Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JWB5

Protein Details
Accession B6JWB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-288EEQQGPSRKRKSTTKRPAKRRGPHVEIEYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-281SRKRKSTTKRPAKRRG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR006958  Mak16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF04874  Mak16  
PF01778  Ribosomal_L28e  
Amino Acid Sequences MQQDEIIWQVVGHEFCSYRVKGEAQNFCRNEYNVTGLCNRESCPLANSRYATIREDNGKLYLYMKTIERAFTPAKLWQRIKLSKNYAQALEQIDKHLLYWPGPQIHRCKQRLTRLTQYLLKARRLALKHQPTLIPIKPKQTRRETTRERKALIAAKLEKNIEKELVERLKSGVYGDQPLNVNEDIWKKVLAAKEGLVDEAQELEDLEEAEMEFVSDEEEEEEISDLEDWLASGDDDEDEDESLSEESDEEESSESSSDDEEQQGPSRKRKSTTKRPAKRRGPHVEIEYEREEELEKPTSMSNAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.17
3 0.23
4 0.22
5 0.2
6 0.23
7 0.26
8 0.31
9 0.39
10 0.47
11 0.48
12 0.57
13 0.56
14 0.57
15 0.59
16 0.53
17 0.47
18 0.4
19 0.39
20 0.3
21 0.32
22 0.32
23 0.29
24 0.3
25 0.28
26 0.26
27 0.24
28 0.25
29 0.23
30 0.23
31 0.27
32 0.29
33 0.32
34 0.33
35 0.32
36 0.35
37 0.36
38 0.36
39 0.33
40 0.34
41 0.34
42 0.34
43 0.33
44 0.29
45 0.28
46 0.25
47 0.23
48 0.2
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.18
53 0.18
54 0.19
55 0.18
56 0.21
57 0.21
58 0.21
59 0.22
60 0.25
61 0.3
62 0.38
63 0.39
64 0.4
65 0.48
66 0.54
67 0.57
68 0.6
69 0.6
70 0.58
71 0.63
72 0.6
73 0.52
74 0.45
75 0.44
76 0.39
77 0.34
78 0.28
79 0.23
80 0.21
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.16
85 0.14
86 0.16
87 0.19
88 0.24
89 0.25
90 0.29
91 0.33
92 0.41
93 0.49
94 0.49
95 0.52
96 0.55
97 0.63
98 0.67
99 0.67
100 0.67
101 0.62
102 0.64
103 0.61
104 0.56
105 0.54
106 0.5
107 0.46
108 0.38
109 0.35
110 0.37
111 0.34
112 0.37
113 0.4
114 0.43
115 0.43
116 0.43
117 0.42
118 0.38
119 0.42
120 0.39
121 0.37
122 0.31
123 0.37
124 0.42
125 0.48
126 0.54
127 0.57
128 0.62
129 0.61
130 0.69
131 0.7
132 0.74
133 0.78
134 0.74
135 0.66
136 0.59
137 0.56
138 0.52
139 0.43
140 0.39
141 0.34
142 0.31
143 0.32
144 0.32
145 0.3
146 0.26
147 0.25
148 0.19
149 0.15
150 0.14
151 0.18
152 0.21
153 0.2
154 0.18
155 0.18
156 0.17
157 0.17
158 0.16
159 0.13
160 0.1
161 0.13
162 0.12
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.17
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.16
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.12
175 0.15
176 0.17
177 0.16
178 0.15
179 0.14
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.13
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.12
247 0.13
248 0.15
249 0.21
250 0.3
251 0.34
252 0.42
253 0.48
254 0.51
255 0.56
256 0.65
257 0.7
258 0.72
259 0.78
260 0.81
261 0.84
262 0.9
263 0.94
264 0.94
265 0.93
266 0.93
267 0.92
268 0.88
269 0.85
270 0.8
271 0.78
272 0.7
273 0.66
274 0.59
275 0.5
276 0.42
277 0.35
278 0.3
279 0.22
280 0.24
281 0.22
282 0.19
283 0.19
284 0.2