Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JVM6

Protein Details
Accession B6JVM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1085-1104KYLRERRTLVWRRWLNRTKAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013194  HDAC_interact_dom  
IPR003822  PAH  
IPR036600  PAH_sf  
IPR039774  Sin3-like  
IPR031693  Sin3_C  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:1990483  C:Clr6 histone deacetylase complex I''  
GO:0033698  C:Rpd3L complex  
GO:0070210  C:Rpd3L-Expanded complex  
GO:0070822  C:Sin3-type complex  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02671  PAH  
PF08295  Sin3_corepress  
PF16879  Sin3a_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51477  PAH  
Amino Acid Sequences MSTEKTQSENWADKGGNDTLNEEKPRLSANERERASLPVISAEAGYRTTEGHETTSPMIAGQRELPKTPTTAGSNVTVQNSAPQQSETRPLNVKDALSYLELVKHQFTDRPEVYDQYLAIMKEFKAQSITIPEVIEQVSTLFHDYPHLIEGFNNFLPLGYRVKGKQAAPQPTPNATSTTSQPPPLAAPGSSSLPPSSPALANWTIPGSTASPRPAPSSPSTFSPKPQVDFNYAIAYMNKVKARFPPNSGTYLNFLSILRTYQKEQKTLQEVRQQVSQLFVDAPDLLEEFKLFLPDNSTNEDISTSNLDVSRLPPVGNFTLPTTQNRERRPRPAPSAQIERSIAKRSKLARTVNDVQSPCSLNDTKLVSMAPYSKFAAQEEEVSVFSVLRKHLGDIVLFHRFLELLHMFREKLIDKTELLNSFSKLVKNEALTSWFAWFIHWNNDTIKVKNVPVPDRVWKAQTYESVGVSYRKNEDTQSGEICSGRDSLCNEVLNDTYLCVTNYSAFLTKPSHYENQYAEALQLVEDERCEYDWSITIFEETIGILSRLAGIKSPKADMDGETELNKRSFVVKSALKKLYGQECYMQVYSAVLKNPPTNALVVIRRLKEKHNEWTRHRREWKRVWGQVERNNYKPAMNIRFCEIEGADRRNLSARRLIKEIDDHYQRQKQRIDGAVPGFQFTQILDDHFIFLDVLKLCDAHLSSSSFYSYADKGRISAVLKALLSQFFGIPLPREALENELNSEAIESVEHHRDGLSKIISPKTNLSENTPSEPPESQPVQETKETVQRNTPEKNNGPNVRAPEGNVQASYEQDSFSKNLMGYNFFGNSIMYLLFRLISVCYDRLYRVKLALQKKTQPNKTYEDVLANCIAFLKGSMDASSIQKYLQSFNNEDCCTLSSLERIMKIICYRIHEVLLDPKLGQLLLLFESDGANSSATYREQMIYRNCVEAIVAPESKLYNMRWYPLQKKLCIQQLLPGDTTQHEFAAPSKAFTYYVDSYAISLITEGVDFIQVRMPFLRSSLQKISQYGYMLGRETGQVCALLNEQFCKSNLQLFFSPKTYTIFFEPETENVYINSFNMWVDERTKYLRERRTLVWRRWLNRTKAWKGDLPLHEVERLSTCTLEQVISSFGEKPVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.37
3 0.32
4 0.27
5 0.28
6 0.28
7 0.35
8 0.37
9 0.33
10 0.3
11 0.28
12 0.31
13 0.33
14 0.33
15 0.35
16 0.41
17 0.5
18 0.5
19 0.52
20 0.5
21 0.48
22 0.46
23 0.39
24 0.31
25 0.24
26 0.23
27 0.19
28 0.18
29 0.16
30 0.14
31 0.13
32 0.13
33 0.11
34 0.11
35 0.13
36 0.16
37 0.16
38 0.19
39 0.19
40 0.21
41 0.23
42 0.24
43 0.21
44 0.19
45 0.2
46 0.18
47 0.18
48 0.22
49 0.28
50 0.29
51 0.31
52 0.34
53 0.33
54 0.34
55 0.35
56 0.34
57 0.3
58 0.3
59 0.3
60 0.31
61 0.33
62 0.33
63 0.33
64 0.28
65 0.23
66 0.26
67 0.27
68 0.26
69 0.23
70 0.22
71 0.23
72 0.25
73 0.34
74 0.32
75 0.35
76 0.39
77 0.39
78 0.43
79 0.43
80 0.41
81 0.34
82 0.32
83 0.29
84 0.23
85 0.23
86 0.18
87 0.19
88 0.19
89 0.2
90 0.19
91 0.19
92 0.2
93 0.23
94 0.25
95 0.31
96 0.31
97 0.35
98 0.35
99 0.36
100 0.37
101 0.35
102 0.32
103 0.25
104 0.27
105 0.21
106 0.2
107 0.2
108 0.17
109 0.23
110 0.23
111 0.21
112 0.2
113 0.2
114 0.23
115 0.26
116 0.29
117 0.23
118 0.23
119 0.22
120 0.22
121 0.22
122 0.18
123 0.12
124 0.1
125 0.08
126 0.09
127 0.11
128 0.09
129 0.09
130 0.12
131 0.13
132 0.13
133 0.15
134 0.15
135 0.12
136 0.13
137 0.15
138 0.18
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.14
143 0.15
144 0.16
145 0.18
146 0.14
147 0.19
148 0.19
149 0.27
150 0.33
151 0.32
152 0.38
153 0.43
154 0.51
155 0.52
156 0.58
157 0.56
158 0.53
159 0.55
160 0.48
161 0.43
162 0.36
163 0.33
164 0.3
165 0.34
166 0.32
167 0.31
168 0.3
169 0.28
170 0.28
171 0.28
172 0.26
173 0.17
174 0.17
175 0.18
176 0.21
177 0.2
178 0.2
179 0.18
180 0.16
181 0.18
182 0.17
183 0.18
184 0.15
185 0.15
186 0.2
187 0.21
188 0.21
189 0.2
190 0.19
191 0.16
192 0.16
193 0.17
194 0.13
195 0.14
196 0.17
197 0.19
198 0.22
199 0.23
200 0.27
201 0.27
202 0.3
203 0.32
204 0.35
205 0.34
206 0.36
207 0.43
208 0.4
209 0.41
210 0.46
211 0.45
212 0.4
213 0.43
214 0.42
215 0.4
216 0.41
217 0.4
218 0.34
219 0.3
220 0.29
221 0.24
222 0.23
223 0.2
224 0.22
225 0.23
226 0.21
227 0.23
228 0.3
229 0.36
230 0.37
231 0.39
232 0.43
233 0.43
234 0.47
235 0.47
236 0.41
237 0.37
238 0.34
239 0.3
240 0.23
241 0.2
242 0.16
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.2
248 0.27
249 0.31
250 0.35
251 0.37
252 0.42
253 0.48
254 0.51
255 0.55
256 0.54
257 0.54
258 0.51
259 0.52
260 0.46
261 0.37
262 0.35
263 0.27
264 0.2
265 0.17
266 0.15
267 0.12
268 0.1
269 0.1
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.14
281 0.17
282 0.19
283 0.22
284 0.23
285 0.21
286 0.21
287 0.22
288 0.17
289 0.16
290 0.16
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.16
298 0.14
299 0.14
300 0.13
301 0.16
302 0.18
303 0.18
304 0.18
305 0.16
306 0.21
307 0.22
308 0.25
309 0.29
310 0.35
311 0.41
312 0.48
313 0.56
314 0.56
315 0.64
316 0.68
317 0.68
318 0.69
319 0.7
320 0.7
321 0.66
322 0.7
323 0.62
324 0.61
325 0.54
326 0.48
327 0.43
328 0.43
329 0.39
330 0.31
331 0.35
332 0.35
333 0.41
334 0.47
335 0.5
336 0.46
337 0.52
338 0.58
339 0.58
340 0.59
341 0.52
342 0.46
343 0.43
344 0.4
345 0.32
346 0.29
347 0.24
348 0.18
349 0.22
350 0.23
351 0.19
352 0.19
353 0.19
354 0.14
355 0.14
356 0.18
357 0.15
358 0.15
359 0.16
360 0.17
361 0.18
362 0.18
363 0.2
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.16
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.1
372 0.1
373 0.11
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.14
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.19
383 0.2
384 0.19
385 0.18
386 0.16
387 0.14
388 0.14
389 0.17
390 0.14
391 0.12
392 0.14
393 0.15
394 0.15
395 0.15
396 0.18
397 0.14
398 0.14
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.19
403 0.23
404 0.22
405 0.23
406 0.23
407 0.2
408 0.21
409 0.22
410 0.21
411 0.18
412 0.19
413 0.18
414 0.18
415 0.19
416 0.17
417 0.18
418 0.18
419 0.17
420 0.15
421 0.14
422 0.12
423 0.11
424 0.13
425 0.11
426 0.17
427 0.17
428 0.18
429 0.18
430 0.26
431 0.28
432 0.26
433 0.29
434 0.24
435 0.25
436 0.27
437 0.31
438 0.26
439 0.27
440 0.3
441 0.32
442 0.34
443 0.34
444 0.33
445 0.3
446 0.29
447 0.29
448 0.27
449 0.26
450 0.23
451 0.22
452 0.21
453 0.21
454 0.2
455 0.18
456 0.18
457 0.16
458 0.16
459 0.16
460 0.16
461 0.18
462 0.2
463 0.22
464 0.21
465 0.19
466 0.19
467 0.18
468 0.17
469 0.15
470 0.12
471 0.1
472 0.1
473 0.11
474 0.13
475 0.15
476 0.16
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.14
481 0.13
482 0.1
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.09
492 0.08
493 0.1
494 0.12
495 0.12
496 0.14
497 0.17
498 0.2
499 0.21
500 0.25
501 0.24
502 0.25
503 0.25
504 0.23
505 0.19
506 0.15
507 0.13
508 0.1
509 0.09
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.06
514 0.05
515 0.06
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.09
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.05
528 0.05
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.07
537 0.08
538 0.1
539 0.11
540 0.12
541 0.11
542 0.12
543 0.12
544 0.11
545 0.15
546 0.15
547 0.14
548 0.15
549 0.16
550 0.16
551 0.15
552 0.14
553 0.1
554 0.11
555 0.11
556 0.11
557 0.16
558 0.19
559 0.24
560 0.31
561 0.33
562 0.31
563 0.32
564 0.34
565 0.35
566 0.33
567 0.29
568 0.24
569 0.23
570 0.25
571 0.24
572 0.2
573 0.13
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.11
578 0.09
579 0.1
580 0.11
581 0.12
582 0.13
583 0.12
584 0.11
585 0.11
586 0.13
587 0.13
588 0.17
589 0.21
590 0.21
591 0.23
592 0.24
593 0.27
594 0.32
595 0.34
596 0.4
597 0.46
598 0.52
599 0.57
600 0.67
601 0.7
602 0.72
603 0.77
604 0.75
605 0.75
606 0.76
607 0.79
608 0.77
609 0.75
610 0.72
611 0.7
612 0.69
613 0.66
614 0.67
615 0.6
616 0.53
617 0.5
618 0.45
619 0.37
620 0.33
621 0.34
622 0.32
623 0.3
624 0.28
625 0.29
626 0.29
627 0.29
628 0.27
629 0.2
630 0.17
631 0.19
632 0.21
633 0.2
634 0.18
635 0.19
636 0.23
637 0.24
638 0.21
639 0.24
640 0.26
641 0.28
642 0.3
643 0.3
644 0.26
645 0.3
646 0.31
647 0.3
648 0.3
649 0.29
650 0.33
651 0.4
652 0.4
653 0.42
654 0.42
655 0.38
656 0.39
657 0.41
658 0.37
659 0.34
660 0.34
661 0.32
662 0.29
663 0.27
664 0.22
665 0.17
666 0.15
667 0.1
668 0.1
669 0.07
670 0.08
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.07
677 0.07
678 0.1
679 0.08
680 0.09
681 0.08
682 0.08
683 0.08
684 0.1
685 0.1
686 0.07
687 0.09
688 0.1
689 0.11
690 0.11
691 0.12
692 0.1
693 0.11
694 0.12
695 0.12
696 0.13
697 0.14
698 0.13
699 0.14
700 0.14
701 0.17
702 0.16
703 0.17
704 0.16
705 0.16
706 0.16
707 0.16
708 0.17
709 0.14
710 0.13
711 0.11
712 0.1
713 0.08
714 0.09
715 0.08
716 0.08
717 0.09
718 0.1
719 0.1
720 0.1
721 0.1
722 0.14
723 0.16
724 0.15
725 0.16
726 0.15
727 0.14
728 0.13
729 0.13
730 0.09
731 0.06
732 0.06
733 0.06
734 0.09
735 0.12
736 0.13
737 0.12
738 0.12
739 0.14
740 0.15
741 0.18
742 0.16
743 0.16
744 0.2
745 0.24
746 0.25
747 0.26
748 0.28
749 0.27
750 0.31
751 0.29
752 0.31
753 0.33
754 0.34
755 0.36
756 0.34
757 0.32
758 0.29
759 0.29
760 0.25
761 0.24
762 0.24
763 0.2
764 0.23
765 0.24
766 0.26
767 0.26
768 0.27
769 0.23
770 0.29
771 0.3
772 0.27
773 0.31
774 0.33
775 0.37
776 0.41
777 0.44
778 0.44
779 0.47
780 0.53
781 0.56
782 0.54
783 0.52
784 0.5
785 0.49
786 0.44
787 0.4
788 0.35
789 0.32
790 0.31
791 0.29
792 0.26
793 0.22
794 0.2
795 0.2
796 0.21
797 0.15
798 0.12
799 0.11
800 0.13
801 0.13
802 0.14
803 0.15
804 0.12
805 0.14
806 0.15
807 0.17
808 0.16
809 0.17
810 0.17
811 0.15
812 0.15
813 0.13
814 0.11
815 0.1
816 0.09
817 0.06
818 0.06
819 0.06
820 0.06
821 0.06
822 0.06
823 0.06
824 0.07
825 0.1
826 0.1
827 0.11
828 0.12
829 0.15
830 0.18
831 0.21
832 0.2
833 0.21
834 0.25
835 0.32
836 0.39
837 0.45
838 0.48
839 0.54
840 0.63
841 0.7
842 0.73
843 0.71
844 0.68
845 0.65
846 0.62
847 0.58
848 0.5
849 0.47
850 0.39
851 0.36
852 0.33
853 0.27
854 0.23
855 0.19
856 0.17
857 0.1
858 0.09
859 0.08
860 0.07
861 0.08
862 0.08
863 0.09
864 0.11
865 0.14
866 0.16
867 0.14
868 0.13
869 0.15
870 0.16
871 0.18
872 0.22
873 0.25
874 0.25
875 0.3
876 0.38
877 0.36
878 0.35
879 0.33
880 0.29
881 0.25
882 0.24
883 0.2
884 0.14
885 0.17
886 0.19
887 0.19
888 0.18
889 0.17
890 0.19
891 0.2
892 0.24
893 0.23
894 0.25
895 0.29
896 0.29
897 0.3
898 0.27
899 0.27
900 0.3
901 0.29
902 0.25
903 0.21
904 0.2
905 0.19
906 0.18
907 0.16
908 0.08
909 0.08
910 0.08
911 0.09
912 0.08
913 0.08
914 0.08
915 0.08
916 0.09
917 0.08
918 0.07
919 0.07
920 0.08
921 0.1
922 0.1
923 0.11
924 0.12
925 0.13
926 0.15
927 0.22
928 0.26
929 0.3
930 0.31
931 0.31
932 0.29
933 0.27
934 0.26
935 0.22
936 0.2
937 0.19
938 0.18
939 0.16
940 0.18
941 0.18
942 0.19
943 0.2
944 0.18
945 0.22
946 0.23
947 0.26
948 0.31
949 0.39
950 0.45
951 0.51
952 0.56
953 0.51
954 0.55
955 0.59
956 0.61
957 0.57
958 0.51
959 0.48
960 0.49
961 0.49
962 0.44
963 0.38
964 0.31
965 0.28
966 0.31
967 0.25
968 0.17
969 0.14
970 0.13
971 0.15
972 0.22
973 0.2
974 0.19
975 0.19
976 0.19
977 0.2
978 0.21
979 0.26
980 0.2
981 0.21
982 0.21
983 0.2
984 0.2
985 0.2
986 0.19
987 0.11
988 0.09
989 0.07
990 0.06
991 0.06
992 0.06
993 0.05
994 0.08
995 0.08
996 0.09
997 0.14
998 0.13
999 0.15
1000 0.17
1001 0.19
1002 0.16
1003 0.18
1004 0.25
1005 0.22
1006 0.3
1007 0.35
1008 0.4
1009 0.42
1010 0.44
1011 0.45
1012 0.41
1013 0.4
1014 0.36
1015 0.31
1016 0.27
1017 0.24
1018 0.23
1019 0.21
1020 0.2
1021 0.19
1022 0.17
1023 0.15
1024 0.13
1025 0.12
1026 0.13
1027 0.14
1028 0.15
1029 0.15
1030 0.17
1031 0.18
1032 0.2
1033 0.21
1034 0.24
1035 0.23
1036 0.27
1037 0.28
1038 0.31
1039 0.34
1040 0.37
1041 0.4
1042 0.38
1043 0.39
1044 0.33
1045 0.35
1046 0.31
1047 0.29
1048 0.29
1049 0.29
1050 0.27
1051 0.3
1052 0.3
1053 0.28
1054 0.31
1055 0.28
1056 0.25
1057 0.21
1058 0.21
1059 0.17
1060 0.15
1061 0.15
1062 0.11
1063 0.1
1064 0.11
1065 0.13
1066 0.14
1067 0.17
1068 0.19
1069 0.22
1070 0.26
1071 0.31
1072 0.37
1073 0.44
1074 0.51
1075 0.54
1076 0.57
1077 0.61
1078 0.68
1079 0.73
1080 0.73
1081 0.74
1082 0.74
1083 0.73
1084 0.79
1085 0.81
1086 0.77
1087 0.77
1088 0.79
1089 0.77
1090 0.77
1091 0.77
1092 0.72
1093 0.67
1094 0.69
1095 0.63
1096 0.59
1097 0.56
1098 0.49
1099 0.47
1100 0.41
1101 0.39
1102 0.32
1103 0.31
1104 0.26
1105 0.22
1106 0.19
1107 0.2
1108 0.21
1109 0.19
1110 0.15
1111 0.14
1112 0.14
1113 0.15
1114 0.16
1115 0.15