Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6K5T0

Protein Details
Accession B6K5T0    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
175-203QERAQHRKEKARQKKLSKQQRKQQQQDAAHydrophilic
258-310SSKPSAAHKGPRRANKKTKKQSAESNVASQSLNPPKKNAKKKPRPKRVPKSTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-195QERAQHRKEKARQKKLSKQQR
261-279PSAAHKGPRRANKKTKKQS
290-307NPPKKNAKKKPRPKRVPK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12, cyto_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
GO:0045727  P:positive regulation of translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MVPFDSAGKRVPCKLVVRKLPANLPASVFWDSVKPWHEAIERSRFHPGHLQPEKDLEVHSYAILLFKSPEQVTSFFLHYQNHAFVNKNNVRYHASVAVAPNQKWVAHGRKDSRMGTLEEDEDFIQFKKSLESAEADSSLKPSFPLAPEDSVVTTEPVKTTTPLLEYVKAKQQKAQERAQHRKEKARQKKLSKQQRKQQQQDAAGGEPLAAKSSGTSAQSISIAIPADATSATANIADNASSVSIESPSVGSIPAATPSSKPSAAHKGPRRANKKTKKQSAESNVASQSLNPPKKNAKKKPRPKRVPKSTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.6
3 0.63
4 0.68
5 0.7
6 0.7
7 0.7
8 0.67
9 0.6
10 0.52
11 0.45
12 0.38
13 0.36
14 0.34
15 0.28
16 0.22
17 0.21
18 0.2
19 0.22
20 0.23
21 0.22
22 0.19
23 0.25
24 0.27
25 0.3
26 0.37
27 0.42
28 0.41
29 0.41
30 0.5
31 0.45
32 0.44
33 0.48
34 0.45
35 0.46
36 0.51
37 0.51
38 0.43
39 0.47
40 0.47
41 0.38
42 0.35
43 0.26
44 0.21
45 0.19
46 0.17
47 0.13
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.1
52 0.08
53 0.08
54 0.13
55 0.13
56 0.15
57 0.16
58 0.18
59 0.2
60 0.22
61 0.24
62 0.21
63 0.24
64 0.23
65 0.22
66 0.23
67 0.22
68 0.22
69 0.22
70 0.21
71 0.21
72 0.3
73 0.33
74 0.37
75 0.36
76 0.36
77 0.38
78 0.38
79 0.39
80 0.32
81 0.28
82 0.24
83 0.24
84 0.29
85 0.29
86 0.27
87 0.26
88 0.24
89 0.23
90 0.23
91 0.28
92 0.28
93 0.3
94 0.37
95 0.39
96 0.44
97 0.5
98 0.49
99 0.46
100 0.41
101 0.36
102 0.32
103 0.29
104 0.23
105 0.18
106 0.18
107 0.15
108 0.13
109 0.12
110 0.09
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.12
120 0.13
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.13
150 0.14
151 0.16
152 0.17
153 0.19
154 0.25
155 0.29
156 0.28
157 0.29
158 0.35
159 0.4
160 0.45
161 0.5
162 0.5
163 0.55
164 0.65
165 0.7
166 0.72
167 0.66
168 0.71
169 0.72
170 0.76
171 0.77
172 0.78
173 0.79
174 0.79
175 0.86
176 0.86
177 0.89
178 0.89
179 0.88
180 0.85
181 0.87
182 0.88
183 0.85
184 0.83
185 0.8
186 0.72
187 0.68
188 0.62
189 0.52
190 0.41
191 0.33
192 0.25
193 0.17
194 0.13
195 0.09
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.07
200 0.09
201 0.1
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.15
245 0.2
246 0.2
247 0.21
248 0.25
249 0.34
250 0.4
251 0.49
252 0.55
253 0.61
254 0.67
255 0.77
256 0.79
257 0.79
258 0.84
259 0.85
260 0.87
261 0.88
262 0.9
263 0.89
264 0.87
265 0.87
266 0.85
267 0.84
268 0.76
269 0.71
270 0.62
271 0.54
272 0.47
273 0.38
274 0.37
275 0.38
276 0.42
277 0.38
278 0.43
279 0.52
280 0.63
281 0.73
282 0.75
283 0.76
284 0.8
285 0.9
286 0.94
287 0.95
288 0.96
289 0.97
290 0.97