Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6K2I4

Protein Details
Accession B6K2I4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-68REEQAQREKEREKKRKQHEEELQQMRQKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-56KRAFRRGDLEKAREEKYREEQAQREKEREKKRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004098  Prp18  
IPR014906  PRP4-like  
IPR036285  PRP4-like_sf  
IPR039979  PRPF18  
Gene Ontology GO:0071021  C:U2-type post-spliceosomal complex  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0005682  C:U5 snRNP  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
Pfam View protein in Pfam  
PF02840  Prp18  
Amino Acid Sequences MDFLKEEIERKRRQIQADGELPVKRAFRRGDLEKAREEKYREEQAQREKEREKKRKQHEEELQQMRQKLIQSKTALQKKTGETRLPSDKEERKAPPQDATTEGSSDAQANGEDTVPISTIQSQLRAMKKPIRLFGENEDMIRTRWKSEQKEQRKRDLEQELKNQRVEIIEWERCNTQRSKVARQLIVFIRHGLRLWQEFFAKKSIEELDLSTTKAQYKVFQQASQHLELLINKIIDDQIDNEVFERVAEICYWCQKEEFVKANDAYLRVSIGNAPWPIGVTMVGIHERSSRERLTAHSVGHVLNDEMTRKWLQALKRLVTFFDKERPLWKTVEEAGNEEHELQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.65
3 0.65
4 0.65
5 0.62
6 0.57
7 0.52
8 0.48
9 0.43
10 0.39
11 0.31
12 0.33
13 0.32
14 0.35
15 0.42
16 0.46
17 0.52
18 0.58
19 0.62
20 0.63
21 0.65
22 0.62
23 0.59
24 0.56
25 0.53
26 0.51
27 0.56
28 0.54
29 0.56
30 0.6
31 0.65
32 0.72
33 0.7
34 0.69
35 0.67
36 0.7
37 0.75
38 0.78
39 0.79
40 0.78
41 0.85
42 0.88
43 0.89
44 0.9
45 0.89
46 0.88
47 0.87
48 0.86
49 0.81
50 0.73
51 0.66
52 0.56
53 0.49
54 0.44
55 0.41
56 0.36
57 0.37
58 0.37
59 0.43
60 0.52
61 0.57
62 0.55
63 0.5
64 0.52
65 0.51
66 0.56
67 0.55
68 0.51
69 0.46
70 0.5
71 0.57
72 0.53
73 0.51
74 0.51
75 0.51
76 0.51
77 0.55
78 0.53
79 0.52
80 0.56
81 0.55
82 0.51
83 0.47
84 0.45
85 0.41
86 0.39
87 0.32
88 0.26
89 0.24
90 0.19
91 0.17
92 0.15
93 0.12
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.1
107 0.11
108 0.12
109 0.14
110 0.19
111 0.23
112 0.26
113 0.29
114 0.32
115 0.38
116 0.4
117 0.44
118 0.44
119 0.42
120 0.41
121 0.42
122 0.42
123 0.37
124 0.33
125 0.29
126 0.24
127 0.22
128 0.24
129 0.2
130 0.14
131 0.2
132 0.28
133 0.32
134 0.41
135 0.52
136 0.59
137 0.69
138 0.72
139 0.76
140 0.74
141 0.7
142 0.68
143 0.67
144 0.63
145 0.59
146 0.64
147 0.61
148 0.58
149 0.56
150 0.48
151 0.39
152 0.32
153 0.26
154 0.21
155 0.2
156 0.2
157 0.2
158 0.22
159 0.22
160 0.22
161 0.25
162 0.21
163 0.19
164 0.23
165 0.28
166 0.34
167 0.39
168 0.44
169 0.44
170 0.43
171 0.44
172 0.41
173 0.4
174 0.33
175 0.28
176 0.23
177 0.21
178 0.2
179 0.16
180 0.15
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.17
185 0.17
186 0.19
187 0.21
188 0.19
189 0.16
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.14
195 0.16
196 0.16
197 0.17
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.14
204 0.17
205 0.26
206 0.27
207 0.29
208 0.3
209 0.34
210 0.38
211 0.37
212 0.33
213 0.24
214 0.23
215 0.21
216 0.22
217 0.17
218 0.13
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.1
238 0.16
239 0.18
240 0.18
241 0.18
242 0.19
243 0.22
244 0.28
245 0.33
246 0.29
247 0.33
248 0.33
249 0.35
250 0.35
251 0.32
252 0.26
253 0.19
254 0.18
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.11
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.07
268 0.07
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.13
274 0.16
275 0.2
276 0.24
277 0.23
278 0.24
279 0.25
280 0.29
281 0.34
282 0.35
283 0.32
284 0.3
285 0.31
286 0.29
287 0.29
288 0.26
289 0.17
290 0.16
291 0.17
292 0.15
293 0.14
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.21
298 0.24
299 0.26
300 0.34
301 0.42
302 0.43
303 0.48
304 0.48
305 0.47
306 0.47
307 0.47
308 0.42
309 0.43
310 0.42
311 0.38
312 0.44
313 0.46
314 0.44
315 0.42
316 0.39
317 0.35
318 0.38
319 0.43
320 0.37
321 0.36
322 0.35
323 0.36
324 0.35