Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JYP7

Protein Details
Accession B6JYP7    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-67PVQSPRGKGTPRKQTKKVIEEHIHydrophilic
105-124SSTAGKRKARDPNQPKRPPSHydrophilic
252-282PATPRGKKSNESARERKRKHKKNAATANATPHydrophilic
284-310ASPAVGKNEPRDKKKRRKSEPHSNKTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-114KRKAR
254-310TPRGKKSNESARERKRKHKKNAATANATPAASPAVGKNEPRDKKKRRKSEPHSNKTK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR031061  HMGB_plant  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MVSADKNSQTLANAIDKLGEAFNAAVEACNELKRSLPQILAEKLPVQSPRGKGTPRKQTKKVIEEHIPSDEASDEEDDMTLKEAVAAKAKGLREAAAAAAAAAASSTAGKRKARDPNQPKRPPSAYILYQKVQRPIVRESLGEKGNDVKEVNKACHEKWDSLSEEEKKPFEEEAAKLRSEYEKNMVTFEANKEKEQEQGAETVPTENKEEHTAAETEKPEANDSSSSSPSSSQEESATAPAAPEKPESASAPATPRGKKSNESARERKRKHKKNAATANATPAASPAVGKNEPRDKKKRRKSEPHSNKTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.19
4 0.19
5 0.17
6 0.13
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.1
15 0.1
16 0.13
17 0.14
18 0.14
19 0.16
20 0.19
21 0.23
22 0.24
23 0.25
24 0.27
25 0.33
26 0.36
27 0.35
28 0.33
29 0.31
30 0.28
31 0.3
32 0.27
33 0.24
34 0.27
35 0.29
36 0.33
37 0.37
38 0.42
39 0.48
40 0.55
41 0.63
42 0.68
43 0.74
44 0.76
45 0.8
46 0.83
47 0.83
48 0.8
49 0.77
50 0.74
51 0.69
52 0.65
53 0.57
54 0.48
55 0.39
56 0.33
57 0.25
58 0.17
59 0.14
60 0.12
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.08
70 0.11
71 0.12
72 0.16
73 0.16
74 0.15
75 0.2
76 0.2
77 0.2
78 0.18
79 0.18
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.09
84 0.09
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.04
89 0.03
90 0.03
91 0.02
92 0.03
93 0.04
94 0.07
95 0.12
96 0.14
97 0.16
98 0.24
99 0.35
100 0.42
101 0.53
102 0.6
103 0.67
104 0.76
105 0.83
106 0.78
107 0.75
108 0.7
109 0.62
110 0.56
111 0.5
112 0.45
113 0.43
114 0.44
115 0.39
116 0.42
117 0.41
118 0.41
119 0.39
120 0.35
121 0.32
122 0.31
123 0.34
124 0.3
125 0.28
126 0.26
127 0.27
128 0.27
129 0.23
130 0.21
131 0.19
132 0.18
133 0.19
134 0.17
135 0.13
136 0.16
137 0.18
138 0.19
139 0.2
140 0.22
141 0.21
142 0.28
143 0.3
144 0.26
145 0.27
146 0.3
147 0.27
148 0.27
149 0.31
150 0.27
151 0.29
152 0.29
153 0.27
154 0.24
155 0.23
156 0.2
157 0.17
158 0.17
159 0.15
160 0.2
161 0.22
162 0.21
163 0.2
164 0.21
165 0.24
166 0.21
167 0.22
168 0.2
169 0.21
170 0.21
171 0.22
172 0.21
173 0.18
174 0.19
175 0.21
176 0.25
177 0.22
178 0.23
179 0.25
180 0.25
181 0.27
182 0.27
183 0.24
184 0.16
185 0.17
186 0.17
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.12
194 0.13
195 0.15
196 0.16
197 0.14
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.19
202 0.19
203 0.18
204 0.2
205 0.2
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.15
210 0.17
211 0.19
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.18
216 0.18
217 0.21
218 0.2
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.12
226 0.11
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.17
234 0.18
235 0.19
236 0.2
237 0.21
238 0.23
239 0.29
240 0.33
241 0.33
242 0.36
243 0.39
244 0.41
245 0.43
246 0.48
247 0.52
248 0.56
249 0.63
250 0.69
251 0.73
252 0.81
253 0.84
254 0.86
255 0.87
256 0.87
257 0.89
258 0.9
259 0.89
260 0.89
261 0.93
262 0.92
263 0.88
264 0.8
265 0.75
266 0.68
267 0.57
268 0.46
269 0.35
270 0.27
271 0.19
272 0.18
273 0.13
274 0.17
275 0.2
276 0.23
277 0.31
278 0.39
279 0.48
280 0.57
281 0.66
282 0.7
283 0.78
284 0.87
285 0.9
286 0.91
287 0.93
288 0.94
289 0.95
290 0.95