Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JWC4

Protein Details
Accession B6JWC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-34YVNAKQYHRILKRREARARFEERLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-63LKRREARARFEERLRRVQGERKPYLHESRHKHAMRRPRGPGGR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001289  NFYA  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02045  CBFB_NFYA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51152  NFYA_HAP2_2  
Amino Acid Sequences MNQFDGAEGLYVNAKQYHRILKRREARARFEERLRRVQGERKPYLHESRHKHAMRRPRGPGGRFLTAEKVAELKAKEMESAQANTNTDTTKTAEEVQAANQTLESTRSVMENGAMSATPDANVAAAASNDDAGRSGVLQETVGLNNQTQSRQQDVPNNTAPNVDGGGHQQQQQQQQQQHQQLPSQDQQQQQSSSDASSLPSAANQQPHHDLNPNAAAVAAAAQAFHPPSHPSDVFLDGAGGILNMQDQFHSGSAAATQHPNMFTAGSDTGNDVLHPLQGYVNPPMGANLPSSETPGLLLSGKNQLGFVDEHTEVVNSLHGQHPQQHMLVHSQMTSSLDPTEGVNLAGKIPDSNGTVNGQQLMLGGHDDASGPVLEHHDDSVLSNTLMQGHYGRAANNQND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.27
4 0.36
5 0.44
6 0.52
7 0.59
8 0.64
9 0.73
10 0.8
11 0.84
12 0.81
13 0.81
14 0.82
15 0.83
16 0.79
17 0.79
18 0.78
19 0.75
20 0.77
21 0.73
22 0.68
23 0.65
24 0.67
25 0.65
26 0.66
27 0.66
28 0.59
29 0.61
30 0.63
31 0.67
32 0.67
33 0.68
34 0.66
35 0.67
36 0.74
37 0.72
38 0.72
39 0.69
40 0.71
41 0.72
42 0.74
43 0.73
44 0.73
45 0.77
46 0.72
47 0.74
48 0.7
49 0.65
50 0.57
51 0.52
52 0.47
53 0.41
54 0.39
55 0.3
56 0.25
57 0.19
58 0.22
59 0.21
60 0.17
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.21
66 0.2
67 0.22
68 0.23
69 0.23
70 0.24
71 0.24
72 0.25
73 0.22
74 0.19
75 0.18
76 0.17
77 0.15
78 0.16
79 0.17
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.19
84 0.22
85 0.21
86 0.19
87 0.17
88 0.16
89 0.14
90 0.15
91 0.14
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.1
133 0.12
134 0.13
135 0.15
136 0.17
137 0.2
138 0.23
139 0.26
140 0.31
141 0.33
142 0.38
143 0.4
144 0.38
145 0.34
146 0.31
147 0.28
148 0.21
149 0.18
150 0.13
151 0.08
152 0.1
153 0.14
154 0.15
155 0.17
156 0.2
157 0.23
158 0.3
159 0.35
160 0.38
161 0.38
162 0.43
163 0.48
164 0.51
165 0.52
166 0.46
167 0.43
168 0.39
169 0.4
170 0.37
171 0.35
172 0.33
173 0.32
174 0.34
175 0.34
176 0.33
177 0.29
178 0.27
179 0.22
180 0.17
181 0.15
182 0.12
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.06
187 0.06
188 0.09
189 0.1
190 0.15
191 0.14
192 0.17
193 0.2
194 0.21
195 0.22
196 0.23
197 0.21
198 0.19
199 0.21
200 0.18
201 0.14
202 0.13
203 0.11
204 0.07
205 0.08
206 0.06
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.09
216 0.14
217 0.14
218 0.15
219 0.17
220 0.19
221 0.18
222 0.17
223 0.15
224 0.09
225 0.09
226 0.07
227 0.05
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.03
234 0.04
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.08
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.09
266 0.12
267 0.13
268 0.14
269 0.14
270 0.13
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.14
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.13
301 0.13
302 0.12
303 0.08
304 0.09
305 0.12
306 0.14
307 0.15
308 0.22
309 0.26
310 0.27
311 0.28
312 0.28
313 0.27
314 0.28
315 0.3
316 0.24
317 0.2
318 0.17
319 0.17
320 0.19
321 0.18
322 0.14
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.12
335 0.1
336 0.1
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.16
341 0.18
342 0.19
343 0.2
344 0.2
345 0.17
346 0.14
347 0.13
348 0.12
349 0.1
350 0.09
351 0.08
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.1
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.12
365 0.13
366 0.14
367 0.16
368 0.16
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.17
373 0.16
374 0.16
375 0.14
376 0.14
377 0.19
378 0.2
379 0.2
380 0.24