Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6JV91

Protein Details
Accession B6JV91    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-67LLQSSSKKNIKSKVKEKLSHWRGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 5, cyto 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045114  Csn12-like  
IPR000717  PCI_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0070390  C:transcription export complex 2  
GO:0003690  F:double-stranded DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016973  P:poly(A)+ mRNA export from nucleus  
GO:0000973  P:post-transcriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MSLQSFLNTVQQSVKQKNAETIINCFVLDNSSPDIQNLTEQIAPLLQSSSKKNIKSKVKEKLSHWRGWTDLVMAFFEYLITVRELDEYKEKTWMSLKHFYTCLATCFSSQDTAWMVQLVESASKFYVNISLALDRESEGPNKYVSDTSRDVFRMFNIVLSDRQTNFKGSKREAVFTVANLLNRLYFRMQQVRLCHTIQTNIISSGVTLSLGTTAERVTFEYYTGRCYLYQHQIHQAYRHLSTAFQQCPDEAHVQKRLCLLYLIVCQLILGRSPTKQLMMQFQLEPMFSPLIACLKVGNIKGFIDALEAPNRLRWFVKRNIYLTLRDRCEIVLWRNLFRKVFLTTFSPTQKTPHVASAALLAAARFATQDDTYDEEDVECICVSLIDQGYVKGYIIHSSGTLVLKRDESFGFEPIHAVQPVVMNNDAEDKFFGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.44
3 0.46
4 0.5
5 0.51
6 0.5
7 0.44
8 0.45
9 0.42
10 0.38
11 0.36
12 0.29
13 0.25
14 0.22
15 0.2
16 0.18
17 0.17
18 0.18
19 0.19
20 0.19
21 0.2
22 0.18
23 0.19
24 0.17
25 0.16
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.13
33 0.13
34 0.16
35 0.2
36 0.29
37 0.35
38 0.41
39 0.47
40 0.55
41 0.63
42 0.7
43 0.75
44 0.76
45 0.8
46 0.81
47 0.81
48 0.83
49 0.79
50 0.76
51 0.69
52 0.62
53 0.53
54 0.49
55 0.44
56 0.35
57 0.29
58 0.23
59 0.21
60 0.17
61 0.16
62 0.12
63 0.11
64 0.08
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.1
71 0.11
72 0.13
73 0.2
74 0.23
75 0.23
76 0.28
77 0.27
78 0.27
79 0.32
80 0.35
81 0.36
82 0.41
83 0.42
84 0.42
85 0.43
86 0.42
87 0.4
88 0.35
89 0.3
90 0.24
91 0.23
92 0.19
93 0.2
94 0.2
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.16
99 0.15
100 0.15
101 0.14
102 0.12
103 0.1
104 0.12
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.09
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.11
114 0.1
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.11
122 0.12
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.17
131 0.16
132 0.2
133 0.21
134 0.2
135 0.24
136 0.24
137 0.24
138 0.21
139 0.2
140 0.18
141 0.16
142 0.17
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.17
147 0.19
148 0.16
149 0.19
150 0.19
151 0.21
152 0.23
153 0.27
154 0.31
155 0.3
156 0.37
157 0.36
158 0.37
159 0.35
160 0.36
161 0.31
162 0.25
163 0.28
164 0.21
165 0.19
166 0.18
167 0.17
168 0.14
169 0.13
170 0.15
171 0.11
172 0.12
173 0.15
174 0.22
175 0.24
176 0.26
177 0.3
178 0.33
179 0.35
180 0.33
181 0.31
182 0.25
183 0.25
184 0.23
185 0.21
186 0.17
187 0.14
188 0.14
189 0.11
190 0.11
191 0.09
192 0.07
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.12
213 0.15
214 0.19
215 0.25
216 0.28
217 0.28
218 0.34
219 0.38
220 0.38
221 0.38
222 0.37
223 0.3
224 0.28
225 0.28
226 0.21
227 0.16
228 0.2
229 0.25
230 0.23
231 0.22
232 0.21
233 0.2
234 0.21
235 0.24
236 0.24
237 0.19
238 0.21
239 0.27
240 0.27
241 0.29
242 0.31
243 0.28
244 0.23
245 0.21
246 0.18
247 0.14
248 0.16
249 0.15
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.11
260 0.12
261 0.13
262 0.15
263 0.16
264 0.21
265 0.23
266 0.25
267 0.23
268 0.24
269 0.23
270 0.21
271 0.2
272 0.15
273 0.11
274 0.09
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.07
281 0.09
282 0.13
283 0.14
284 0.15
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.15
289 0.13
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.17
297 0.18
298 0.17
299 0.19
300 0.21
301 0.25
302 0.33
303 0.42
304 0.44
305 0.46
306 0.52
307 0.53
308 0.54
309 0.55
310 0.55
311 0.49
312 0.43
313 0.41
314 0.35
315 0.35
316 0.34
317 0.3
318 0.3
319 0.29
320 0.34
321 0.38
322 0.42
323 0.39
324 0.35
325 0.34
326 0.3
327 0.29
328 0.27
329 0.26
330 0.25
331 0.31
332 0.34
333 0.34
334 0.31
335 0.33
336 0.35
337 0.35
338 0.35
339 0.34
340 0.31
341 0.29
342 0.28
343 0.27
344 0.23
345 0.19
346 0.16
347 0.1
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.05
352 0.06
353 0.08
354 0.08
355 0.1
356 0.12
357 0.16
358 0.18
359 0.19
360 0.18
361 0.15
362 0.16
363 0.14
364 0.13
365 0.09
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.13
375 0.15
376 0.15
377 0.15
378 0.12
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.14
383 0.12
384 0.13
385 0.16
386 0.18
387 0.19
388 0.19
389 0.21
390 0.23
391 0.24
392 0.26
393 0.23
394 0.26
395 0.26
396 0.27
397 0.28
398 0.25
399 0.26
400 0.25
401 0.29
402 0.22
403 0.2
404 0.18
405 0.19
406 0.21
407 0.23
408 0.22
409 0.17
410 0.18
411 0.25
412 0.24
413 0.22