Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JZ08

Protein Details
Accession B6JZ08    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-176REDSELRRHQRQKNEGKSNSHydrophilic
199-219LSLAERISRDKKSRRRRRRRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-219ISRDKKSRRRRRRRT
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDNLLTESVPTKEHMDENVVMGDVEVEGTAKNELDQPATEEVQIRRNALHLIGLTDLSQNQVSEFVTEYFSEPKCVFEWVNDDKCNLVYPDDDVCRSALFHLVNESIEDMDERRGYQTKPHPSLQKVFSIRLATTLDKKVSNAHVYSRYYLLHGDPREDSELRRHQRQKNEGKSNSVNTSNKGSGKSLAARLGPKVSDLSLAERISRDKKSRRRRRRRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.23
4 0.24
5 0.23
6 0.2
7 0.17
8 0.15
9 0.13
10 0.08
11 0.07
12 0.05
13 0.04
14 0.04
15 0.05
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.1
20 0.11
21 0.13
22 0.13
23 0.16
24 0.19
25 0.2
26 0.2
27 0.21
28 0.21
29 0.26
30 0.28
31 0.25
32 0.22
33 0.23
34 0.23
35 0.19
36 0.2
37 0.13
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.14
57 0.14
58 0.16
59 0.15
60 0.16
61 0.15
62 0.17
63 0.16
64 0.13
65 0.2
66 0.24
67 0.29
68 0.28
69 0.27
70 0.25
71 0.25
72 0.25
73 0.19
74 0.13
75 0.08
76 0.1
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.12
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.17
104 0.25
105 0.33
106 0.37
107 0.42
108 0.45
109 0.46
110 0.52
111 0.47
112 0.47
113 0.4
114 0.36
115 0.35
116 0.31
117 0.28
118 0.25
119 0.25
120 0.18
121 0.2
122 0.22
123 0.21
124 0.2
125 0.2
126 0.22
127 0.23
128 0.25
129 0.22
130 0.23
131 0.27
132 0.29
133 0.3
134 0.28
135 0.24
136 0.21
137 0.21
138 0.2
139 0.2
140 0.19
141 0.2
142 0.19
143 0.22
144 0.25
145 0.25
146 0.24
147 0.26
148 0.35
149 0.38
150 0.47
151 0.54
152 0.56
153 0.66
154 0.75
155 0.77
156 0.78
157 0.83
158 0.76
159 0.75
160 0.74
161 0.69
162 0.64
163 0.61
164 0.52
165 0.45
166 0.48
167 0.44
168 0.42
169 0.39
170 0.35
171 0.3
172 0.32
173 0.34
174 0.31
175 0.31
176 0.31
177 0.31
178 0.32
179 0.33
180 0.29
181 0.26
182 0.24
183 0.2
184 0.2
185 0.19
186 0.22
187 0.24
188 0.25
189 0.25
190 0.25
191 0.3
192 0.33
193 0.4
194 0.44
195 0.48
196 0.58
197 0.68
198 0.78
199 0.84