Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H3CJC5

Protein Details
Accession A0A2H3CJC5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-143SSHSGPAKKKHVGRPKHNIRTTSHydrophilic
564-589VKLWIRPLALRPRHPRRTRTISIDMDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
128-135KKKHVGRP
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 7, extr 5, cyto_pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MESESTFVAPEGVYSIIEEHKPFFLVAHINAPASPFPTRVSTIVVRYPTAKHGSGAPGFAQLLSVGNKDKDTRNVKDKGREDGHSQSSSDTGDDDGSPPLGGADLPVSPAVPHEHHALFSSSHSGPAKKKHVGRPKHNIRTTSSTFITRADVPKALQSKQGDTTFLFYNTGKSFLWVETGSKSKEPLARVTFSAFPTCHDVNTLTASPECLDVIIGFSTGDLIWLDPISSRYSRLNKQGCISNSPCTAVRWVPSSSTLFLASHADGTIVVYDRERDDGTFKPQEPIAQSGSSGSGSLPSSDDSTSQKDWDPMDNIFVTIPPWHPVTGGAGLKNEREREKAVKNPVSHWKVSRKSVVDFAFSPDVKYVGAISEDGCLRVIDALAEQLVDCYASYFGALTCIAWSPDGRFILTGGQDDLLTIFSPWEQRVIARCQGHSSFVTAVAFDDLRCDGRTYRFGSVGEDNKLILWDFSSGALHRPKFQATHHQRVSMSSTISLAFKRDRSALYLPSPSTEDKPYPRYHPAPSRNEIAVVQPVLVKQVEGELLADVAFLPRSLMTATKSGHVKLWIRPLALRPRHPRRTRTISIDMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.13
4 0.16
5 0.17
6 0.17
7 0.18
8 0.19
9 0.18
10 0.16
11 0.17
12 0.19
13 0.2
14 0.23
15 0.24
16 0.23
17 0.23
18 0.25
19 0.22
20 0.2
21 0.2
22 0.16
23 0.17
24 0.21
25 0.23
26 0.22
27 0.27
28 0.28
29 0.31
30 0.36
31 0.36
32 0.33
33 0.33
34 0.35
35 0.35
36 0.37
37 0.33
38 0.28
39 0.31
40 0.36
41 0.35
42 0.34
43 0.28
44 0.26
45 0.25
46 0.24
47 0.19
48 0.13
49 0.14
50 0.13
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.19
55 0.22
56 0.26
57 0.33
58 0.39
59 0.45
60 0.5
61 0.57
62 0.62
63 0.68
64 0.68
65 0.68
66 0.66
67 0.61
68 0.58
69 0.58
70 0.58
71 0.49
72 0.46
73 0.37
74 0.33
75 0.3
76 0.25
77 0.17
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.09
97 0.12
98 0.12
99 0.14
100 0.18
101 0.19
102 0.19
103 0.21
104 0.21
105 0.18
106 0.18
107 0.22
108 0.17
109 0.21
110 0.23
111 0.25
112 0.28
113 0.36
114 0.43
115 0.45
116 0.53
117 0.58
118 0.66
119 0.72
120 0.78
121 0.8
122 0.83
123 0.87
124 0.84
125 0.78
126 0.74
127 0.72
128 0.67
129 0.61
130 0.52
131 0.44
132 0.39
133 0.37
134 0.34
135 0.29
136 0.27
137 0.24
138 0.24
139 0.22
140 0.27
141 0.3
142 0.28
143 0.3
144 0.29
145 0.3
146 0.35
147 0.35
148 0.31
149 0.27
150 0.29
151 0.25
152 0.24
153 0.22
154 0.16
155 0.19
156 0.18
157 0.2
158 0.17
159 0.16
160 0.17
161 0.15
162 0.18
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.19
167 0.2
168 0.19
169 0.2
170 0.21
171 0.25
172 0.25
173 0.3
174 0.31
175 0.31
176 0.31
177 0.33
178 0.32
179 0.29
180 0.3
181 0.23
182 0.2
183 0.24
184 0.24
185 0.21
186 0.19
187 0.18
188 0.16
189 0.2
190 0.19
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.1
197 0.07
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.09
216 0.09
217 0.11
218 0.17
219 0.23
220 0.27
221 0.36
222 0.4
223 0.39
224 0.42
225 0.46
226 0.42
227 0.43
228 0.41
229 0.36
230 0.31
231 0.31
232 0.29
233 0.23
234 0.24
235 0.18
236 0.18
237 0.17
238 0.16
239 0.15
240 0.18
241 0.18
242 0.17
243 0.16
244 0.16
245 0.13
246 0.13
247 0.14
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.1
264 0.12
265 0.18
266 0.22
267 0.22
268 0.22
269 0.22
270 0.23
271 0.22
272 0.23
273 0.19
274 0.15
275 0.14
276 0.13
277 0.14
278 0.12
279 0.1
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.1
289 0.1
290 0.14
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.17
295 0.18
296 0.19
297 0.18
298 0.15
299 0.17
300 0.15
301 0.15
302 0.12
303 0.11
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.11
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.15
318 0.17
319 0.19
320 0.2
321 0.17
322 0.19
323 0.22
324 0.26
325 0.31
326 0.35
327 0.42
328 0.45
329 0.44
330 0.47
331 0.53
332 0.52
333 0.49
334 0.47
335 0.47
336 0.46
337 0.49
338 0.51
339 0.43
340 0.41
341 0.45
342 0.41
343 0.35
344 0.31
345 0.3
346 0.29
347 0.26
348 0.25
349 0.18
350 0.17
351 0.14
352 0.14
353 0.1
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.03
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.09
391 0.13
392 0.14
393 0.13
394 0.13
395 0.13
396 0.16
397 0.16
398 0.15
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.07
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.06
409 0.08
410 0.09
411 0.1
412 0.1
413 0.12
414 0.17
415 0.22
416 0.28
417 0.29
418 0.29
419 0.32
420 0.33
421 0.34
422 0.3
423 0.27
424 0.21
425 0.2
426 0.19
427 0.14
428 0.13
429 0.12
430 0.12
431 0.09
432 0.1
433 0.09
434 0.11
435 0.12
436 0.13
437 0.14
438 0.18
439 0.24
440 0.26
441 0.28
442 0.29
443 0.29
444 0.31
445 0.35
446 0.36
447 0.34
448 0.3
449 0.27
450 0.24
451 0.25
452 0.21
453 0.14
454 0.1
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.1
459 0.1
460 0.16
461 0.22
462 0.23
463 0.25
464 0.28
465 0.3
466 0.31
467 0.34
468 0.4
469 0.43
470 0.52
471 0.52
472 0.54
473 0.52
474 0.51
475 0.53
476 0.45
477 0.37
478 0.27
479 0.24
480 0.21
481 0.22
482 0.2
483 0.18
484 0.19
485 0.2
486 0.22
487 0.24
488 0.24
489 0.29
490 0.33
491 0.34
492 0.35
493 0.39
494 0.36
495 0.35
496 0.37
497 0.34
498 0.33
499 0.32
500 0.33
501 0.34
502 0.41
503 0.44
504 0.47
505 0.53
506 0.55
507 0.58
508 0.63
509 0.66
510 0.68
511 0.68
512 0.67
513 0.59
514 0.56
515 0.48
516 0.4
517 0.36
518 0.28
519 0.24
520 0.2
521 0.19
522 0.2
523 0.19
524 0.15
525 0.1
526 0.12
527 0.12
528 0.11
529 0.11
530 0.08
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.08
542 0.11
543 0.13
544 0.19
545 0.2
546 0.25
547 0.28
548 0.28
549 0.31
550 0.36
551 0.38
552 0.38
553 0.47
554 0.46
555 0.45
556 0.47
557 0.52
558 0.56
559 0.6
560 0.64
561 0.64
562 0.71
563 0.8
564 0.85
565 0.85
566 0.84
567 0.85
568 0.84
569 0.82