Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JXD4

Protein Details
Accession B6JXD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-123MRAWLNAKKNQRRTLQRLDIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:1903715  P:regulation of aerobic respiration  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MVNTMQHYEQPVVSAPPPSDYSGLFENVTKGLSGSDAQVLADYWQRMIDNLEMDNQNIKTLQLPLARIKKVMKTDDDVKTKMISAEAPFLFAKGSEIFITELTMRAWLNAKKNQRRTLQRLDIANAISKSEMFDFLIDIISKDESFHPRTNDSHASFVLPGYQQGPTSRASPSVFDQIRIPPSQMTVPSHPYALGPQARQAPPQHAAYAGQPMRAVMNPSNPQPQYLSYGRSSAFPGNPNGMQETGEKGIYKQQQQQQQQPPGAPGNEPDYMRMPAQGVSDTSSSNNMLGTQRVLSVAPYLAEHLYRYPPTHLYAMPGAMRYSPTVQYGQQQSSQLSQQQQQQPMAAPYGSGTGAATMPNAGVYEQSVYAGDPAGNQPTQPSQQQQMPANIQQQQPTHQQQAPNSQQSSHLPPQVLSQQQVMYSPYGRANE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.21
3 0.23
4 0.25
5 0.25
6 0.25
7 0.22
8 0.24
9 0.23
10 0.25
11 0.22
12 0.2
13 0.2
14 0.19
15 0.19
16 0.15
17 0.12
18 0.1
19 0.11
20 0.11
21 0.11
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.16
29 0.14
30 0.12
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.16
35 0.17
36 0.15
37 0.16
38 0.21
39 0.2
40 0.21
41 0.26
42 0.23
43 0.22
44 0.2
45 0.19
46 0.16
47 0.18
48 0.23
49 0.21
50 0.25
51 0.32
52 0.4
53 0.41
54 0.42
55 0.43
56 0.44
57 0.47
58 0.5
59 0.46
60 0.44
61 0.51
62 0.57
63 0.59
64 0.53
65 0.48
66 0.43
67 0.4
68 0.34
69 0.27
70 0.21
71 0.17
72 0.23
73 0.21
74 0.23
75 0.21
76 0.21
77 0.19
78 0.16
79 0.17
80 0.1
81 0.12
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.11
91 0.09
92 0.1
93 0.15
94 0.18
95 0.25
96 0.32
97 0.42
98 0.5
99 0.59
100 0.66
101 0.7
102 0.75
103 0.77
104 0.8
105 0.78
106 0.74
107 0.68
108 0.62
109 0.57
110 0.48
111 0.43
112 0.33
113 0.24
114 0.19
115 0.16
116 0.15
117 0.12
118 0.12
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.12
131 0.16
132 0.21
133 0.24
134 0.26
135 0.28
136 0.3
137 0.35
138 0.39
139 0.35
140 0.33
141 0.29
142 0.28
143 0.25
144 0.23
145 0.2
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.13
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.17
160 0.24
161 0.23
162 0.22
163 0.24
164 0.24
165 0.27
166 0.26
167 0.24
168 0.15
169 0.16
170 0.18
171 0.18
172 0.18
173 0.18
174 0.21
175 0.21
176 0.21
177 0.19
178 0.18
179 0.16
180 0.18
181 0.18
182 0.14
183 0.17
184 0.24
185 0.24
186 0.27
187 0.27
188 0.26
189 0.26
190 0.26
191 0.23
192 0.17
193 0.18
194 0.16
195 0.22
196 0.19
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.09
204 0.15
205 0.16
206 0.19
207 0.25
208 0.24
209 0.24
210 0.23
211 0.23
212 0.22
213 0.22
214 0.23
215 0.18
216 0.2
217 0.2
218 0.2
219 0.21
220 0.18
221 0.19
222 0.18
223 0.18
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.18
228 0.15
229 0.14
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.17
237 0.21
238 0.24
239 0.29
240 0.33
241 0.41
242 0.46
243 0.56
244 0.58
245 0.6
246 0.58
247 0.51
248 0.49
249 0.43
250 0.39
251 0.29
252 0.22
253 0.2
254 0.21
255 0.2
256 0.19
257 0.18
258 0.19
259 0.19
260 0.18
261 0.15
262 0.13
263 0.14
264 0.13
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.14
293 0.15
294 0.16
295 0.18
296 0.19
297 0.22
298 0.24
299 0.22
300 0.22
301 0.21
302 0.22
303 0.2
304 0.19
305 0.17
306 0.15
307 0.15
308 0.14
309 0.15
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.24
315 0.29
316 0.29
317 0.3
318 0.31
319 0.29
320 0.3
321 0.32
322 0.3
323 0.29
324 0.31
325 0.36
326 0.41
327 0.45
328 0.43
329 0.42
330 0.4
331 0.38
332 0.35
333 0.26
334 0.19
335 0.14
336 0.15
337 0.13
338 0.1
339 0.08
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.06
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.11
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.16
365 0.2
366 0.24
367 0.27
368 0.29
369 0.31
370 0.35
371 0.42
372 0.45
373 0.47
374 0.49
375 0.5
376 0.52
377 0.52
378 0.5
379 0.49
380 0.46
381 0.44
382 0.47
383 0.48
384 0.5
385 0.48
386 0.5
387 0.5
388 0.59
389 0.63
390 0.62
391 0.56
392 0.5
393 0.51
394 0.51
395 0.54
396 0.5
397 0.46
398 0.39
399 0.38
400 0.43
401 0.46
402 0.45
403 0.39
404 0.35
405 0.32
406 0.32
407 0.33
408 0.3
409 0.25
410 0.23
411 0.23