FuNGI

B6K865

Protein Details

Accession

B6K865

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
578-599	LAMRRDEKFRGRRFPRGPQAAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
375-396	PKRSRSPSPRGGRSRRSPSPRR
572-594	SKRGKELAMRRDEKFRGRRFPRG

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006569 CID_dom IPR008942 ENTH_VHS IPR034894 Nrd1/Seb1_RRM IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0033620 C:Mei2 nuclear dot complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0099122 F:RNA polymerase II C-terminal domain binding GO:0031124 P:mRNA 3'-end processing GO:0031126 P:sno(s)RNA 3'-end processing GO:0006369 P:termination of RNA polymerase II transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04818 CID PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51391 CID PS50102 RRM
CDD	cd16984 CID_Nrd1_like cd12331 RRM_NRD1_SEB1_like

Amino Acid Sequences

MSEVAEFEATLESLQKSRTGISGSKISKLTKISMDHVALNDQFISEVYKYSKKAPGSHKLGALYILDSIVRSYQDAAKKNNESLEAVVDKSYSGGWSKASEVMETLVLDAIQNSPRANAAKVVKLFDIWEKAGTFPVEKIHSLREKLRTALKDNLTESTPNTSTSSSVAERRDNGSHNVTSDSSSMPGHGAATVPVENNAASILEALAAFAQKAPIAQPSAAGSINDLNAHGNRTDITANTSPNDPRQLPAQPAVIPPSIPTQSSSTAPYYSPTSSNAAPSLPLGPSAARSMPSGPAVPSAIDGGINPLQAQKMALMSVLTSQNVPPAQIDAILKAAFPDYPPAAASSVPTSATGFPLPAPTTSQSINLESFLPPKRSRSPSPRGGRSRRSPSPRRDITYNAPASGAPKPSPDGFPRRYALDPTIPPDSIMVYSRTLFLGGITRAVRENVLRSMFERFGAVQSLVVNHNSRHGFLKMFHRDAAEKAQVAMENVPFADTTIRTKWGVGFGPKDCIDFATGISVIPVRLLTDADRTWLVTAEYGGTGGLPITPGVAVDEPDIELGLGISSKAISKRGKELAMRRDEKFRGRRFPRGPQAASAAGPADRYHEPAGNDWNSNSMESNSFHPSNFQNYDQSPYPPGPVSQPPWQSH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.15
3	0.16
4	0.17
5	0.2
6	0.22
7	0.24
8	0.27
9	0.36
10	0.36
11	0.4
12	0.43
13	0.42
14	0.42
15	0.42
16	0.41
17	0.39
18	0.41
19	0.39
20	0.42
21	0.42
22	0.4
23	0.38
24	0.38
25	0.31
26	0.28
27	0.24
28	0.17
29	0.15
30	0.13
31	0.15
32	0.11
33	0.14
34	0.18
35	0.23
36	0.25
37	0.31
38	0.37
39	0.38
40	0.46
41	0.52
42	0.58
43	0.61
44	0.64
45	0.62
46	0.57
47	0.53
48	0.46
49	0.38
50	0.28
51	0.2
52	0.16
53	0.11
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.09
58	0.09
59	0.12
60	0.17
61	0.24
62	0.3
63	0.35
64	0.42
65	0.45
66	0.48
67	0.49
68	0.45
69	0.39
70	0.34
71	0.35
72	0.28
73	0.25
74	0.22
75	0.18
76	0.16
77	0.15
78	0.14
79	0.1
80	0.1
81	0.1
82	0.11
83	0.13
84	0.15
85	0.19
86	0.19
87	0.18
88	0.17
89	0.17
90	0.16
91	0.15
92	0.13
93	0.09
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.09
98	0.1
99	0.11
100	0.11
101	0.11
102	0.15
103	0.17
104	0.17
105	0.21
106	0.23
107	0.28
108	0.3
109	0.32
110	0.29
111	0.28
112	0.29
113	0.26
114	0.27
115	0.21
116	0.22
117	0.2
118	0.2
119	0.22
120	0.21
121	0.18
122	0.15
123	0.19
124	0.19
125	0.19
126	0.21
127	0.26
128	0.3
129	0.33
130	0.38
131	0.41
132	0.41
133	0.44
134	0.49
135	0.46
136	0.46
137	0.51
138	0.49
139	0.46
140	0.45
141	0.44
142	0.38
143	0.34
144	0.3
145	0.28
146	0.24
147	0.21
148	0.21
149	0.19
150	0.18
151	0.18
152	0.21
153	0.17
154	0.22
155	0.23
156	0.25
157	0.27
158	0.3
159	0.32
160	0.31
161	0.33
162	0.33
163	0.31
164	0.29
165	0.29
166	0.25
167	0.23
168	0.21
169	0.18
170	0.14
171	0.13
172	0.12
173	0.1
174	0.1
175	0.08
176	0.08
177	0.07
178	0.06
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.09
183	0.09
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.06
188	0.05
189	0.05
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.04
200	0.05
201	0.06
202	0.08
203	0.09
204	0.09
205	0.1
206	0.11
207	0.13
208	0.13
209	0.12
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.11
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.11
218	0.1
219	0.09
220	0.08
221	0.1
222	0.1
223	0.09
224	0.14
225	0.15
226	0.16
227	0.17
228	0.19
229	0.19
230	0.21
231	0.25
232	0.2
233	0.18
234	0.21
235	0.23
236	0.23
237	0.25
238	0.24
239	0.21
240	0.21
241	0.24
242	0.2
243	0.17
244	0.16
245	0.17
246	0.15
247	0.14
248	0.15
249	0.14
250	0.16
251	0.17
252	0.19
253	0.17
254	0.17
255	0.17
256	0.16
257	0.17
258	0.16
259	0.16
260	0.15
261	0.17
262	0.16
263	0.17
264	0.16
265	0.13
266	0.12
267	0.12
268	0.11
269	0.08
270	0.08
271	0.08
272	0.07
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.1
279	0.11
280	0.12
281	0.12
282	0.1
283	0.11
284	0.1
285	0.1
286	0.09
287	0.08
288	0.07
289	0.06
290	0.05
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.04
304	0.04
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.09
317	0.09
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.07
323	0.07
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.06
328	0.07
329	0.07
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.09
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.07
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.11
348	0.11
349	0.13
350	0.13
351	0.15
352	0.14
353	0.16
354	0.16
355	0.14
356	0.14
357	0.13
358	0.17
359	0.17
360	0.21
361	0.21
362	0.25
363	0.32
364	0.37
365	0.44
366	0.49
367	0.54
368	0.58
369	0.66
370	0.71
371	0.73
372	0.75
373	0.76
374	0.76
375	0.76
376	0.75
377	0.76
378	0.75
379	0.74
380	0.77
381	0.74
382	0.7
383	0.64
384	0.61
385	0.58
386	0.58
387	0.51
388	0.41
389	0.35
390	0.31
391	0.3
392	0.28
393	0.24
394	0.15
395	0.15
396	0.17
397	0.18
398	0.21
399	0.24
400	0.3
401	0.3
402	0.34
403	0.35
404	0.36
405	0.36
406	0.35
407	0.33
408	0.31
409	0.29
410	0.28
411	0.29
412	0.26
413	0.25
414	0.22
415	0.19
416	0.14
417	0.14
418	0.13
419	0.11
420	0.11
421	0.12
422	0.12
423	0.11
424	0.1
425	0.09
426	0.11
427	0.1
428	0.13
429	0.13
430	0.14
431	0.14
432	0.15
433	0.15
434	0.12
435	0.15
436	0.16
437	0.17
438	0.17
439	0.17
440	0.22
441	0.21
442	0.2
443	0.19
444	0.15
445	0.14
446	0.16
447	0.15
448	0.11
449	0.11
450	0.12
451	0.13
452	0.14
453	0.15
454	0.13
455	0.19
456	0.19
457	0.2
458	0.21
459	0.21
460	0.21
461	0.23
462	0.33
463	0.35
464	0.36
465	0.36
466	0.35
467	0.35
468	0.36
469	0.39
470	0.32
471	0.24
472	0.23
473	0.23
474	0.21
475	0.21
476	0.21
477	0.14
478	0.12
479	0.11
480	0.11
481	0.09
482	0.09
483	0.1
484	0.09
485	0.13
486	0.15
487	0.18
488	0.18
489	0.19
490	0.2
491	0.22
492	0.26
493	0.26
494	0.28
495	0.27
496	0.33
497	0.33
498	0.32
499	0.27
500	0.24
501	0.21
502	0.16
503	0.15
504	0.12
505	0.12
506	0.1
507	0.11
508	0.1
509	0.09
510	0.09
511	0.08
512	0.06
513	0.07
514	0.08
515	0.08
516	0.13
517	0.13
518	0.15
519	0.15
520	0.15
521	0.15
522	0.15
523	0.14
524	0.1
525	0.11
526	0.1
527	0.09
528	0.09
529	0.08
530	0.07
531	0.06
532	0.06
533	0.05
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.05
539	0.07
540	0.07
541	0.08
542	0.08
543	0.09
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.07
548	0.06
549	0.05
550	0.05
551	0.04
552	0.04
553	0.04
554	0.05
555	0.08
556	0.1
557	0.16
558	0.21
559	0.24
560	0.32
561	0.38
562	0.44
563	0.49
564	0.56
565	0.59
566	0.65
567	0.67
568	0.62
569	0.64
570	0.64
571	0.67
572	0.68
573	0.67
574	0.67
575	0.69
576	0.77
577	0.76
578	0.81
579	0.82
580	0.81
581	0.75
582	0.68
583	0.66
584	0.58
585	0.51
586	0.41
587	0.32
588	0.23
589	0.21
590	0.17
591	0.17
592	0.15
593	0.19
594	0.21
595	0.23
596	0.24
597	0.27
598	0.35
599	0.34
600	0.35
601	0.31
602	0.33
603	0.3
604	0.3
605	0.27
606	0.21
607	0.21
608	0.21
609	0.24
610	0.27
611	0.28
612	0.26
613	0.29
614	0.3
615	0.35
616	0.38
617	0.37
618	0.37
619	0.37
620	0.44
621	0.42
622	0.42
623	0.38
624	0.35
625	0.36
626	0.31
627	0.31
628	0.3
629	0.36
630	0.38
631	0.42

B6K865

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer