FuNGI

A0A0D1E8Q2

Protein Details

Accession

A0A0D1E8Q2

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
398-439	DKVRAKTSTKDKKDTKDKLDKKDTKDTKDKRDKKDKAKAVAP	Basic
448-475	QEAEKDKSSRKETRKKRTGKRAVDADGA	Basic
517-544	HVDTAKPNTRPPRRKAPPKNTHKSSTGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
103-113	KEAPKAKAKVQ
403-468	KTSTKDKKDTKDKLDKKDTKDTKDKRDKKDKAKAVAPASEEQAKLQEAEKDKSSRKETRKKRTGKR
526-536	RPPRRKAPPKN

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay GO:0045727 P:positive regulation of translation
KEGG	uma:UMAG_00233 -
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSQSQRGSPAIADASASASKVKAQQTHKAQQNDRALSNRAKAQQNKERAAAQARARNAPNVAAAAQDKSGPVASTTQGRRSKPPTLAPPSQAGAKQSTKQATKEAPKAKAKVQPPRQTKATPQFKSKVVIRRLPPNLPAHVFWKAVSPWIRDSADCQALTTTAQTSSAPAQPGAETSEAHTSDSRSAATSSASTSPTPTVDYKQFVAGKLKTDTNKQNKHARAYVRFLDAQMLVQFYKAFDGHIFRDSRGNESIAIVEFAPYQKVVVSTPRTGTRGGPRAAKLDAQQGTIDKDADYQCFLERLSKADDQVQRSEGELLASLLDSKGKEKETEARRLAGKVTPLLLHLREQKMAQSDASTRYADKMQKAADKPTIVTAARSAGVGVTGGPSVAAVGAEDKVRAKTSTKDKKDTKDKLDKKDTKDTKDKRDKKDKAKAVAPASEEQAKLQEAEKDKSSRKETRKKRTGKRAVDADGAATPSRAQAAHVATRKAATCKTATKNRDTSASTSAHVAEPLAHVDTAKPNTRPPRRKAPPKNTHKSSTGPPSSPAAASSSKLHIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.16
3	0.17
4	0.13
5	0.12
6	0.15
7	0.21
8	0.27
9	0.31
10	0.36
11	0.45
12	0.54
13	0.64
14	0.69
15	0.72
16	0.71
17	0.72
18	0.77
19	0.72
20	0.66
21	0.62
22	0.59
23	0.55
24	0.55
25	0.53
26	0.51
27	0.55
28	0.58
29	0.64
30	0.68
31	0.72
32	0.71
33	0.68
34	0.63
35	0.59
36	0.57
37	0.54
38	0.52
39	0.49
40	0.48
41	0.51
42	0.5
43	0.48
44	0.43
45	0.38
46	0.32
47	0.27
48	0.23
49	0.2
50	0.19
51	0.17
52	0.17
53	0.16
54	0.14
55	0.13
56	0.14
57	0.12
58	0.12
59	0.12
60	0.14
61	0.21
62	0.25
63	0.33
64	0.39
65	0.41
66	0.48
67	0.52
68	0.58
69	0.56
70	0.61
71	0.62
72	0.64
73	0.67
74	0.62
75	0.6
76	0.54
77	0.51
78	0.44
79	0.37
80	0.34
81	0.33
82	0.33
83	0.36
84	0.42
85	0.41
86	0.42
87	0.45
88	0.48
89	0.51
90	0.57
91	0.59
92	0.6
93	0.64
94	0.65
95	0.65
96	0.64
97	0.64
98	0.66
99	0.68
100	0.7
101	0.7
102	0.73
103	0.72
104	0.68
105	0.69
106	0.69
107	0.7
108	0.64
109	0.65
110	0.63
111	0.6
112	0.62
113	0.59
114	0.58
115	0.55
116	0.58
117	0.54
118	0.59
119	0.62
120	0.6
121	0.59
122	0.54
123	0.52
124	0.47
125	0.44
126	0.38
127	0.37
128	0.33
129	0.27
130	0.27
131	0.23
132	0.26
133	0.29
134	0.27
135	0.26
136	0.31
137	0.32
138	0.27
139	0.3
140	0.31
141	0.32
142	0.29
143	0.26
144	0.21
145	0.21
146	0.21
147	0.19
148	0.13
149	0.08
150	0.09
151	0.08
152	0.1
153	0.12
154	0.15
155	0.15
156	0.14
157	0.14
158	0.14
159	0.14
160	0.15
161	0.13
162	0.1
163	0.11
164	0.16
165	0.16
166	0.17
167	0.17
168	0.16
169	0.17
170	0.18
171	0.16
172	0.12
173	0.12
174	0.11
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.12
179	0.14
180	0.13
181	0.13
182	0.14
183	0.14
184	0.16
185	0.15
186	0.17
187	0.18
188	0.21
189	0.2
190	0.25
191	0.26
192	0.25
193	0.29
194	0.27
195	0.27
196	0.28
197	0.31
198	0.27
199	0.33
200	0.41
201	0.45
202	0.51
203	0.53
204	0.6
205	0.6
206	0.64
207	0.62
208	0.6
209	0.55
210	0.52
211	0.49
212	0.44
213	0.4
214	0.35
215	0.31
216	0.24
217	0.2
218	0.15
219	0.13
220	0.1
221	0.09
222	0.09
223	0.07
224	0.08
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.1
229	0.11
230	0.16
231	0.17
232	0.16
233	0.21
234	0.21
235	0.24
236	0.22
237	0.22
238	0.17
239	0.16
240	0.17
241	0.12
242	0.12
243	0.08
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.11
254	0.15
255	0.16
256	0.18
257	0.21
258	0.21
259	0.22
260	0.24
261	0.25
262	0.28
263	0.29
264	0.3
265	0.29
266	0.3
267	0.3
268	0.29
269	0.23
270	0.23
271	0.23
272	0.2
273	0.19
274	0.18
275	0.18
276	0.17
277	0.16
278	0.09
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.12
283	0.11
284	0.1
285	0.11
286	0.11
287	0.12
288	0.11
289	0.13
290	0.17
291	0.17
292	0.17
293	0.24
294	0.28
295	0.27
296	0.28
297	0.27
298	0.23
299	0.23
300	0.23
301	0.16
302	0.12
303	0.09
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.05
308	0.04
309	0.06
310	0.05
311	0.07
312	0.09
313	0.1
314	0.11
315	0.13
316	0.22
317	0.26
318	0.35
319	0.36
320	0.36
321	0.37
322	0.37
323	0.37
324	0.3
325	0.26
326	0.18
327	0.18
328	0.15
329	0.15
330	0.16
331	0.15
332	0.17
333	0.22
334	0.22
335	0.22
336	0.22
337	0.24
338	0.24
339	0.24
340	0.21
341	0.16
342	0.17
343	0.19
344	0.22
345	0.2
346	0.17
347	0.18
348	0.23
349	0.24
350	0.24
351	0.24
352	0.25
353	0.31
354	0.33
355	0.36
356	0.35
357	0.33
358	0.31
359	0.3
360	0.3
361	0.23
362	0.22
363	0.18
364	0.15
365	0.15
366	0.14
367	0.12
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.06
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.03
380	0.03
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.08
386	0.09
387	0.11
388	0.12
389	0.14
390	0.21
391	0.31
392	0.42
393	0.48
394	0.56
395	0.62
396	0.7
397	0.79
398	0.8
399	0.79
400	0.8
401	0.81
402	0.81
403	0.86
404	0.84
405	0.8
406	0.82
407	0.79
408	0.76
409	0.79
410	0.77
411	0.77
412	0.8
413	0.83
414	0.82
415	0.86
416	0.88
417	0.87
418	0.9
419	0.87
420	0.84
421	0.8
422	0.77
423	0.7
424	0.65
425	0.58
426	0.49
427	0.44
428	0.4
429	0.34
430	0.27
431	0.25
432	0.21
433	0.18
434	0.18
435	0.21
436	0.22
437	0.25
438	0.3
439	0.34
440	0.39
441	0.45
442	0.52
443	0.56
444	0.62
445	0.69
446	0.74
447	0.8
448	0.85
449	0.87
450	0.9
451	0.92
452	0.92
453	0.91
454	0.89
455	0.86
456	0.8
457	0.74
458	0.63
459	0.54
460	0.44
461	0.37
462	0.28
463	0.2
464	0.15
465	0.11
466	0.13
467	0.11
468	0.1
469	0.14
470	0.19
471	0.27
472	0.31
473	0.32
474	0.31
475	0.34
476	0.36
477	0.35
478	0.32
479	0.28
480	0.29
481	0.36
482	0.44
483	0.51
484	0.54
485	0.59
486	0.64
487	0.62
488	0.64
489	0.59
490	0.54
491	0.5
492	0.47
493	0.39
494	0.33
495	0.32
496	0.27
497	0.23
498	0.19
499	0.14
500	0.13
501	0.15
502	0.14
503	0.13
504	0.12
505	0.14
506	0.21
507	0.26
508	0.31
509	0.31
510	0.37
511	0.48
512	0.59
513	0.66
514	0.67
515	0.72
516	0.77
517	0.87
518	0.9
519	0.9
520	0.9
521	0.92
522	0.95
523	0.92
524	0.88
525	0.81
526	0.75
527	0.73
528	0.72
529	0.69
530	0.6
531	0.55
532	0.53
533	0.51
534	0.45
535	0.37
536	0.31
537	0.26
538	0.26
539	0.27

A0A0D1E8Q2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer