FuNGI

B6K5B2

Protein Details

Accession

B6K5B2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
375-402	DVIIVKKTYSNPKRRKNRFWKLKSIGID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
387-392	KRRKNR

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 12.5, cyto 8, cysk 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MEQGMVNAAGFSYIASESTQSTILCCQCGVPIPQNPAAMCLDCIKMSTDITEGIPRDGMLSYCRECERYLQPPNVWVAAQLESRELMAICLKKLRGLNQVRLIDASFIWTEPHSRRVKVKLTVQKEAFTNTILQQSMVVEYVVNYTQCPDCARTYTPHIWKACVQVRQKVLHKRTFLYLEQVILKNRAHLNTVNIKEAKDGIDFFTLSSSEELISKDIKSNTAHYKFTYSIEIVPICKDDLVCLPKPLAKAHGNISQLLLCTKVGTTIHFIDPLTLQTCEMLPTTYWHMPFPSLADIGELSEFIVADVDFLGPTNGKNVLADVELIKSSDGSTHMARTHLGALLSAGNTVLCYHMAITNFNNEIFDALKDNLIPDVIIVKKTYSNPKRRKNRFWKLKSIGIDQGELEPKKQDLERQERDYELFLRNLEEDPELRQNINLYKNDAYRPPADNEMEEDDEEIDDEEVPAISVDELLDDVESMHIADE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.08
3	0.09
4	0.1
5	0.12
6	0.14
7	0.12
8	0.13
9	0.19
10	0.2
11	0.2
12	0.19
13	0.18
14	0.18
15	0.23
16	0.26
17	0.27
18	0.32
19	0.37
20	0.41
21	0.44
22	0.42
23	0.4
24	0.38
25	0.31
26	0.26
27	0.23
28	0.2
29	0.17
30	0.18
31	0.17
32	0.16
33	0.16
34	0.16
35	0.14
36	0.14
37	0.16
38	0.2
39	0.19
40	0.18
41	0.18
42	0.17
43	0.17
44	0.16
45	0.15
46	0.12
47	0.17
48	0.18
49	0.21
50	0.23
51	0.23
52	0.24
53	0.29
54	0.34
55	0.38
56	0.44
57	0.47
58	0.46
59	0.48
60	0.5
61	0.46
62	0.38
63	0.3
64	0.24
65	0.21
66	0.21
67	0.18
68	0.16
69	0.15
70	0.15
71	0.15
72	0.12
73	0.1
74	0.14
75	0.15
76	0.15
77	0.19
78	0.19
79	0.23
80	0.26
81	0.3
82	0.35
83	0.4
84	0.47
85	0.52
86	0.53
87	0.5
88	0.48
89	0.43
90	0.33
91	0.26
92	0.21
93	0.13
94	0.11
95	0.11
96	0.11
97	0.15
98	0.16
99	0.26
100	0.27
101	0.3
102	0.35
103	0.42
104	0.49
105	0.51
106	0.58
107	0.59
108	0.61
109	0.67
110	0.63
111	0.58
112	0.52
113	0.48
114	0.39
115	0.3
116	0.26
117	0.19
118	0.21
119	0.18
120	0.17
121	0.15
122	0.15
123	0.14
124	0.12
125	0.1
126	0.06
127	0.06
128	0.08
129	0.09
130	0.08
131	0.08
132	0.09
133	0.1
134	0.11
135	0.13
136	0.14
137	0.14
138	0.18
139	0.2
140	0.22
141	0.29
142	0.36
143	0.4
144	0.44
145	0.43
146	0.42
147	0.42
148	0.47
149	0.45
150	0.45
151	0.42
152	0.42
153	0.46
154	0.5
155	0.55
156	0.57
157	0.59
158	0.58
159	0.57
160	0.52
161	0.51
162	0.49
163	0.43
164	0.38
165	0.31
166	0.27
167	0.28
168	0.28
169	0.25
170	0.23
171	0.23
172	0.22
173	0.23
174	0.22
175	0.21
176	0.2
177	0.24
178	0.29
179	0.31
180	0.32
181	0.3
182	0.3
183	0.28
184	0.27
185	0.24
186	0.16
187	0.15
188	0.11
189	0.12
190	0.12
191	0.11
192	0.11
193	0.09
194	0.09
195	0.09
196	0.07
197	0.06
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.09
202	0.09
203	0.12
204	0.13
205	0.15
206	0.15
207	0.19
208	0.27
209	0.3
210	0.31
211	0.27
212	0.3
213	0.29
214	0.29
215	0.27
216	0.18
217	0.15
218	0.16
219	0.16
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.09
224	0.09
225	0.08
226	0.07
227	0.11
228	0.15
229	0.15
230	0.15
231	0.16
232	0.17
233	0.19
234	0.18
235	0.2
236	0.17
237	0.19
238	0.22
239	0.27
240	0.26
241	0.25
242	0.25
243	0.2
244	0.18
245	0.16
246	0.13
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.08
251	0.07
252	0.08
253	0.11
254	0.13
255	0.13
256	0.14
257	0.14
258	0.13
259	0.13
260	0.13
261	0.12
262	0.09
263	0.09
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.06
270	0.08
271	0.13
272	0.15
273	0.16
274	0.15
275	0.16
276	0.16
277	0.16
278	0.15
279	0.12
280	0.1
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.08
286	0.07
287	0.05
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.05
299	0.04
300	0.05
301	0.06
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.08
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.08
318	0.1
319	0.11
320	0.13
321	0.15
322	0.15
323	0.15
324	0.15
325	0.15
326	0.14
327	0.13
328	0.1
329	0.1
330	0.11
331	0.11
332	0.09
333	0.08
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.08
342	0.09
343	0.11
344	0.12
345	0.16
346	0.17
347	0.17
348	0.16
349	0.14
350	0.14
351	0.13
352	0.12
353	0.11
354	0.1
355	0.11
356	0.11
357	0.11
358	0.11
359	0.1
360	0.09
361	0.06
362	0.1
363	0.11
364	0.12
365	0.12
366	0.13
367	0.17
368	0.23
369	0.34
370	0.39
371	0.49
372	0.58
373	0.68
374	0.78
375	0.84
376	0.91
377	0.91
378	0.92
379	0.93
380	0.91
381	0.92
382	0.87
383	0.84
384	0.78
385	0.72
386	0.67
387	0.57
388	0.5
389	0.4
390	0.38
391	0.37
392	0.33
393	0.28
394	0.24
395	0.22
396	0.25
397	0.26
398	0.27
399	0.3
400	0.4
401	0.48
402	0.52
403	0.54
404	0.53
405	0.53
406	0.5
407	0.44
408	0.37
409	0.3
410	0.25
411	0.24
412	0.23
413	0.22
414	0.21
415	0.19
416	0.16
417	0.19
418	0.26
419	0.25
420	0.24
421	0.25
422	0.27
423	0.31
424	0.38
425	0.35
426	0.33
427	0.36
428	0.4
429	0.43
430	0.43
431	0.42
432	0.4
433	0.41
434	0.41
435	0.42
436	0.4
437	0.37
438	0.37
439	0.38
440	0.35
441	0.31
442	0.28
443	0.22
444	0.2
445	0.19
446	0.15
447	0.1
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.05
463	0.06
464	0.06
465	0.06

B6K5B2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer