Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3CMS5

Protein Details
Accession A0A2H3CMS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-310SQEQSQSQPKRSQRTRKGKAVRMEVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
330-341RKSKPSRRSSRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.333, cyto 7, cyto_mito 4.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011513  Nse1  
IPR014857  Nse1_RING_C4HC3-type  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF07574  SMC_Nse1  
PF08746  zf-RING-like  
Amino Acid Sequences MVSADDVQRVFLQAVLSRGVLSENLAKILWARSIEVVKAADEHVDIQYTGSDASWNDFVAKANKSLDALDLGFRLVQDELTGKKMYVLANLKDDEVAQLATDYSAGEIAFFKAVVEQIMLAPREAYSVSSLAALREVSQVKPTMSKSQAEDVLTSLIANGWLLKSKRGRYSLSVRTQLELQPYLKNTYPDDILECTICQEMVTKGFACHTPNCKVRVHTYCFTQTRKHRSSCPACNVDWPRNGGKPLLSVGEDAAKEGDDQRRRAKHTPAQSDDDSDEEEDMDASQEQSQSQPKRSQRTRKGKAVRMEVDQDDEDVKDEGDDDDDDESSRKSKPSRRSSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.17
4 0.15
5 0.15
6 0.14
7 0.12
8 0.12
9 0.16
10 0.15
11 0.16
12 0.16
13 0.16
14 0.17
15 0.19
16 0.19
17 0.15
18 0.15
19 0.18
20 0.2
21 0.21
22 0.22
23 0.21
24 0.18
25 0.18
26 0.17
27 0.14
28 0.13
29 0.14
30 0.11
31 0.12
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.1
41 0.11
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.14
46 0.18
47 0.19
48 0.2
49 0.2
50 0.21
51 0.21
52 0.21
53 0.19
54 0.17
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.09
66 0.1
67 0.13
68 0.14
69 0.13
70 0.14
71 0.17
72 0.16
73 0.21
74 0.25
75 0.24
76 0.28
77 0.29
78 0.28
79 0.25
80 0.25
81 0.18
82 0.14
83 0.11
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.04
91 0.05
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.06
105 0.09
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.09
120 0.08
121 0.08
122 0.11
123 0.12
124 0.11
125 0.13
126 0.15
127 0.14
128 0.18
129 0.19
130 0.22
131 0.23
132 0.25
133 0.24
134 0.27
135 0.29
136 0.26
137 0.24
138 0.18
139 0.17
140 0.14
141 0.12
142 0.08
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.07
149 0.08
150 0.13
151 0.17
152 0.22
153 0.27
154 0.31
155 0.33
156 0.34
157 0.42
158 0.46
159 0.48
160 0.5
161 0.45
162 0.42
163 0.41
164 0.38
165 0.33
166 0.26
167 0.21
168 0.17
169 0.18
170 0.2
171 0.2
172 0.2
173 0.18
174 0.17
175 0.17
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.11
193 0.12
194 0.14
195 0.18
196 0.22
197 0.27
198 0.31
199 0.35
200 0.36
201 0.37
202 0.41
203 0.44
204 0.46
205 0.42
206 0.42
207 0.47
208 0.49
209 0.5
210 0.5
211 0.51
212 0.55
213 0.59
214 0.58
215 0.57
216 0.62
217 0.68
218 0.69
219 0.7
220 0.64
221 0.57
222 0.63
223 0.62
224 0.58
225 0.52
226 0.48
227 0.43
228 0.41
229 0.42
230 0.34
231 0.29
232 0.24
233 0.22
234 0.2
235 0.17
236 0.14
237 0.13
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.11
243 0.1
244 0.14
245 0.22
246 0.23
247 0.28
248 0.36
249 0.42
250 0.49
251 0.54
252 0.59
253 0.59
254 0.64
255 0.7
256 0.67
257 0.67
258 0.61
259 0.59
260 0.51
261 0.44
262 0.36
263 0.26
264 0.2
265 0.14
266 0.13
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.14
276 0.22
277 0.26
278 0.32
279 0.4
280 0.46
281 0.56
282 0.66
283 0.73
284 0.76
285 0.82
286 0.85
287 0.87
288 0.9
289 0.88
290 0.86
291 0.85
292 0.79
293 0.73
294 0.7
295 0.6
296 0.55
297 0.47
298 0.39
299 0.3
300 0.26
301 0.22
302 0.16
303 0.14
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.16
317 0.2
318 0.27
319 0.36
320 0.46
321 0.56