Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B8M3F6

Protein Details
Accession B8M3F6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-24ISKPAASQPPKMKRPPPSFTHydrophilic
395-414SPLHCARPPSPKRRKRTVAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
405-409PKRRK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10.5, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAISKPAASQPPKMKRPPPSFTQSNSVVNGIKQSPSTTSSPALASKRLPGANQQTANGIATPMGNGALNRPVNRPRKDNQKPGDISTSRPQRATTRASVAEADRRVTKIPPEPFVKTSQYILKKYSKSPPSLILHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRSQTIPHDMLEELLRANVKFYEGCLIVKVVDHKSVSAKTNKTTATSTDEKNTPFSIHNYNQHVTPSPYVPYPKQNQIKSEVNDLSKSDIPEKKHDPDSADSTTNNKPATENGTAGTTNESGKQPEHIPRVFTTVLHPTPLSLQAELTYLSTTPHPHANANSAATKKQPTTAQPQNKSSGQPPTKRQKMLVDPEDLPKFEATLIRAVAPPVYLDPVDSFESAQELLRLMESPLHCARPPSPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPATSGAAAGAKIAVDDTAGAVPFEPRFSRFKTIENIRMQHEEKAKREHEKKLQQEQAKRQQQQEQERERRRLLEQRQEELAKEERRQQLAAQHAQAQLAAQQQQRLAQVSQGQMSSPVVRNQTPHATSSPVVGSGIVTQGGVPMSMTASTPRAGSPPRPPSTMQHAHPAMMGHPMAPSRSQQSHSRNGTPQMTQGTPAMSHATPIMRNVTPNQRMPHGSPPTTTLTQTPVMGNAMMGTPQMGAGMGLTPQQQQQLMLQQRQHQQMLAQQGLTPQQYAQLQAQQNIQNHHQQQVLNQQQQVQQNQMPQHQMPQQYYQAQLIRNQMQQMQMAQQKQNHQQQGGMQMTPQQQQQQQQQMFMAAAQANANQGQVPQTAQNARYQQMFKQRLQASRQEMQKRFQSQYGSPQQYPPPIAQQYFSGLENAARAWIQEVMRRENLQAQQRQQAAIIQQQQMMANGMGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.74
3 0.75
4 0.76
5 0.81
6 0.8
7 0.77
8 0.76
9 0.74
10 0.69
11 0.69
12 0.64
13 0.59
14 0.54
15 0.5
16 0.42
17 0.36
18 0.37
19 0.31
20 0.28
21 0.24
22 0.24
23 0.24
24 0.26
25 0.29
26 0.27
27 0.27
28 0.27
29 0.28
30 0.33
31 0.33
32 0.32
33 0.31
34 0.33
35 0.38
36 0.38
37 0.37
38 0.39
39 0.46
40 0.51
41 0.51
42 0.47
43 0.42
44 0.41
45 0.41
46 0.32
47 0.23
48 0.14
49 0.12
50 0.12
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.18
57 0.22
58 0.23
59 0.29
60 0.38
61 0.47
62 0.53
63 0.57
64 0.57
65 0.64
66 0.72
67 0.77
68 0.75
69 0.76
70 0.73
71 0.72
72 0.74
73 0.64
74 0.59
75 0.59
76 0.62
77 0.54
78 0.52
79 0.5
80 0.45
81 0.51
82 0.52
83 0.48
84 0.45
85 0.44
86 0.45
87 0.45
88 0.42
89 0.43
90 0.38
91 0.35
92 0.3
93 0.3
94 0.3
95 0.3
96 0.33
97 0.34
98 0.37
99 0.41
100 0.44
101 0.47
102 0.48
103 0.51
104 0.5
105 0.43
106 0.42
107 0.44
108 0.46
109 0.44
110 0.48
111 0.51
112 0.5
113 0.54
114 0.6
115 0.59
116 0.56
117 0.57
118 0.59
119 0.56
120 0.56
121 0.53
122 0.47
123 0.47
124 0.44
125 0.43
126 0.39
127 0.35
128 0.36
129 0.34
130 0.33
131 0.29
132 0.3
133 0.36
134 0.33
135 0.37
136 0.36
137 0.39
138 0.37
139 0.33
140 0.33
141 0.28
142 0.26
143 0.22
144 0.19
145 0.15
146 0.15
147 0.17
148 0.2
149 0.18
150 0.21
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.23
155 0.24
156 0.24
157 0.23
158 0.2
159 0.2
160 0.18
161 0.19
162 0.19
163 0.16
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.1
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.15
174 0.14
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.13
179 0.15
180 0.19
181 0.16
182 0.19
183 0.19
184 0.19
185 0.23
186 0.26
187 0.3
188 0.34
189 0.35
190 0.33
191 0.39
192 0.39
193 0.37
194 0.35
195 0.33
196 0.32
197 0.34
198 0.34
199 0.33
200 0.36
201 0.34
202 0.35
203 0.33
204 0.29
205 0.26
206 0.27
207 0.3
208 0.31
209 0.37
210 0.41
211 0.4
212 0.39
213 0.39
214 0.38
215 0.32
216 0.29
217 0.24
218 0.2
219 0.22
220 0.26
221 0.27
222 0.32
223 0.35
224 0.43
225 0.49
226 0.51
227 0.51
228 0.54
229 0.59
230 0.52
231 0.55
232 0.49
233 0.43
234 0.41
235 0.38
236 0.35
237 0.3
238 0.29
239 0.29
240 0.29
241 0.3
242 0.36
243 0.42
244 0.43
245 0.45
246 0.46
247 0.43
248 0.43
249 0.45
250 0.42
251 0.38
252 0.33
253 0.32
254 0.34
255 0.33
256 0.29
257 0.24
258 0.21
259 0.21
260 0.27
261 0.24
262 0.21
263 0.18
264 0.19
265 0.19
266 0.19
267 0.19
268 0.13
269 0.12
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.17
275 0.19
276 0.25
277 0.31
278 0.29
279 0.31
280 0.3
281 0.35
282 0.33
283 0.29
284 0.25
285 0.26
286 0.25
287 0.24
288 0.23
289 0.18
290 0.19
291 0.22
292 0.2
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.11
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.1
304 0.11
305 0.14
306 0.15
307 0.17
308 0.18
309 0.21
310 0.22
311 0.22
312 0.24
313 0.22
314 0.21
315 0.22
316 0.24
317 0.2
318 0.22
319 0.23
320 0.23
321 0.31
322 0.4
323 0.47
324 0.5
325 0.53
326 0.54
327 0.53
328 0.51
329 0.46
330 0.46
331 0.44
332 0.45
333 0.49
334 0.55
335 0.6
336 0.6
337 0.59
338 0.56
339 0.57
340 0.6
341 0.55
342 0.49
343 0.43
344 0.47
345 0.46
346 0.38
347 0.31
348 0.22
349 0.18
350 0.14
351 0.14
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.09
360 0.08
361 0.06
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.09
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.07
375 0.06
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.09
381 0.09
382 0.13
383 0.15
384 0.17
385 0.16
386 0.18
387 0.21
388 0.28
389 0.36
390 0.43
391 0.52
392 0.59
393 0.67
394 0.75
395 0.8
396 0.74
397 0.76
398 0.75
399 0.71
400 0.66
401 0.58
402 0.49
403 0.41
404 0.36
405 0.25
406 0.15
407 0.07
408 0.05
409 0.04
410 0.03
411 0.02
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.05
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.02
439 0.02
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.06
448 0.06
449 0.08
450 0.11
451 0.14
452 0.21
453 0.21
454 0.24
455 0.31
456 0.36
457 0.41
458 0.43
459 0.42
460 0.39
461 0.42
462 0.4
463 0.38
464 0.4
465 0.37
466 0.35
467 0.41
468 0.42
469 0.46
470 0.5
471 0.53
472 0.55
473 0.59
474 0.64
475 0.66
476 0.7
477 0.67
478 0.69
479 0.71
480 0.72
481 0.72
482 0.68
483 0.62
484 0.61
485 0.63
486 0.65
487 0.65
488 0.65
489 0.66
490 0.7
491 0.71
492 0.66
493 0.61
494 0.55
495 0.54
496 0.51
497 0.51
498 0.48
499 0.47
500 0.49
501 0.47
502 0.43
503 0.37
504 0.37
505 0.3
506 0.28
507 0.33
508 0.34
509 0.35
510 0.35
511 0.33
512 0.31
513 0.35
514 0.37
515 0.3
516 0.29
517 0.28
518 0.28
519 0.26
520 0.21
521 0.16
522 0.15
523 0.18
524 0.14
525 0.15
526 0.16
527 0.18
528 0.19
529 0.19
530 0.17
531 0.15
532 0.18
533 0.17
534 0.19
535 0.16
536 0.15
537 0.13
538 0.14
539 0.15
540 0.13
541 0.16
542 0.17
543 0.17
544 0.19
545 0.21
546 0.27
547 0.25
548 0.26
549 0.23
550 0.23
551 0.23
552 0.23
553 0.2
554 0.14
555 0.13
556 0.1
557 0.1
558 0.07
559 0.08
560 0.06
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.07
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.11
577 0.13
578 0.18
579 0.26
580 0.34
581 0.37
582 0.39
583 0.4
584 0.42
585 0.49
586 0.52
587 0.44
588 0.43
589 0.41
590 0.39
591 0.38
592 0.34
593 0.25
594 0.21
595 0.19
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.12
601 0.13
602 0.15
603 0.19
604 0.22
605 0.29
606 0.35
607 0.44
608 0.48
609 0.52
610 0.5
611 0.52
612 0.52
613 0.44
614 0.41
615 0.36
616 0.31
617 0.27
618 0.24
619 0.2
620 0.16
621 0.17
622 0.17
623 0.12
624 0.12
625 0.13
626 0.14
627 0.13
628 0.15
629 0.18
630 0.15
631 0.17
632 0.21
633 0.29
634 0.33
635 0.38
636 0.38
637 0.38
638 0.4
639 0.43
640 0.48
641 0.45
642 0.41
643 0.36
644 0.38
645 0.4
646 0.38
647 0.36
648 0.27
649 0.24
650 0.24
651 0.24
652 0.21
653 0.16
654 0.15
655 0.14
656 0.13
657 0.09
658 0.08
659 0.07
660 0.06
661 0.06
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.06
671 0.07
672 0.08
673 0.1
674 0.12
675 0.12
676 0.12
677 0.14
678 0.22
679 0.28
680 0.31
681 0.34
682 0.39
683 0.46
684 0.5
685 0.49
686 0.4
687 0.35
688 0.35
689 0.38
690 0.33
691 0.26
692 0.21
693 0.23
694 0.25
695 0.24
696 0.21
697 0.13
698 0.16
699 0.17
700 0.18
701 0.19
702 0.23
703 0.25
704 0.27
705 0.33
706 0.34
707 0.37
708 0.38
709 0.39
710 0.4
711 0.39
712 0.4
713 0.38
714 0.33
715 0.34
716 0.41
717 0.47
718 0.43
719 0.42
720 0.43
721 0.45
722 0.51
723 0.49
724 0.44
725 0.37
726 0.38
727 0.41
728 0.41
729 0.41
730 0.35
731 0.39
732 0.39
733 0.42
734 0.39
735 0.4
736 0.42
737 0.4
738 0.41
739 0.4
740 0.38
741 0.35
742 0.37
743 0.39
744 0.38
745 0.38
746 0.38
747 0.36
748 0.34
749 0.34
750 0.31
751 0.31
752 0.31
753 0.34
754 0.37
755 0.39
756 0.44
757 0.51
758 0.58
759 0.57
760 0.52
761 0.49
762 0.48
763 0.53
764 0.48
765 0.39
766 0.3
767 0.31
768 0.35
769 0.35
770 0.34
771 0.31
772 0.33
773 0.4
774 0.48
775 0.52
776 0.5
777 0.48
778 0.46
779 0.41
780 0.37
781 0.3
782 0.25
783 0.15
784 0.14
785 0.13
786 0.13
787 0.13
788 0.13
789 0.14
790 0.1
791 0.1
792 0.11
793 0.12
794 0.13
795 0.13
796 0.19
797 0.24
798 0.25
799 0.31
800 0.33
801 0.34
802 0.38
803 0.38
804 0.39
805 0.45
806 0.5
807 0.46
808 0.51
809 0.56
810 0.56
811 0.6
812 0.62
813 0.59
814 0.6
815 0.67
816 0.67
817 0.65
818 0.64
819 0.67
820 0.65
821 0.61
822 0.59
823 0.56
824 0.49
825 0.56
826 0.6
827 0.59
828 0.54
829 0.56
830 0.57
831 0.56
832 0.55
833 0.47
834 0.46
835 0.44
836 0.44
837 0.39
838 0.36
839 0.35
840 0.35
841 0.32
842 0.25
843 0.19
844 0.19
845 0.19
846 0.17
847 0.13
848 0.11
849 0.11
850 0.11
851 0.15
852 0.16
853 0.21
854 0.26
855 0.31
856 0.36
857 0.38
858 0.38
859 0.41
860 0.47
861 0.51
862 0.54
863 0.53
864 0.56
865 0.56
866 0.55
867 0.48
868 0.45
869 0.39
870 0.4
871 0.41
872 0.36
873 0.36
874 0.37
875 0.37
876 0.33
877 0.32