Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D1BWB2

Protein Details
Accession A0A0D1BWB2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGRKKIKIQPIKEDRNRSVTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG uma:UMAG_10560  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
Amino Acid Sequences MGRKKIKIQPIKEDRNRSVTYLKRKAGLFKKAHELAVLTDSQVAVIVFGHNGKLAEFCSTDIDLLLLRYTEYDGIAERKGPRNYLHLDKDSDDNDDDDNDNDENDNDSADGPNEHFADPNRANGRETAGGSGRNAKGLSGTKRKSEHRSPSGRSNGFNPSSVAAAAASSSLGAGFDIATGPSAKQTLNAAIRQKSQNHSSTHSTSVAADFVPTQGVYHSVPFGHATMPDPGMQHEHSVMGASMTSMAPKMSSPAMPEANNRVTGQATSSSSASANPTRAQAIANMSICMPTDDRIPSFISPTIPGFGLTPGGTVVTPGGRRFSFSDVLSRSCTNMTVQRPVTASSSLVPHLFHTDTLSLTATPPQDASLSAVLRSSSPLIARPATTAFHRSMTPTYSQATYAPTSEASLVHNNASSFGADIIRPFTAAANLELASSSNHLALPVADFAQSAHASSASPVAHSSSVGVSTTGGSTSALIASPFVGSSLKASATPELVSHSTHPLARDSLAASVSRSSMSTDKETPPTHGDSAGANDARLDSSAIWFNLGQSTDAKSDKTMPEQGSLVQPAPINASQTLASIPFDLKFPAQPMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.8
3 0.74
4 0.67
5 0.66
6 0.63
7 0.65
8 0.65
9 0.63
10 0.6
11 0.6
12 0.66
13 0.66
14 0.67
15 0.63
16 0.59
17 0.65
18 0.63
19 0.61
20 0.53
21 0.45
22 0.37
23 0.34
24 0.29
25 0.2
26 0.17
27 0.16
28 0.14
29 0.14
30 0.11
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.14
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.11
61 0.14
62 0.15
63 0.19
64 0.23
65 0.31
66 0.33
67 0.36
68 0.36
69 0.4
70 0.45
71 0.5
72 0.52
73 0.48
74 0.49
75 0.47
76 0.49
77 0.43
78 0.41
79 0.33
80 0.26
81 0.22
82 0.21
83 0.2
84 0.16
85 0.18
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.12
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.09
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.15
103 0.16
104 0.24
105 0.24
106 0.31
107 0.32
108 0.32
109 0.33
110 0.32
111 0.35
112 0.29
113 0.29
114 0.25
115 0.22
116 0.22
117 0.23
118 0.29
119 0.25
120 0.24
121 0.23
122 0.19
123 0.22
124 0.27
125 0.34
126 0.37
127 0.39
128 0.43
129 0.49
130 0.56
131 0.6
132 0.64
133 0.66
134 0.66
135 0.72
136 0.71
137 0.75
138 0.78
139 0.72
140 0.63
141 0.57
142 0.55
143 0.48
144 0.44
145 0.35
146 0.26
147 0.24
148 0.22
149 0.18
150 0.1
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.1
173 0.16
174 0.19
175 0.23
176 0.28
177 0.29
178 0.34
179 0.38
180 0.41
181 0.39
182 0.41
183 0.43
184 0.41
185 0.43
186 0.44
187 0.42
188 0.41
189 0.38
190 0.32
191 0.26
192 0.24
193 0.2
194 0.14
195 0.11
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.12
218 0.14
219 0.14
220 0.13
221 0.12
222 0.11
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.06
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.13
241 0.15
242 0.16
243 0.18
244 0.22
245 0.22
246 0.23
247 0.22
248 0.19
249 0.16
250 0.16
251 0.15
252 0.12
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.13
260 0.12
261 0.13
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.15
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.06
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.13
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.06
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.07
305 0.1
306 0.1
307 0.12
308 0.13
309 0.17
310 0.18
311 0.17
312 0.23
313 0.22
314 0.24
315 0.25
316 0.23
317 0.2
318 0.17
319 0.18
320 0.14
321 0.18
322 0.19
323 0.23
324 0.23
325 0.25
326 0.25
327 0.26
328 0.26
329 0.2
330 0.18
331 0.13
332 0.14
333 0.12
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.12
345 0.09
346 0.09
347 0.12
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.12
362 0.11
363 0.08
364 0.09
365 0.11
366 0.13
367 0.14
368 0.14
369 0.15
370 0.15
371 0.15
372 0.16
373 0.17
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.18
378 0.18
379 0.19
380 0.2
381 0.18
382 0.19
383 0.18
384 0.18
385 0.17
386 0.18
387 0.17
388 0.15
389 0.14
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.15
399 0.15
400 0.15
401 0.15
402 0.12
403 0.09
404 0.09
405 0.1
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.08
413 0.09
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.09
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.11
436 0.11
437 0.1
438 0.1
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.14
443 0.1
444 0.11
445 0.1
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.13
450 0.09
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.08
455 0.08
456 0.09
457 0.08
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.08
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.12
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.13
481 0.15
482 0.16
483 0.17
484 0.17
485 0.2
486 0.21
487 0.22
488 0.23
489 0.22
490 0.22
491 0.21
492 0.21
493 0.18
494 0.17
495 0.17
496 0.16
497 0.15
498 0.14
499 0.14
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.16
504 0.2
505 0.24
506 0.28
507 0.32
508 0.39
509 0.4
510 0.41
511 0.42
512 0.42
513 0.38
514 0.34
515 0.3
516 0.24
517 0.27
518 0.3
519 0.26
520 0.21
521 0.2
522 0.2
523 0.19
524 0.18
525 0.15
526 0.09
527 0.12
528 0.16
529 0.16
530 0.17
531 0.17
532 0.17
533 0.2
534 0.2
535 0.18
536 0.15
537 0.19
538 0.21
539 0.23
540 0.23
541 0.21
542 0.27
543 0.3
544 0.34
545 0.38
546 0.35
547 0.37
548 0.38
549 0.38
550 0.37
551 0.36
552 0.3
553 0.26
554 0.24
555 0.22
556 0.26
557 0.25
558 0.23
559 0.2
560 0.21
561 0.18
562 0.19
563 0.19
564 0.15
565 0.15
566 0.13
567 0.14
568 0.13
569 0.14
570 0.15
571 0.16
572 0.18