Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JX31

Protein Details
Accession B6JX31    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-136DAPAIKPERKSKRTRSNAASNENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-131KPERKSKRTRSNA
138-147GSNSGKRRKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0017054  C:negative cofactor 2 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001046  F:core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MSEEAKTEAETSSAASSTATPASAPAAAAWKSRFPLARIKKIMQADQDVGKVAQVTPIIVSKALELFMQSIITESCKQTRLHNAKRVTVSHLKHAVQSVDQFDFLQEIVEKVPDAPAIKPERKSKRTRSNAASNENGGSNSGKRRKRPDSESTSSKQSAAEPVKEESAGSEEAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.12
6 0.1
7 0.09
8 0.09
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.08
13 0.13
14 0.14
15 0.17
16 0.18
17 0.19
18 0.2
19 0.24
20 0.26
21 0.23
22 0.33
23 0.39
24 0.47
25 0.5
26 0.51
27 0.54
28 0.55
29 0.57
30 0.5
31 0.46
32 0.38
33 0.35
34 0.33
35 0.27
36 0.23
37 0.19
38 0.16
39 0.11
40 0.11
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.07
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.12
63 0.15
64 0.16
65 0.18
66 0.29
67 0.36
68 0.43
69 0.5
70 0.5
71 0.52
72 0.54
73 0.52
74 0.47
75 0.45
76 0.38
77 0.36
78 0.38
79 0.34
80 0.32
81 0.33
82 0.27
83 0.21
84 0.21
85 0.18
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.15
104 0.21
105 0.25
106 0.31
107 0.4
108 0.49
109 0.55
110 0.64
111 0.68
112 0.72
113 0.78
114 0.82
115 0.8
116 0.8
117 0.8
118 0.77
119 0.7
120 0.6
121 0.52
122 0.44
123 0.36
124 0.27
125 0.21
126 0.18
127 0.25
128 0.32
129 0.36
130 0.43
131 0.53
132 0.61
133 0.68
134 0.73
135 0.74
136 0.75
137 0.77
138 0.77
139 0.72
140 0.7
141 0.62
142 0.54
143 0.45
144 0.37
145 0.39
146 0.37
147 0.37
148 0.32
149 0.34
150 0.35
151 0.34
152 0.32
153 0.24
154 0.22
155 0.18