Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JW85

Protein Details
Accession B6JW85    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-32QQPNVVVNKNKRYRREKPWDTDDIDHydrophilic
235-264RFLPQFKKRNVARRKPAKVREKKDYTPFPPHydrophilic
278-314GEYFLNKEERERKKRQEKKEKQAEKQKERQAEREKAFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-257KKRNVARRKPAKVREKK
286-329ERERKKRQEKKEKQAEKQKERQAEREKAFIPPTESAPQTKKRKV
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MSEESQEQQPNVVVNKNKRYRREKPWDTDDIDHWKIDPFTKEESSGPFLEESSFATLFPKYREKYLREVWPHVTRALDKYGIACVLDLVEGSMTVKTTRKAYDPYSILKARDLIKLLARSVPFPQAIKVMQDDVACDVIKIGNLVRNKDRFIKRRQRLIGNNGQTLKALELLTQCYILVQGTTVAAMGGFKGLKEVRRVVIDCMNNIHPIYHIKELMIKRELAKDPALATESWDRFLPQFKKRNVARRKPAKVREKKDYTPFPPAQQPSKIDLQIESGEYFLNKEERERKKRQEKKEKQAEKQKERQAEREKAFIPPTESAPQTKKRKVKVEAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.5
3 0.58
4 0.64
5 0.7
6 0.77
7 0.8
8 0.83
9 0.85
10 0.85
11 0.85
12 0.86
13 0.84
14 0.79
15 0.74
16 0.69
17 0.66
18 0.58
19 0.48
20 0.4
21 0.35
22 0.32
23 0.32
24 0.3
25 0.25
26 0.28
27 0.3
28 0.32
29 0.3
30 0.33
31 0.34
32 0.3
33 0.28
34 0.23
35 0.21
36 0.2
37 0.18
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.13
42 0.14
43 0.16
44 0.17
45 0.21
46 0.27
47 0.25
48 0.33
49 0.4
50 0.43
51 0.49
52 0.55
53 0.6
54 0.58
55 0.61
56 0.6
57 0.59
58 0.57
59 0.51
60 0.46
61 0.38
62 0.35
63 0.34
64 0.28
65 0.22
66 0.21
67 0.21
68 0.18
69 0.16
70 0.13
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.07
82 0.09
83 0.1
84 0.14
85 0.16
86 0.18
87 0.22
88 0.25
89 0.32
90 0.33
91 0.35
92 0.39
93 0.4
94 0.37
95 0.34
96 0.34
97 0.29
98 0.29
99 0.27
100 0.22
101 0.24
102 0.25
103 0.25
104 0.25
105 0.23
106 0.21
107 0.21
108 0.23
109 0.2
110 0.18
111 0.18
112 0.17
113 0.17
114 0.17
115 0.16
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.09
130 0.11
131 0.15
132 0.2
133 0.21
134 0.24
135 0.32
136 0.39
137 0.42
138 0.51
139 0.59
140 0.6
141 0.67
142 0.7
143 0.7
144 0.68
145 0.7
146 0.68
147 0.61
148 0.59
149 0.5
150 0.45
151 0.37
152 0.3
153 0.23
154 0.16
155 0.11
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.06
179 0.08
180 0.1
181 0.13
182 0.16
183 0.16
184 0.2
185 0.22
186 0.22
187 0.27
188 0.26
189 0.23
190 0.25
191 0.24
192 0.22
193 0.21
194 0.18
195 0.13
196 0.15
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.21
202 0.23
203 0.27
204 0.26
205 0.24
206 0.23
207 0.3
208 0.31
209 0.27
210 0.27
211 0.23
212 0.21
213 0.22
214 0.22
215 0.14
216 0.16
217 0.21
218 0.2
219 0.2
220 0.2
221 0.19
222 0.19
223 0.27
224 0.31
225 0.33
226 0.41
227 0.43
228 0.52
229 0.58
230 0.67
231 0.69
232 0.73
233 0.75
234 0.77
235 0.85
236 0.85
237 0.89
238 0.9
239 0.9
240 0.87
241 0.87
242 0.84
243 0.81
244 0.81
245 0.8
246 0.74
247 0.73
248 0.68
249 0.62
250 0.62
251 0.6
252 0.56
253 0.52
254 0.5
255 0.45
256 0.48
257 0.46
258 0.38
259 0.33
260 0.31
261 0.28
262 0.26
263 0.21
264 0.15
265 0.14
266 0.13
267 0.13
268 0.12
269 0.14
270 0.13
271 0.2
272 0.29
273 0.4
274 0.49
275 0.58
276 0.67
277 0.74
278 0.84
279 0.88
280 0.9
281 0.9
282 0.92
283 0.94
284 0.93
285 0.92
286 0.93
287 0.93
288 0.92
289 0.91
290 0.88
291 0.87
292 0.82
293 0.82
294 0.81
295 0.8
296 0.73
297 0.71
298 0.64
299 0.6
300 0.57
301 0.51
302 0.46
303 0.38
304 0.4
305 0.38
306 0.39
307 0.39
308 0.44
309 0.5
310 0.55
311 0.62
312 0.66
313 0.69
314 0.77