Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JV57

Protein Details
Accession B6JV57    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAKKVKSVEKKSKSSKAVAPHydrophilic
37-68KAAKAALKEKKEKSSKKSKKSKKEESESSESEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-59KKVKSVEKKSKSSKAVAPKSGAVEKTSKNKEIAKKAAKAALKEKKEKSSKKSKKSKK
396-431GGFGGRGGFGGRGGGRGRGGFGGRGGFGGRGRGGAR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0001651  C:dense fibrillar component  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
Amino Acid Sequences MAKKVKSVEKKSKSSKAVAPKSGAVEKTSKNKEIAKKAAKAALKEKKEKSSKKSKKSKKEESESSESEESESEKEEDVKMEESSSSSESSSSESESSDSESSESEAEKKEEAKEAESSSSESESSDSESESEDAKKETKTESKKEESDSDSSSDSDSDDSSDSSSSDSDSDDSSSSESSDKKRKADDESEEQKPQKAAKSESGESCTVFVGRLSWNVDDEWLGKEFEEYGTVVNARVIMDGQSGRSKGFGYVDFDSPEAAKAAVAVNGQKEIDGRMVNLDISTPRPAQNNNGFAQQRASNFGDKQSPPSDTVFIGNLSFNATEDDVRNAFSSCGEIQSVRLPTDMNSGRPKGFGYVTFDSIDAAKQCVEMNGHFIAGRPCRLDFSTPRTGNAGGRGGFGGRGGFGGRGGGRGRGGFGGRGGFGGRGRGGARSGGFNRSTEFSGNKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.78
4 0.78
5 0.74
6 0.69
7 0.63
8 0.62
9 0.61
10 0.54
11 0.47
12 0.44
13 0.43
14 0.49
15 0.52
16 0.5
17 0.49
18 0.56
19 0.62
20 0.65
21 0.7
22 0.69
23 0.68
24 0.69
25 0.71
26 0.66
27 0.62
28 0.63
29 0.62
30 0.62
31 0.65
32 0.66
33 0.7
34 0.76
35 0.8
36 0.79
37 0.8
38 0.82
39 0.84
40 0.89
41 0.89
42 0.9
43 0.92
44 0.94
45 0.93
46 0.93
47 0.92
48 0.89
49 0.87
50 0.78
51 0.74
52 0.64
53 0.53
54 0.43
55 0.34
56 0.27
57 0.2
58 0.2
59 0.15
60 0.15
61 0.16
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.18
66 0.16
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.14
93 0.15
94 0.16
95 0.18
96 0.19
97 0.24
98 0.25
99 0.24
100 0.25
101 0.25
102 0.25
103 0.24
104 0.23
105 0.19
106 0.18
107 0.16
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.11
120 0.13
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.2
125 0.27
126 0.33
127 0.4
128 0.46
129 0.51
130 0.53
131 0.55
132 0.55
133 0.51
134 0.46
135 0.41
136 0.35
137 0.29
138 0.26
139 0.23
140 0.18
141 0.14
142 0.11
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.17
166 0.25
167 0.29
168 0.31
169 0.34
170 0.37
171 0.41
172 0.46
173 0.47
174 0.47
175 0.5
176 0.51
177 0.52
178 0.49
179 0.44
180 0.39
181 0.35
182 0.3
183 0.28
184 0.26
185 0.29
186 0.34
187 0.35
188 0.35
189 0.37
190 0.33
191 0.29
192 0.26
193 0.19
194 0.14
195 0.11
196 0.09
197 0.07
198 0.07
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.17
240 0.17
241 0.16
242 0.16
243 0.14
244 0.13
245 0.09
246 0.07
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.1
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.07
268 0.09
269 0.12
270 0.12
271 0.14
272 0.16
273 0.18
274 0.24
275 0.31
276 0.33
277 0.31
278 0.37
279 0.36
280 0.34
281 0.36
282 0.31
283 0.25
284 0.26
285 0.27
286 0.23
287 0.24
288 0.26
289 0.3
290 0.28
291 0.32
292 0.29
293 0.29
294 0.28
295 0.29
296 0.28
297 0.21
298 0.22
299 0.18
300 0.16
301 0.14
302 0.12
303 0.1
304 0.11
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.11
311 0.14
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.13
316 0.12
317 0.11
318 0.13
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.12
324 0.17
325 0.19
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.15
330 0.24
331 0.25
332 0.25
333 0.29
334 0.32
335 0.32
336 0.32
337 0.32
338 0.26
339 0.26
340 0.24
341 0.25
342 0.25
343 0.27
344 0.27
345 0.26
346 0.24
347 0.22
348 0.21
349 0.14
350 0.12
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.12
355 0.14
356 0.13
357 0.16
358 0.15
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.21
363 0.22
364 0.24
365 0.22
366 0.23
367 0.25
368 0.28
369 0.32
370 0.32
371 0.36
372 0.44
373 0.43
374 0.44
375 0.44
376 0.43
377 0.39
378 0.38
379 0.36
380 0.26
381 0.26
382 0.25
383 0.22
384 0.21
385 0.19
386 0.14
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.11
393 0.11
394 0.14
395 0.15
396 0.17
397 0.18
398 0.18
399 0.2
400 0.19
401 0.21
402 0.18
403 0.19
404 0.19
405 0.17
406 0.17
407 0.17
408 0.16
409 0.15
410 0.18
411 0.16
412 0.17
413 0.18
414 0.19
415 0.2
416 0.22
417 0.22
418 0.26
419 0.29
420 0.32
421 0.33
422 0.32
423 0.34
424 0.33
425 0.34
426 0.3
427 0.29
428 0.25
429 0.33