FuNGI

B6K3T5

Protein Details

Accession

B6K3T5

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-109	VDGCAPRAKMNQQRSRRFRTAKDAY	Hydrophilic
1239-1264	PPPPSLNTWKKSPQKSRNTRGPMSPG	Hydrophilic
1290-1316	TNSNTRGRGRGPRRGNPRNVHRNVSKS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1296-1310	GRGRGPRRGNPRNVH

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR016494 5_3_exoribonuclease_1 IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR041385 SH3_12 IPR040992 XRN1_D1 IPR047007 XRN1_D1_sf IPR041106 XRN1_D2_D3 IPR040486 Xrn1_D3 IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR047008 XRN1_SH3_sf
Gene Ontology	GO:0010494 C:cytoplasmic stress granule GO:0005634 C:nucleus GO:0000932 C:P-body GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0000287 F:magnesium ion binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay GO:0016075 P:rRNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF18129 SH3_12 PF18332 XRN1_D1 PF18334 XRN1_D2_D3 PF18194 Xrn1_D3 PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPKFFRWMSERYPLCSQLVQDDRIPEFDNLYLDMNGILHNCTHKNDDHSSAALPEDQMYIAIFNYIEHLFQKIKPKKLLYMAVDGCAPRAKMNQQRSRRFRTAKDAYDARRKAERNGEVIAEDPFDSNCITPGTVFMQRISEQLHYFIQKKVSEDSDWSGVQIILSGHDCPGEGEHKIMEYIRTQKAQPNYNPNTRHCLYGLDADLIMLGLLSHDPHFCLLREEVTFGPARKSASKELANQKFYLLHLSLLREYLEAEFEECRDNLPFAYDLERIIDDFILLAFFVGNDFLPNLPGLHINEGALALMFNVYKSVLPLMEGYINEAGVINMDRLDLVLLELEKFEKAVFKEECYSSNADGEAPAFDFNQFLRNNNKDPSYLTVKQKELYCLLKKFLYSREQYLDITDKLSSEDTRFLRRLASKLGLMASTVVFADGSSCLRVAFKNLNFSDSEEDDEEQDEIGEVLEKFDKLNIIDNTTKDSEEKFEKGFEMWKDNYYRSKVGFSYYDEKELEQMAKRYVEGLQWVLFYYYRGCQSWGWFYDYHYSPKISDVRRGLRFGITFDMGKPFRPFEQLMAVLPARSKSLVPPCYRDLMTDPNSPIIDFYPENFELDQNEKKASWEAVVKIPFIEETRLQDALKSREHLLTAAELHRNEFHPPVLFIKDDSITRVFPSSLPNIFPDLLSHCIEVNYSLPSMQGLEYRVGLCPGVFLGTFGLAGFPSFHTVKHTAEIASKGVNVFGNDSRNPSVIVHVQNIYNSTPVEELAKKYLNQKVFMDWPYLRESKSVALTTSVQLYTMEDGNLNVRELTSDEISLRRRKIETLNRTYFKRYGVILGPVDVVLVVHPLKGMQFTRDGALIKSFDSDSMEVIPIQILVDKIAIEDARYTEREAPPVELEFPVGTKVFNLGEYNYGRPAQVTQCKDNKLSIWLSTAPGLDATWGTAIVRAFQHSEVYYPSYIVARKLGLHPLALSKITSRFVINVDKRQENVGLSLKFDARQLKVIGYTRKTQSGWEFSEAAIKLLAEYMHAFPDFFQALNRLPSKDSLTAKDYFPHDDKGKVAAMKQWLKQNKVSEFTRVSLSDYSLTKEAIQQIEAKADSIDATFQVPKKVFGVPRYAVLKPSQAAHVLHSQTFALGDRIVYVQDSGKVPIAAYGTVVGISTHQLEVVFDLPFMSGTTLDGKCSPYRGMQLDPSTVLNITQPQLLITTRAGQARKKKLESNIHSTTPSKLVTKAQYNHVPPPPSLNTWKKSPQKSRNTRGPMSPGKALNKGPAIPDGQVSTPSDGTNQHSTNSNTRGRGRGPRRGNPRNVHRNVSKSHAPQKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.5
3	0.49
4	0.45
5	0.4
6	0.39
7	0.42
8	0.39
9	0.36
10	0.39
11	0.37
12	0.37
13	0.39
14	0.3
15	0.26
16	0.25
17	0.23
18	0.2
19	0.21
20	0.18
21	0.15
22	0.15
23	0.13
24	0.13
25	0.12
26	0.11
27	0.1
28	0.15
29	0.17
30	0.2
31	0.24
32	0.27
33	0.33
34	0.37
35	0.41
36	0.4
37	0.39
38	0.37
39	0.34
40	0.32
41	0.27
42	0.22
43	0.17
44	0.15
45	0.13
46	0.12
47	0.11
48	0.1
49	0.09
50	0.09
51	0.08
52	0.07
53	0.1
54	0.1
55	0.11
56	0.11
57	0.15
58	0.16
59	0.21
60	0.32
61	0.37
62	0.45
63	0.52
64	0.56
65	0.59
66	0.65
67	0.69
68	0.62
69	0.64
70	0.57
71	0.5
72	0.49
73	0.42
74	0.36
75	0.3
76	0.27
77	0.19
78	0.23
79	0.31
80	0.37
81	0.48
82	0.56
83	0.63
84	0.74
85	0.8
86	0.85
87	0.86
88	0.84
89	0.8
90	0.8
91	0.8
92	0.75
93	0.75
94	0.73
95	0.7
96	0.74
97	0.7
98	0.64
99	0.63
100	0.58
101	0.57
102	0.59
103	0.57
104	0.5
105	0.5
106	0.47
107	0.39
108	0.38
109	0.32
110	0.23
111	0.18
112	0.14
113	0.12
114	0.11
115	0.11
116	0.1
117	0.11
118	0.11
119	0.1
120	0.1
121	0.12
122	0.16
123	0.2
124	0.21
125	0.2
126	0.23
127	0.23
128	0.25
129	0.26
130	0.25
131	0.22
132	0.24
133	0.27
134	0.28
135	0.3
136	0.31
137	0.34
138	0.33
139	0.34
140	0.36
141	0.35
142	0.33
143	0.34
144	0.35
145	0.33
146	0.3
147	0.28
148	0.25
149	0.21
150	0.18
151	0.16
152	0.12
153	0.1
154	0.11
155	0.12
156	0.1
157	0.11
158	0.11
159	0.1
160	0.12
161	0.13
162	0.13
163	0.13
164	0.14
165	0.14
166	0.15
167	0.15
168	0.15
169	0.17
170	0.23
171	0.27
172	0.3
173	0.31
174	0.36
175	0.42
176	0.49
177	0.52
178	0.55
179	0.58
180	0.64
181	0.69
182	0.66
183	0.67
184	0.59
185	0.54
186	0.44
187	0.39
188	0.33
189	0.32
190	0.31
191	0.24
192	0.22
193	0.19
194	0.18
195	0.15
196	0.12
197	0.06
198	0.04
199	0.03
200	0.03
201	0.05
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.09
206	0.11
207	0.11
208	0.15
209	0.15
210	0.17
211	0.18
212	0.2
213	0.19
214	0.2
215	0.23
216	0.2
217	0.21
218	0.2
219	0.23
220	0.24
221	0.28
222	0.31
223	0.36
224	0.4
225	0.46
226	0.55
227	0.61
228	0.59
229	0.55
230	0.51
231	0.44
232	0.4
233	0.37
234	0.27
235	0.2
236	0.2
237	0.22
238	0.22
239	0.21
240	0.21
241	0.15
242	0.15
243	0.13
244	0.12
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.13
250	0.12
251	0.13
252	0.13
253	0.13
254	0.12
255	0.14
256	0.13
257	0.12
258	0.16
259	0.15
260	0.14
261	0.15
262	0.15
263	0.13
264	0.13
265	0.12
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.05
270	0.05
271	0.04
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.1
285	0.11
286	0.13
287	0.14
288	0.13
289	0.13
290	0.12
291	0.12
292	0.09
293	0.07
294	0.04
295	0.05
296	0.05
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.07
303	0.06
304	0.07
305	0.08
306	0.09
307	0.12
308	0.11
309	0.13
310	0.12
311	0.12
312	0.11
313	0.11
314	0.09
315	0.07
316	0.08
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.06
323	0.04
324	0.04
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.09
334	0.1
335	0.18
336	0.18
337	0.2
338	0.25
339	0.26
340	0.28
341	0.28
342	0.3
343	0.23
344	0.23
345	0.21
346	0.16
347	0.15
348	0.13
349	0.11
350	0.09
351	0.08
352	0.07
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.14
357	0.14
358	0.16
359	0.24
360	0.28
361	0.32
362	0.35
363	0.36
364	0.3
365	0.32
366	0.34
367	0.35
368	0.37
369	0.41
370	0.43
371	0.43
372	0.46
373	0.47
374	0.44
375	0.4
376	0.41
377	0.4
378	0.36
379	0.37
380	0.35
381	0.34
382	0.34
383	0.36
384	0.35
385	0.32
386	0.34
387	0.35
388	0.36
389	0.35
390	0.35
391	0.32
392	0.25
393	0.23
394	0.19
395	0.15
396	0.14
397	0.16
398	0.14
399	0.12
400	0.18
401	0.19
402	0.25
403	0.25
404	0.24
405	0.28
406	0.3
407	0.31
408	0.29
409	0.3
410	0.24
411	0.25
412	0.25
413	0.2
414	0.17
415	0.15
416	0.1
417	0.08
418	0.07
419	0.06
420	0.05
421	0.04
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.07
429	0.08
430	0.11
431	0.18
432	0.19
433	0.27
434	0.27
435	0.29
436	0.29
437	0.3
438	0.3
439	0.24
440	0.24
441	0.17
442	0.17
443	0.15
444	0.15
445	0.14
446	0.1
447	0.09
448	0.06
449	0.05
450	0.05
451	0.06
452	0.05
453	0.06
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.08
458	0.1
459	0.08
460	0.16
461	0.15
462	0.19
463	0.22
464	0.22
465	0.26
466	0.26
467	0.26
468	0.19
469	0.19
470	0.18
471	0.19
472	0.21
473	0.18
474	0.17
475	0.18
476	0.18
477	0.22
478	0.2
479	0.22
480	0.21
481	0.24
482	0.26
483	0.28
484	0.32
485	0.31
486	0.32
487	0.27
488	0.3
489	0.26
490	0.26
491	0.26
492	0.25
493	0.28
494	0.26
495	0.29
496	0.26
497	0.25
498	0.24
499	0.23
500	0.21
501	0.16
502	0.17
503	0.15
504	0.16
505	0.15
506	0.15
507	0.15
508	0.13
509	0.12
510	0.12
511	0.11
512	0.11
513	0.11
514	0.11
515	0.1
516	0.09
517	0.09
518	0.1
519	0.11
520	0.12
521	0.13
522	0.14
523	0.16
524	0.21
525	0.22
526	0.23
527	0.21
528	0.22
529	0.27
530	0.28
531	0.29
532	0.25
533	0.24
534	0.21
535	0.25
536	0.31
537	0.25
538	0.29
539	0.33
540	0.39
541	0.41
542	0.42
543	0.38
544	0.35
545	0.33
546	0.28
547	0.25
548	0.18
549	0.16
550	0.14
551	0.19
552	0.17
553	0.18
554	0.18
555	0.17
556	0.16
557	0.2
558	0.2
559	0.15
560	0.19
561	0.18
562	0.17
563	0.18
564	0.18
565	0.14
566	0.14
567	0.13
568	0.09
569	0.09
570	0.09
571	0.11
572	0.19
573	0.26
574	0.27
575	0.31
576	0.32
577	0.35
578	0.35
579	0.32
580	0.26
581	0.27
582	0.29
583	0.28
584	0.27
585	0.26
586	0.26
587	0.24
588	0.22
589	0.15
590	0.14
591	0.1
592	0.1
593	0.14
594	0.14
595	0.15
596	0.14
597	0.14
598	0.13
599	0.17
600	0.19
601	0.14
602	0.15
603	0.14
604	0.15
605	0.16
606	0.14
607	0.12
608	0.13
609	0.13
610	0.17
611	0.18
612	0.17
613	0.16
614	0.15
615	0.14
616	0.12
617	0.12
618	0.09
619	0.11
620	0.13
621	0.14
622	0.14
623	0.15
624	0.18
625	0.2
626	0.21
627	0.2
628	0.19
629	0.19
630	0.19
631	0.18
632	0.15
633	0.12
634	0.12
635	0.13
636	0.14
637	0.12
638	0.13
639	0.14
640	0.14
641	0.15
642	0.14
643	0.12
644	0.11
645	0.11
646	0.13
647	0.13
648	0.12
649	0.11
650	0.11
651	0.12
652	0.11
653	0.13
654	0.12
655	0.11
656	0.11
657	0.12
658	0.11
659	0.1
660	0.13
661	0.14
662	0.14
663	0.14
664	0.15
665	0.16
666	0.16
667	0.15
668	0.13
669	0.12
670	0.14
671	0.14
672	0.13
673	0.11
674	0.11
675	0.11
676	0.11
677	0.09
678	0.07
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.07
686	0.07
687	0.08
688	0.09
689	0.09
690	0.09
691	0.09
692	0.08
693	0.07
694	0.05
695	0.05
696	0.05
697	0.04
698	0.04
699	0.04
700	0.04
701	0.04
702	0.04
703	0.04
704	0.03
705	0.04
706	0.04
707	0.04
708	0.07
709	0.08
710	0.08
711	0.12
712	0.14
713	0.15
714	0.15
715	0.16
716	0.14
717	0.15
718	0.17
719	0.13
720	0.12
721	0.11
722	0.1
723	0.1
724	0.1
725	0.08
726	0.1
727	0.11
728	0.14
729	0.14
730	0.17
731	0.17
732	0.17
733	0.17
734	0.15
735	0.16
736	0.16
737	0.18
738	0.17
739	0.17
740	0.17
741	0.16
742	0.18
743	0.16
744	0.13
745	0.11
746	0.09
747	0.08
748	0.08
749	0.11
750	0.11
751	0.11
752	0.14
753	0.16
754	0.16
755	0.21
756	0.27
757	0.26
758	0.27
759	0.27
760	0.26
761	0.29
762	0.29
763	0.29
764	0.24
765	0.23
766	0.26
767	0.26
768	0.24
769	0.2
770	0.2
771	0.18
772	0.2
773	0.19
774	0.14
775	0.15
776	0.15
777	0.15
778	0.17
779	0.14
780	0.11
781	0.1
782	0.11
783	0.1
784	0.09
785	0.09
786	0.07
787	0.07
788	0.09
789	0.09
790	0.09
791	0.08
792	0.07
793	0.07
794	0.08
795	0.1
796	0.08
797	0.08
798	0.09
799	0.12
800	0.17
801	0.22
802	0.22
803	0.23
804	0.24
805	0.26
806	0.35
807	0.41
808	0.47
809	0.52
810	0.59
811	0.6
812	0.61
813	0.63
814	0.55
815	0.47
816	0.39
817	0.3
818	0.25
819	0.23
820	0.25
821	0.21
822	0.19
823	0.18
824	0.15
825	0.14
826	0.1
827	0.08
828	0.04
829	0.06
830	0.05
831	0.05
832	0.05
833	0.05
834	0.05
835	0.09
836	0.09
837	0.09
838	0.11
839	0.12
840	0.13
841	0.15
842	0.16
843	0.13
844	0.15
845	0.14
846	0.12
847	0.13
848	0.12
849	0.1
850	0.12
851	0.11
852	0.1
853	0.11
854	0.11
855	0.09
856	0.09
857	0.09
858	0.06
859	0.06
860	0.07
861	0.05
862	0.05
863	0.06
864	0.05
865	0.05
866	0.07
867	0.07
868	0.06
869	0.07
870	0.08
871	0.1
872	0.11
873	0.13
874	0.18
875	0.2
876	0.22
877	0.23
878	0.23
879	0.22
880	0.22
881	0.22
882	0.15
883	0.15
884	0.12
885	0.11
886	0.11
887	0.09
888	0.08
889	0.07
890	0.08
891	0.08
892	0.09
893	0.1
894	0.09
895	0.14
896	0.16
897	0.17
898	0.17
899	0.17
900	0.16
901	0.16
902	0.18
903	0.2
904	0.26
905	0.3
906	0.35
907	0.4
908	0.44
909	0.45
910	0.44
911	0.38
912	0.35
913	0.32
914	0.26
915	0.23
916	0.21
917	0.21
918	0.2
919	0.19
920	0.14
921	0.13
922	0.11
923	0.09
924	0.07
925	0.07
926	0.05
927	0.05
928	0.05
929	0.07
930	0.07
931	0.09
932	0.1
933	0.1
934	0.12
935	0.12
936	0.15
937	0.13
938	0.14
939	0.14
940	0.16
941	0.15
942	0.13
943	0.14
944	0.14
945	0.15
946	0.15
947	0.15
948	0.13
949	0.15
950	0.17
951	0.21
952	0.19
953	0.19
954	0.18
955	0.19
956	0.2
957	0.19
958	0.17
959	0.14
960	0.16
961	0.17
962	0.17
963	0.15
964	0.15
965	0.17
966	0.27
967	0.3
968	0.34
969	0.39
970	0.4
971	0.4
972	0.41
973	0.4
974	0.3
975	0.3
976	0.29
977	0.24
978	0.23
979	0.24
980	0.23
981	0.22
982	0.24
983	0.25
984	0.2
985	0.24
986	0.24
987	0.23
988	0.27
989	0.32
990	0.36
991	0.34
992	0.39
993	0.37
994	0.41
995	0.4
996	0.39
997	0.4
998	0.4
999	0.4
1000	0.37
1001	0.35
1002	0.3
1003	0.37
1004	0.33
1005	0.26
1006	0.2
1007	0.16
1008	0.12
1009	0.13
1010	0.12
1011	0.07
1012	0.09
1013	0.09
1014	0.11
1015	0.11
1016	0.11
1017	0.1
1018	0.14
1019	0.14
1020	0.12
1021	0.12
1022	0.13
1023	0.15
1024	0.22
1025	0.23
1026	0.21
1027	0.21
1028	0.24
1029	0.28
1030	0.32
1031	0.33
1032	0.31
1033	0.33
1034	0.34
1035	0.34
1036	0.36
1037	0.34
1038	0.33
1039	0.32
1040	0.34
1041	0.32
1042	0.32
1043	0.32
1044	0.31
1045	0.33
1046	0.28
1047	0.27
1048	0.25
1049	0.32
1050	0.36
1051	0.39
1052	0.44
1053	0.47
1054	0.5
1055	0.54
1056	0.57
1057	0.54
1058	0.55
1059	0.52
1060	0.5
1061	0.47
1062	0.44
1063	0.43
1064	0.35
1065	0.33
1066	0.27
1067	0.28
1068	0.24
1069	0.22
1070	0.24
1071	0.21
1072	0.21
1073	0.18
1074	0.2
1075	0.24
1076	0.21
1077	0.21
1078	0.21
1079	0.21
1080	0.25
1081	0.24
1082	0.21
1083	0.16
1084	0.15
1085	0.14
1086	0.11
1087	0.11
1088	0.07
1089	0.1
1090	0.13
1091	0.15
1092	0.21
1093	0.21
1094	0.22
1095	0.23
1096	0.29
1097	0.31
1098	0.31
1099	0.38
1100	0.33
1101	0.39
1102	0.42
1103	0.41
1104	0.37
1105	0.35
1106	0.35
1107	0.28
1108	0.29
1109	0.25
1110	0.25
1111	0.24
1112	0.25
1113	0.3
1114	0.29
1115	0.28
1116	0.27
1117	0.24
1118	0.2
1119	0.2
1120	0.18
1121	0.12
1122	0.1
1123	0.09
1124	0.09
1125	0.1
1126	0.1
1127	0.1
1128	0.1
1129	0.1
1130	0.13
1131	0.15
1132	0.15
1133	0.17
1134	0.17
1135	0.16
1136	0.18
1137	0.18
1138	0.14
1139	0.13
1140	0.12
1141	0.1
1142	0.1
1143	0.1
1144	0.07
1145	0.06
1146	0.08
1147	0.09
1148	0.08
1149	0.09
1150	0.09
1151	0.09
1152	0.11
1153	0.12
1154	0.1
1155	0.08
1156	0.09
1157	0.08
1158	0.09
1159	0.09
1160	0.08
1161	0.06
1162	0.07
1163	0.14
1164	0.14
1165	0.15
1166	0.17
1167	0.2
1168	0.21
1169	0.24
1170	0.25
1171	0.22
1172	0.29
1173	0.31
1174	0.33
1175	0.37
1176	0.39
1177	0.38
1178	0.38
1179	0.35
1180	0.3
1181	0.26
1182	0.23
1183	0.18
1184	0.17
1185	0.16
1186	0.16
1187	0.15
1188	0.14
1189	0.16
1190	0.16
1191	0.16
1192	0.14
1193	0.18
1194	0.2
1195	0.25
1196	0.28
1197	0.33
1198	0.43
1199	0.51
1200	0.59
1201	0.6
1202	0.63
1203	0.68
1204	0.76
1205	0.76
1206	0.75
1207	0.71
1208	0.65
1209	0.63
1210	0.57
1211	0.51
1212	0.44
1213	0.4
1214	0.33
1215	0.29
1216	0.33
1217	0.38
1218	0.46
1219	0.47
1220	0.51
1221	0.57
1222	0.6
1223	0.65
1224	0.65
1225	0.6
1226	0.51
1227	0.55
1228	0.51
1229	0.48
1230	0.53
1231	0.53
1232	0.51
1233	0.55
1234	0.65
1235	0.66
1236	0.72
1237	0.77
1238	0.78
1239	0.81
1240	0.87
1241	0.9
1242	0.9
1243	0.9
1244	0.84
1245	0.8
1246	0.79
1247	0.77
1248	0.72
1249	0.69
1250	0.65
1251	0.61
1252	0.62
1253	0.57
1254	0.54
1255	0.49
1256	0.46
1257	0.41
1258	0.39
1259	0.36
1260	0.31
1261	0.31
1262	0.27
1263	0.23
1264	0.24
1265	0.25
1266	0.24
1267	0.22
1268	0.22
1269	0.22
1270	0.22
1271	0.26
1272	0.32
1273	0.3
1274	0.28
1275	0.33
1276	0.38
1277	0.43
1278	0.48
1279	0.49
1280	0.47
1281	0.51
1282	0.56
1283	0.56
1284	0.63
1285	0.63
1286	0.66
1287	0.69
1288	0.73
1289	0.79
1290	0.83
1291	0.86
1292	0.86
1293	0.88
1294	0.89
1295	0.85
1296	0.85
1297	0.81
1298	0.79
1299	0.73
1300	0.7
1301	0.68
1302	0.66

B6K3T5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer