Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3C4Q5

Protein Details
Accession A0A2H3C4Q5    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-122IEAPSSSKKSGKQKKPKDGASLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-116KKSGKQKKPK
275-277KRR
486-516RPRNESPESKKARKAAVKVNRAARRAEKKAT
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MAPKSIFRQPGAKHFQLVHRSQRDPLIHDPDAALHVLKPVGKSRAELEALLSIEDAQTESDTKPGTAALYGIYYDDTEYDYMQHLREVGLQEDDVDSILIEAPSSSKKSGKQKKPKDGASLSLRDLPEGVLPSKSELPRTFESQQAIPDSISGFQPDMDPHLRQVLEALEDEAFIDDNLEDDFFGELVTDGERDGDEEVDFPFFEDGAVGDSEEQDSFDSGLGSGKEDEGWEARFARFKKSQQDPSAGNSDDGDESDGGDTIAGLPTITVIGGKKRRKGGSDASGYSMSSSSMYRNEALQTLDERFDQVMLKEYNEDDDDDDEHASMPDDSDSDGAPELITARDDFSSMMDEFLNDYEILGRKMRPKLEGDSGAEKLETLRRAMGQDQRVKESYSDDDDTPEEDLFLELEEDKKDRWDCETILTTYTNLENHPRLIRARDTRRTPKITLDAKTGLPSIVEPKQAKLRAQSPEPDLKRTPRQATVTRPRNESPESKKARKAAVKVNRAARRAEKKATKEEFGSEFKVQVKSVTTAGEKAMRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.57
3 0.58
4 0.61
5 0.61
6 0.6
7 0.6
8 0.59
9 0.63
10 0.58
11 0.55
12 0.56
13 0.54
14 0.47
15 0.45
16 0.43
17 0.36
18 0.34
19 0.29
20 0.21
21 0.13
22 0.14
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.22
27 0.26
28 0.27
29 0.28
30 0.29
31 0.34
32 0.34
33 0.31
34 0.27
35 0.26
36 0.25
37 0.24
38 0.21
39 0.14
40 0.12
41 0.12
42 0.1
43 0.06
44 0.07
45 0.09
46 0.09
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.11
54 0.11
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.16
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.11
82 0.09
83 0.07
84 0.06
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.07
90 0.1
91 0.13
92 0.15
93 0.18
94 0.25
95 0.36
96 0.47
97 0.56
98 0.65
99 0.73
100 0.82
101 0.88
102 0.87
103 0.86
104 0.78
105 0.75
106 0.72
107 0.65
108 0.56
109 0.53
110 0.46
111 0.36
112 0.33
113 0.26
114 0.2
115 0.19
116 0.17
117 0.12
118 0.13
119 0.16
120 0.21
121 0.22
122 0.25
123 0.25
124 0.3
125 0.32
126 0.39
127 0.38
128 0.36
129 0.38
130 0.33
131 0.34
132 0.3
133 0.28
134 0.21
135 0.2
136 0.17
137 0.15
138 0.13
139 0.12
140 0.09
141 0.08
142 0.1
143 0.09
144 0.13
145 0.15
146 0.16
147 0.15
148 0.2
149 0.19
150 0.18
151 0.19
152 0.15
153 0.13
154 0.13
155 0.13
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.1
221 0.15
222 0.16
223 0.22
224 0.26
225 0.3
226 0.38
227 0.44
228 0.52
229 0.51
230 0.55
231 0.5
232 0.48
233 0.49
234 0.4
235 0.32
236 0.24
237 0.21
238 0.16
239 0.14
240 0.12
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.09
259 0.18
260 0.22
261 0.26
262 0.32
263 0.35
264 0.37
265 0.42
266 0.43
267 0.43
268 0.46
269 0.42
270 0.39
271 0.37
272 0.34
273 0.3
274 0.22
275 0.14
276 0.09
277 0.09
278 0.07
279 0.08
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.08
296 0.13
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.1
335 0.09
336 0.1
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.07
343 0.06
344 0.08
345 0.09
346 0.11
347 0.12
348 0.14
349 0.19
350 0.24
351 0.27
352 0.28
353 0.3
354 0.33
355 0.38
356 0.41
357 0.38
358 0.38
359 0.36
360 0.33
361 0.29
362 0.24
363 0.19
364 0.19
365 0.17
366 0.13
367 0.14
368 0.15
369 0.17
370 0.22
371 0.27
372 0.31
373 0.37
374 0.39
375 0.42
376 0.42
377 0.41
378 0.37
379 0.34
380 0.29
381 0.27
382 0.28
383 0.23
384 0.24
385 0.23
386 0.23
387 0.21
388 0.18
389 0.12
390 0.09
391 0.09
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.07
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.15
401 0.17
402 0.17
403 0.21
404 0.24
405 0.23
406 0.28
407 0.32
408 0.28
409 0.28
410 0.28
411 0.24
412 0.21
413 0.22
414 0.18
415 0.15
416 0.19
417 0.19
418 0.22
419 0.24
420 0.26
421 0.27
422 0.3
423 0.37
424 0.42
425 0.5
426 0.55
427 0.62
428 0.69
429 0.76
430 0.78
431 0.71
432 0.69
433 0.69
434 0.67
435 0.6
436 0.57
437 0.51
438 0.45
439 0.45
440 0.38
441 0.28
442 0.22
443 0.2
444 0.19
445 0.2
446 0.26
447 0.25
448 0.28
449 0.37
450 0.4
451 0.42
452 0.44
453 0.47
454 0.46
455 0.5
456 0.53
457 0.5
458 0.57
459 0.57
460 0.56
461 0.55
462 0.55
463 0.6
464 0.63
465 0.62
466 0.59
467 0.64
468 0.65
469 0.7
470 0.74
471 0.74
472 0.71
473 0.71
474 0.66
475 0.65
476 0.64
477 0.62
478 0.6
479 0.61
480 0.64
481 0.66
482 0.7
483 0.69
484 0.73
485 0.72
486 0.71
487 0.71
488 0.72
489 0.74
490 0.75
491 0.79
492 0.77
493 0.71
494 0.7
495 0.69
496 0.69
497 0.67
498 0.7
499 0.69
500 0.69
501 0.77
502 0.77
503 0.71
504 0.64
505 0.62
506 0.58
507 0.53
508 0.52
509 0.42
510 0.4
511 0.4
512 0.4
513 0.34
514 0.31
515 0.3
516 0.27
517 0.27
518 0.28
519 0.26
520 0.25
521 0.28
522 0.33