Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JVV0

Protein Details
Accession B6JVV0    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-122VELSQNQQRKKAKKQKKQKDESLEANYHydrophilic
352-385GRTLRVSRCKVAKQNKFKGKGKRKGDQHDRTLEGBasic
411-437RAKAGDNPIMKKHRKKKPVSKTKKGKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-113RKKAKKQKKQ
361-376KVAKQNKFKGKGKRKG
418-437PIMKKHRKKKPVSKTKKGKH
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR047189  RRM2_Nop12p-like  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12670  RRM2_Nop12p_like  
Amino Acid Sequences MDKKTSAESPANQASEIPAALPFLAVEPQKVDSSLDDLFKNAAPVQRPPKRDITVLEQPEPKNNDEETAASAVDEDVAMDGEQNGENDEKESKASVELSQNQQRKKAKKQKKQKDESLEANYLEKLAEEEEEEQKTQEKKDEKEDKKEAEKEEEIPEEEKPLVEIENRVNKELEKSERTVFVNNLPAKIVTDKKLTKSLKKHFSQYGKVQSVRFRSIAFSEVIPRKAAFIEKKFHDERDSVNAYVVFETSKAAREAVKLNGTMFLNRHLRVDHISHPAPQVNKRCVFVGNLAFEAEEEPLWCYFEPCGPVEYVRIIRDPKTNLGKGFAYVQFQSAESVDKALLLNGKKMPEGRTLRVSRCKVAKQNKFKGKGKRKGDQHDRTLEGRSRNLIGKSGQAIIKQGIAMALEGYRAKAGDNPIMKKHRKKKPVSKTKKGKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.29
3 0.26
4 0.18
5 0.11
6 0.11
7 0.11
8 0.1
9 0.08
10 0.07
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.16
16 0.17
17 0.18
18 0.18
19 0.14
20 0.18
21 0.2
22 0.21
23 0.19
24 0.19
25 0.2
26 0.19
27 0.21
28 0.19
29 0.21
30 0.21
31 0.29
32 0.39
33 0.45
34 0.49
35 0.52
36 0.58
37 0.57
38 0.58
39 0.54
40 0.52
41 0.54
42 0.55
43 0.56
44 0.54
45 0.51
46 0.55
47 0.55
48 0.48
49 0.42
50 0.37
51 0.33
52 0.27
53 0.28
54 0.23
55 0.2
56 0.19
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.1
61 0.09
62 0.05
63 0.04
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.11
80 0.13
81 0.14
82 0.16
83 0.21
84 0.26
85 0.33
86 0.41
87 0.46
88 0.47
89 0.53
90 0.58
91 0.59
92 0.65
93 0.69
94 0.71
95 0.76
96 0.85
97 0.88
98 0.91
99 0.93
100 0.91
101 0.9
102 0.86
103 0.84
104 0.79
105 0.71
106 0.61
107 0.52
108 0.42
109 0.32
110 0.25
111 0.17
112 0.1
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.1
117 0.13
118 0.15
119 0.15
120 0.15
121 0.2
122 0.22
123 0.22
124 0.26
125 0.28
126 0.29
127 0.4
128 0.5
129 0.51
130 0.59
131 0.64
132 0.63
133 0.65
134 0.68
135 0.6
136 0.55
137 0.51
138 0.45
139 0.41
140 0.37
141 0.31
142 0.26
143 0.24
144 0.19
145 0.17
146 0.14
147 0.11
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.11
152 0.15
153 0.23
154 0.24
155 0.25
156 0.25
157 0.24
158 0.26
159 0.29
160 0.29
161 0.25
162 0.27
163 0.27
164 0.31
165 0.32
166 0.3
167 0.27
168 0.24
169 0.28
170 0.26
171 0.25
172 0.22
173 0.2
174 0.19
175 0.21
176 0.21
177 0.16
178 0.22
179 0.24
180 0.26
181 0.35
182 0.37
183 0.41
184 0.48
185 0.55
186 0.57
187 0.58
188 0.61
189 0.59
190 0.62
191 0.61
192 0.58
193 0.58
194 0.53
195 0.53
196 0.5
197 0.47
198 0.45
199 0.42
200 0.35
201 0.26
202 0.23
203 0.21
204 0.21
205 0.17
206 0.13
207 0.17
208 0.19
209 0.19
210 0.19
211 0.18
212 0.16
213 0.16
214 0.2
215 0.19
216 0.2
217 0.26
218 0.26
219 0.33
220 0.33
221 0.34
222 0.33
223 0.29
224 0.27
225 0.28
226 0.3
227 0.24
228 0.23
229 0.22
230 0.2
231 0.19
232 0.17
233 0.09
234 0.06
235 0.07
236 0.06
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.11
242 0.14
243 0.17
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.2
248 0.19
249 0.19
250 0.16
251 0.19
252 0.21
253 0.21
254 0.22
255 0.18
256 0.2
257 0.21
258 0.24
259 0.23
260 0.25
261 0.26
262 0.27
263 0.28
264 0.3
265 0.3
266 0.34
267 0.36
268 0.37
269 0.38
270 0.38
271 0.37
272 0.35
273 0.33
274 0.32
275 0.29
276 0.23
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.17
281 0.16
282 0.12
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.11
292 0.13
293 0.12
294 0.14
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.18
299 0.18
300 0.17
301 0.2
302 0.21
303 0.23
304 0.28
305 0.3
306 0.34
307 0.4
308 0.41
309 0.39
310 0.4
311 0.38
312 0.33
313 0.35
314 0.29
315 0.24
316 0.21
317 0.22
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.14
322 0.14
323 0.11
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.15
330 0.14
331 0.18
332 0.2
333 0.21
334 0.22
335 0.25
336 0.27
337 0.32
338 0.37
339 0.37
340 0.44
341 0.49
342 0.55
343 0.61
344 0.62
345 0.59
346 0.61
347 0.64
348 0.65
349 0.7
350 0.72
351 0.74
352 0.81
353 0.84
354 0.86
355 0.85
356 0.87
357 0.87
358 0.86
359 0.84
360 0.83
361 0.83
362 0.84
363 0.88
364 0.86
365 0.84
366 0.82
367 0.78
368 0.7
369 0.68
370 0.63
371 0.56
372 0.5
373 0.45
374 0.4
375 0.41
376 0.4
377 0.37
378 0.33
379 0.33
380 0.32
381 0.34
382 0.32
383 0.28
384 0.29
385 0.26
386 0.26
387 0.21
388 0.19
389 0.14
390 0.12
391 0.11
392 0.1
393 0.08
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.14
401 0.18
402 0.24
403 0.31
404 0.36
405 0.44
406 0.54
407 0.63
408 0.69
409 0.75
410 0.78
411 0.81
412 0.87
413 0.89
414 0.9
415 0.93
416 0.93
417 0.94