
363	0.44
364	0.44
365	0.41
366	0.43
367	0.35
368	0.33
369	0.33
370	0.34
371	0.35
372	0.34
373	0.32
374	0.32
375	0.33
376	0.29
377	0.23
378	0.22
379	0.18
380	0.16
381	0.16
382	0.13
383	0.11
384	0.1
385	0.07
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.03
390	0.03
391	0.04
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.04
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.08
408	0.13
409	0.16
410	0.17
411	0.2
412	0.21
413	0.21
414	0.24
415	0.22
416	0.18
417	0.15
418	0.13
419	0.1
420	0.09
421	0.08
422	0.06
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.05
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.09
439	0.14
440	0.14
441	0.15
442	0.16
443	0.18
444	0.26
445	0.33
446	0.37
447	0.43
448	0.47
449	0.56
450	0.64
451	0.68
452	0.68
453	0.7
454	0.72
455	0.72
456	0.77
457	0.77
458	0.77
459	0.75
460	0.72
461	0.68
462	0.63
463	0.58
464	0.55
465	0.49
466	0.42
467	0.43
468	0.39
469	0.34
470	0.33
471	0.27
472	0.22
473	0.21
474	0.24
475	0.18
476	0.21
477	0.23
478	0.23
479	0.26
480	0.31
481	0.38
482	0.43
483	0.5
484	0.54
485	0.56
486	0.56
487	0.53
488	0.51
489	0.45
490	0.37
491	0.3
492	0.32
493	0.3
494	0.36
495	0.38
496	0.38
497	0.38
498	0.43
499	0.5
500	0.49
501	0.57
502	0.57
503	0.63
504	0.63
505	0.68
506	0.7
507	0.72
508	0.7
509	0.7
510	0.73
511	0.73
512	0.74
513	0.76
514	0.74
515	0.73
516	0.67
517	0.59
518	0.53
519	0.48
520	0.45
521	0.38
522	0.33
523	0.28
524	0.28
525	0.27
526	0.25
527	0.21
528	0.27
529	0.34
530	0.34
531	0.37
532	0.37
533	0.39
534	0.48
535	0.5
536	0.5
537	0.51
538	0.55
539	0.51
540	0.56
541	0.57
542	0.48
543	0.43
544	0.35
545	0.27
546	0.19
547	0.16
548	0.11
549	0.08
550	0.09
551	0.09
552	0.08
553	0.08
554	0.09
555	0.1
556	0.1
557	0.1
558	0.1
559	0.09
560	0.1
561	0.09
562	0.07
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.05
567	0.06
568	0.05
569	0.07
570	0.09
571	0.09
572	0.09
573	0.1
574	0.1
575	0.1
576	0.14
577	0.17
578	0.16
579	0.16
580	0.18
581	0.18
582	0.19
583	0.2
584	0.16
585	0.12
586	0.13
587	0.13
588	0.13
589	0.14
590	0.12
591	0.11
592	0.13
593	0.13
594	0.12
595	0.15
596	0.16
597	0.15
598	0.15
599	0.16
600	0.15
601	0.22
602	0.26
603	0.26
604	0.27
605	0.29
606	0.29
607	0.29
608	0.3
609	0.22
610	0.18
611	0.16
612	0.12
613	0.1
614	0.1
615	0.11
616	0.1
617	0.11
618	0.11
619	0.1
620	0.11
621	0.12
622	0.12
623	0.12
624	0.12
625	0.12
626	0.13
627	0.13
628	0.12
629	0.11
630	0.11
631	0.1
632	0.09
633	0.08
634	0.06
635	0.06
636	0.05
637	0.05
638	0.05
639	0.04
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.07
655	0.07
656	0.06
657	0.05
658	0.05
659	0.05
660	0.06
661	0.07
662	0.08
663	0.12
664	0.18
665	0.22
666	0.31
667	0.36
668	0.38
669	0.42
670	0.46
671	0.51
672	0.52
673	0.56
674	0.5
675	0.48
676	0.47
677	0.42
678	0.37
679	0.29
680	0.23
681	0.15
682	0.13
683	0.1

A0A0D1DYB0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer