Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JYI9

Protein Details
Accession B6JYI9    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-64DTENKVSKDSKHHKSKHHASSKHSKGDEBasic
71-98DVSQPVPPSRKLRRKLRKAGKIDKDGNWHydrophilic
101-126EALKEAKKKEAKRLRRLEKKLGEKDTBasic
334-354EYGQDRSKRVRPARAARTNNSHydrophilic
369-392ADSYERPVKRSRKVDPRSIRPGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-122SRKLRRKLRKAGKIDKDGNWTEEALKEAKKKEAKRLRRLEKKLG
377-386KRSRKVDPRS
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKDHSEHAEDDDSSRSRKESVSDNELPQNAEDAPSDTENKVSKDSKHHKSKHHASSKHSKGDEEELLEIDVSQPVPPSRKLRRKLRKAGKIDKDGNWTEEALKEAKKKEAKRLRRLEKKLGEKDTDEDAEKGPKGSSAPNKPATKFGIWIGNLSFLTTVDILKEFFVRETAAIAAEQGGNGLQAEQIVRVHMPMNKIRKNQNRGFAYVDFDSEESLGLALACSEHALNGRNVLIKSSTDYTGRPDKVTVSKTEKIAARPANPPSSTLFVGNLPFDATKETLSEYFGDAGRIRRVRLMTFEDTGKCKGFGFVDFFDVETAQRAMAMSHDTWRLEYGQDRSKRVRPARAARTNNSGDYGDGADETGSGEADSYERPVKRSRKVDPRSIRPGAALARAARATAAIVKPQGTKIKFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.26
4 0.24
5 0.26
6 0.27
7 0.31
8 0.36
9 0.43
10 0.47
11 0.51
12 0.54
13 0.54
14 0.51
15 0.42
16 0.36
17 0.27
18 0.23
19 0.19
20 0.15
21 0.17
22 0.19
23 0.21
24 0.19
25 0.24
26 0.26
27 0.28
28 0.31
29 0.32
30 0.35
31 0.43
32 0.52
33 0.58
34 0.65
35 0.71
36 0.74
37 0.81
38 0.87
39 0.87
40 0.87
41 0.83
42 0.8
43 0.83
44 0.82
45 0.81
46 0.71
47 0.62
48 0.55
49 0.56
50 0.51
51 0.42
52 0.34
53 0.26
54 0.25
55 0.23
56 0.19
57 0.13
58 0.11
59 0.09
60 0.08
61 0.09
62 0.12
63 0.16
64 0.21
65 0.3
66 0.39
67 0.49
68 0.58
69 0.67
70 0.76
71 0.83
72 0.89
73 0.91
74 0.9
75 0.91
76 0.92
77 0.9
78 0.89
79 0.84
80 0.78
81 0.75
82 0.66
83 0.58
84 0.49
85 0.4
86 0.31
87 0.26
88 0.23
89 0.18
90 0.2
91 0.23
92 0.24
93 0.32
94 0.38
95 0.41
96 0.5
97 0.58
98 0.65
99 0.7
100 0.79
101 0.81
102 0.85
103 0.88
104 0.87
105 0.86
106 0.86
107 0.83
108 0.78
109 0.71
110 0.62
111 0.57
112 0.51
113 0.44
114 0.35
115 0.27
116 0.22
117 0.23
118 0.21
119 0.2
120 0.15
121 0.14
122 0.14
123 0.2
124 0.27
125 0.31
126 0.38
127 0.45
128 0.49
129 0.49
130 0.52
131 0.5
132 0.42
133 0.36
134 0.31
135 0.29
136 0.26
137 0.26
138 0.22
139 0.21
140 0.19
141 0.18
142 0.16
143 0.09
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.08
179 0.09
180 0.13
181 0.18
182 0.26
183 0.31
184 0.36
185 0.45
186 0.52
187 0.58
188 0.6
189 0.63
190 0.57
191 0.54
192 0.53
193 0.45
194 0.39
195 0.31
196 0.26
197 0.17
198 0.15
199 0.13
200 0.09
201 0.08
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.02
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.05
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.13
227 0.13
228 0.17
229 0.24
230 0.25
231 0.24
232 0.22
233 0.24
234 0.28
235 0.3
236 0.32
237 0.31
238 0.33
239 0.34
240 0.38
241 0.37
242 0.34
243 0.39
244 0.37
245 0.33
246 0.35
247 0.38
248 0.39
249 0.37
250 0.36
251 0.31
252 0.31
253 0.28
254 0.23
255 0.2
256 0.16
257 0.17
258 0.15
259 0.13
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.13
276 0.15
277 0.21
278 0.22
279 0.22
280 0.24
281 0.26
282 0.25
283 0.29
284 0.33
285 0.29
286 0.3
287 0.33
288 0.32
289 0.33
290 0.34
291 0.3
292 0.24
293 0.2
294 0.2
295 0.18
296 0.18
297 0.2
298 0.18
299 0.2
300 0.2
301 0.2
302 0.18
303 0.17
304 0.14
305 0.11
306 0.11
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.08
312 0.12
313 0.1
314 0.13
315 0.17
316 0.17
317 0.17
318 0.19
319 0.19
320 0.17
321 0.21
322 0.24
323 0.29
324 0.35
325 0.4
326 0.45
327 0.5
328 0.58
329 0.61
330 0.65
331 0.66
332 0.71
333 0.76
334 0.8
335 0.82
336 0.76
337 0.77
338 0.72
339 0.63
340 0.56
341 0.45
342 0.35
343 0.29
344 0.26
345 0.17
346 0.13
347 0.12
348 0.09
349 0.08
350 0.09
351 0.07
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.07
357 0.07
358 0.1
359 0.17
360 0.18
361 0.22
362 0.31
363 0.39
364 0.48
365 0.56
366 0.63
367 0.67
368 0.74
369 0.82
370 0.83
371 0.84
372 0.85
373 0.8
374 0.71
375 0.61
376 0.59
377 0.52
378 0.46
379 0.4
380 0.32
381 0.32
382 0.31
383 0.29
384 0.24
385 0.21
386 0.17
387 0.2
388 0.21
389 0.2
390 0.22
391 0.25
392 0.28
393 0.34
394 0.41