Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6K8D4

Protein Details
Accession B6K8D4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-75QRAAQHGTRRARTRRRRINGSNVQSMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-65RARTRRR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038886  E3_SLX5/Rfp1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0035861  C:site of double-strand break  
GO:0033768  C:SUMO-targeted ubiquitin ligase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016874  F:ligase activity  
GO:0140082  F:SUMO-ubiquitin ligase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0120290  P:stalled replication fork localization to nuclear periphery  
GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
Amino Acid Sequences MQLNGNESGNDNVIDLTGSSPPREASDPNPVIIDVDAIPDDAIPLSESSQRAAQHGTRRARTRRRRINGSNVQSMLEDIVYLGPQLLTRRIFQSRRVPESIARNSLTERNIPGYIPAQFFTIFSNRLRYTLANHPMLFEQGYFNDTNVEPEESYIDRAKAEYTPPKPARAGFSRSINPSTVLLCPGCQEELGASKNAQKATLWATKCGHVYCGLCKDAIKNAKRTERKCAVPSCRQSLVSKNALFQLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.09
4 0.12
5 0.13
6 0.13
7 0.14
8 0.15
9 0.18
10 0.2
11 0.21
12 0.21
13 0.31
14 0.32
15 0.32
16 0.32
17 0.29
18 0.27
19 0.24
20 0.21
21 0.1
22 0.1
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.07
27 0.08
28 0.06
29 0.06
30 0.05
31 0.06
32 0.08
33 0.12
34 0.12
35 0.14
36 0.17
37 0.18
38 0.18
39 0.22
40 0.25
41 0.3
42 0.38
43 0.44
44 0.48
45 0.56
46 0.64
47 0.71
48 0.77
49 0.8
50 0.82
51 0.84
52 0.87
53 0.86
54 0.87
55 0.86
56 0.82
57 0.77
58 0.66
59 0.58
60 0.47
61 0.4
62 0.29
63 0.19
64 0.12
65 0.06
66 0.05
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.06
73 0.1
74 0.11
75 0.13
76 0.17
77 0.24
78 0.25
79 0.31
80 0.4
81 0.44
82 0.48
83 0.49
84 0.47
85 0.45
86 0.52
87 0.49
88 0.43
89 0.36
90 0.31
91 0.31
92 0.33
93 0.3
94 0.23
95 0.19
96 0.18
97 0.17
98 0.17
99 0.16
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.14
104 0.12
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.17
112 0.16
113 0.16
114 0.17
115 0.16
116 0.19
117 0.25
118 0.3
119 0.28
120 0.28
121 0.28
122 0.27
123 0.27
124 0.23
125 0.15
126 0.1
127 0.07
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.1
132 0.09
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.1
137 0.1
138 0.12
139 0.1
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.16
148 0.22
149 0.23
150 0.33
151 0.35
152 0.38
153 0.38
154 0.39
155 0.4
156 0.37
157 0.4
158 0.34
159 0.39
160 0.4
161 0.42
162 0.43
163 0.37
164 0.33
165 0.28
166 0.25
167 0.2
168 0.18
169 0.15
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.1
176 0.08
177 0.12
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.18
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.18
186 0.18
187 0.24
188 0.31
189 0.27
190 0.29
191 0.31
192 0.33
193 0.36
194 0.34
195 0.29
196 0.26
197 0.27
198 0.28
199 0.32
200 0.29
201 0.27
202 0.27
203 0.28
204 0.32
205 0.4
206 0.39
207 0.42
208 0.49
209 0.59
210 0.68
211 0.69
212 0.7
213 0.69
214 0.72
215 0.71
216 0.73
217 0.71
218 0.72
219 0.77
220 0.74
221 0.7
222 0.66
223 0.62
224 0.6
225 0.59
226 0.57
227 0.51
228 0.46
229 0.46