FuNGI

A0A2H3B2N8

Protein Details

Accession

A0A2H3B2N8

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-62	MSGVIPTKSPPSKNKKNRDKEKEKKERTLSQAVP	Hydrophilic
96-119	IWKTYFPGKFRKRLNKENIPSRAY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
38-55	PPSKNKKNRDKEKEKKER
254-283	KNDPKKKGGPTNQKPVETPKKGASKAPPAP
381-421	GERRPRRGEKEKESGTSKEPSEAKERPVSPKKERGGRRGAP
487-500	RGGGRRGRGRGRGG

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MTSCRRGNCAGTESNPVTASARHPSSQCMSGVIPTKSPPSKNKKNRDKEKEKKERTLSQAVPTERLKTVVRRLPPNLPEEIFWQSVQTWVTDETVIWKTYFPGKFRKRLNKENIPSRAYIAFKTEDQVAEFGQGFDGHVFKDKAGTESQAVVEFAPYQKVPTEKKKPDARVGTIEKDEDYISFIESLNAANNAEPVSVEALYTRGAHGYLVASAQPAPQPKTTPLLEALKAEKSAVKEKEIIPRIQIKESTNGKNDPKKKGGPTNQKPVETPKKGASKAPPAPAPTTNANPKNTPKGAATPSNASVKAPKAPRAMRNQQAPKVPAPLNTSVPPSVGASSPSTNTAQPPPSPAAAARRTRPIIGLASRHFEAALNGAGVAPGERRPRRGEKEKESGTSKEPSEAKERPVSPKKERGGRRGAPANGGEASVKVPSILKRDSPKVTTLNINGDDGAGGNPVIVNKVEKANLSNDNHSLPASVMPNIVLGRGGGRRGRGRGRGGFFPAMRGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.39
3	0.34
4	0.29
5	0.26
6	0.27
7	0.27
8	0.29
9	0.29
10	0.3
11	0.34
12	0.37
13	0.39
14	0.36
15	0.31
16	0.28
17	0.3
18	0.36
19	0.32
20	0.3
21	0.28
22	0.36
23	0.39
24	0.45
25	0.49
26	0.53
27	0.63
28	0.71
29	0.8
30	0.83
31	0.88
32	0.93
33	0.94
34	0.95
35	0.94
36	0.95
37	0.95
38	0.93
39	0.92
40	0.9
41	0.88
42	0.84
43	0.83
44	0.76
45	0.72
46	0.71
47	0.62
48	0.59
49	0.52
50	0.48
51	0.39
52	0.39
53	0.34
54	0.33
55	0.4
56	0.42
57	0.47
58	0.5
59	0.55
60	0.6
61	0.61
62	0.58
63	0.54
64	0.48
65	0.42
66	0.38
67	0.38
68	0.31
69	0.26
70	0.24
71	0.19
72	0.21
73	0.2
74	0.16
75	0.13
76	0.12
77	0.14
78	0.13
79	0.12
80	0.15
81	0.17
82	0.18
83	0.17
84	0.16
85	0.16
86	0.25
87	0.29
88	0.27
89	0.36
90	0.42
91	0.5
92	0.6
93	0.69
94	0.7
95	0.76
96	0.83
97	0.83
98	0.84
99	0.86
100	0.83
101	0.75
102	0.67
103	0.6
104	0.54
105	0.45
106	0.36
107	0.3
108	0.25
109	0.22
110	0.23
111	0.22
112	0.18
113	0.18
114	0.18
115	0.14
116	0.14
117	0.14
118	0.12
119	0.1
120	0.09
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.07
125	0.12
126	0.12
127	0.11
128	0.15
129	0.16
130	0.17
131	0.18
132	0.2
133	0.16
134	0.17
135	0.18
136	0.15
137	0.15
138	0.12
139	0.11
140	0.11
141	0.1
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.11
146	0.17
147	0.22
148	0.31
149	0.42
150	0.45
151	0.54
152	0.62
153	0.66
154	0.7
155	0.7
156	0.64
157	0.62
158	0.61
159	0.57
160	0.49
161	0.44
162	0.35
163	0.3
164	0.26
165	0.17
166	0.14
167	0.1
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.07
179	0.07
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.07
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.05
197	0.06
198	0.05
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.08
203	0.11
204	0.13
205	0.14
206	0.16
207	0.17
208	0.21
209	0.21
210	0.21
211	0.22
212	0.22
213	0.22
214	0.22
215	0.22
216	0.19
217	0.18
218	0.17
219	0.15
220	0.14
221	0.21
222	0.2
223	0.2
224	0.22
225	0.25
226	0.33
227	0.35
228	0.33
229	0.29
230	0.35
231	0.35
232	0.33
233	0.34
234	0.27
235	0.31
236	0.36
237	0.38
238	0.33
239	0.36
240	0.39
241	0.44
242	0.49
243	0.47
244	0.46
245	0.47
246	0.49
247	0.54
248	0.59
249	0.62
250	0.63
251	0.68
252	0.67
253	0.63
254	0.59
255	0.59
256	0.59
257	0.51
258	0.46
259	0.42
260	0.44
261	0.44
262	0.48
263	0.44
264	0.44
265	0.46
266	0.48
267	0.43
268	0.39
269	0.41
270	0.38
271	0.36
272	0.29
273	0.28
274	0.32
275	0.35
276	0.34
277	0.35
278	0.37
279	0.41
280	0.39
281	0.37
282	0.3
283	0.3
284	0.32
285	0.33
286	0.32
287	0.28
288	0.3
289	0.31
290	0.29
291	0.24
292	0.23
293	0.2
294	0.24
295	0.24
296	0.27
297	0.31
298	0.36
299	0.43
300	0.49
301	0.56
302	0.56
303	0.63
304	0.64
305	0.62
306	0.62
307	0.59
308	0.51
309	0.49
310	0.44
311	0.38
312	0.36
313	0.34
314	0.32
315	0.3
316	0.31
317	0.25
318	0.24
319	0.21
320	0.17
321	0.15
322	0.12
323	0.12
324	0.12
325	0.13
326	0.14
327	0.15
328	0.16
329	0.15
330	0.17
331	0.2
332	0.21
333	0.2
334	0.23
335	0.23
336	0.23
337	0.23
338	0.22
339	0.25
340	0.3
341	0.34
342	0.33
343	0.38
344	0.39
345	0.39
346	0.38
347	0.33
348	0.31
349	0.29
350	0.32
351	0.27
352	0.3
353	0.3
354	0.28
355	0.26
356	0.21
357	0.17
358	0.14
359	0.13
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.06
367	0.1
368	0.19
369	0.21
370	0.25
371	0.32
372	0.42
373	0.51
374	0.61
375	0.66
376	0.66
377	0.74
378	0.75
379	0.74
380	0.69
381	0.62
382	0.56
383	0.51
384	0.43
385	0.4
386	0.37
387	0.34
388	0.38
389	0.38
390	0.39
391	0.42
392	0.45
393	0.48
394	0.56
395	0.61
396	0.61
397	0.67
398	0.7
399	0.71
400	0.76
401	0.74
402	0.75
403	0.72
404	0.73
405	0.72
406	0.66
407	0.61
408	0.54
409	0.49
410	0.39
411	0.34
412	0.25
413	0.17
414	0.17
415	0.12
416	0.11
417	0.09
418	0.11
419	0.14
420	0.2
421	0.22
422	0.27
423	0.34
424	0.41
425	0.47
426	0.47
427	0.49
428	0.47
429	0.47
430	0.48
431	0.45
432	0.45
433	0.41
434	0.38
435	0.33
436	0.29
437	0.25
438	0.19
439	0.16
440	0.09
441	0.07
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.08
446	0.08
447	0.1
448	0.12
449	0.16
450	0.18
451	0.19
452	0.21
453	0.26
454	0.34
455	0.36
456	0.39
457	0.37
458	0.37
459	0.37
460	0.34
461	0.29
462	0.21
463	0.21
464	0.19
465	0.17
466	0.16
467	0.15
468	0.17
469	0.17
470	0.16
471	0.12
472	0.1
473	0.13
474	0.15
475	0.2
476	0.2
477	0.27
478	0.33
479	0.4
480	0.49
481	0.52
482	0.58
483	0.62
484	0.65
485	0.64
486	0.65
487	0.65
488	0.56

A0A2H3B2N8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer