Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1CCQ6

Protein Details
Accession A0A0D1CCQ6    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-63ESSPSHSSRRDRDRHSYERRERKSHSHRQDRDRVARENRHBasic
82-111SSSHRHRTDQGRDSKRRRPQPDDSERRSSYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-71SRRDRDRHSYERRERKSHSHRQDRDRVARENRHGHKSSRHR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000253  FHA_dom  
IPR008984  SMAD_FHA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0051237  P:maintenance of RNA location  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG uma:UMAG_11247  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00498  FHA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50006  FHA_DOMAIN  
Amino Acid Sequences MQATSSKGEESCRKDRRSSSPLRESSPSHSSRRDRDRHSYERRERKSHSHRQDRDRVARENRHGHKSSRHREAEGDSPQLGSSSHRHRTDQGRDSKRRRPQPDDSERRSSYKAGSSMDPQNTHQARSHRTSPCHQTRDSRDSVRDRDERKHRHSSSRMRSPLPQATSSSDRIPPRPSSPPVPATTEPFAEEDAENDAPNFAPSGLLAAESNTHNGIVLKYHEPPEAHKPKTAWRLYCFKDGKEQHVLHLGAQSAYLLGRDRTVVDIPLDHESCSKQHAVLQFRQTITTNDFGDKKKRIQPYLIDLESINGSYVNDKEIPTSRYYQLRTGDTLTFGASTREYVLLDESSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.69
3 0.72
4 0.73
5 0.76
6 0.76
7 0.77
8 0.77
9 0.75
10 0.72
11 0.65
12 0.62
13 0.61
14 0.56
15 0.51
16 0.55
17 0.58
18 0.63
19 0.7
20 0.72
21 0.7
22 0.76
23 0.79
24 0.81
25 0.84
26 0.85
27 0.85
28 0.87
29 0.88
30 0.85
31 0.82
32 0.82
33 0.82
34 0.82
35 0.83
36 0.83
37 0.84
38 0.85
39 0.9
40 0.89
41 0.88
42 0.84
43 0.82
44 0.8
45 0.8
46 0.79
47 0.78
48 0.75
49 0.74
50 0.71
51 0.67
52 0.67
53 0.69
54 0.7
55 0.7
56 0.67
57 0.6
58 0.59
59 0.59
60 0.57
61 0.51
62 0.45
63 0.35
64 0.31
65 0.29
66 0.26
67 0.22
68 0.17
69 0.19
70 0.24
71 0.31
72 0.34
73 0.36
74 0.41
75 0.51
76 0.57
77 0.6
78 0.62
79 0.65
80 0.72
81 0.78
82 0.81
83 0.81
84 0.82
85 0.81
86 0.79
87 0.79
88 0.8
89 0.83
90 0.84
91 0.82
92 0.81
93 0.74
94 0.7
95 0.62
96 0.52
97 0.44
98 0.39
99 0.36
100 0.29
101 0.29
102 0.29
103 0.34
104 0.36
105 0.35
106 0.31
107 0.37
108 0.36
109 0.36
110 0.35
111 0.33
112 0.35
113 0.38
114 0.45
115 0.42
116 0.45
117 0.49
118 0.55
119 0.59
120 0.59
121 0.56
122 0.56
123 0.57
124 0.61
125 0.59
126 0.53
127 0.5
128 0.51
129 0.52
130 0.52
131 0.5
132 0.47
133 0.51
134 0.57
135 0.6
136 0.61
137 0.68
138 0.64
139 0.66
140 0.72
141 0.73
142 0.73
143 0.74
144 0.71
145 0.63
146 0.63
147 0.59
148 0.56
149 0.48
150 0.4
151 0.32
152 0.32
153 0.33
154 0.32
155 0.28
156 0.27
157 0.26
158 0.26
159 0.28
160 0.27
161 0.27
162 0.31
163 0.32
164 0.31
165 0.34
166 0.36
167 0.34
168 0.37
169 0.34
170 0.32
171 0.3
172 0.26
173 0.23
174 0.19
175 0.18
176 0.13
177 0.12
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.1
205 0.11
206 0.14
207 0.16
208 0.18
209 0.18
210 0.22
211 0.31
212 0.37
213 0.36
214 0.37
215 0.37
216 0.42
217 0.52
218 0.54
219 0.48
220 0.44
221 0.51
222 0.51
223 0.6
224 0.54
225 0.45
226 0.49
227 0.47
228 0.48
229 0.49
230 0.46
231 0.37
232 0.42
233 0.42
234 0.32
235 0.32
236 0.27
237 0.17
238 0.17
239 0.15
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.14
254 0.2
255 0.19
256 0.17
257 0.18
258 0.18
259 0.18
260 0.2
261 0.19
262 0.14
263 0.17
264 0.24
265 0.29
266 0.34
267 0.39
268 0.41
269 0.41
270 0.43
271 0.4
272 0.37
273 0.34
274 0.32
275 0.27
276 0.26
277 0.3
278 0.31
279 0.39
280 0.41
281 0.44
282 0.48
283 0.54
284 0.55
285 0.57
286 0.6
287 0.61
288 0.64
289 0.58
290 0.51
291 0.42
292 0.4
293 0.34
294 0.27
295 0.19
296 0.1
297 0.09
298 0.11
299 0.11
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.18
304 0.23
305 0.26
306 0.28
307 0.32
308 0.34
309 0.39
310 0.42
311 0.45
312 0.45
313 0.46
314 0.45
315 0.44
316 0.41
317 0.35
318 0.33
319 0.27
320 0.22
321 0.19
322 0.18
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.15
327 0.14
328 0.14
329 0.16