Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6K4A1

Protein Details
Accession B6K4A1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
139-160IPITQRITKKRQKDVPSQSVQDHydrophilic
928-948APQSVERKKLRWKSCYRLGDMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8, mito 7, cyto_nucl 7, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004871  Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C  
IPR018846  Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0070912  C:Ddb1-Ckn1 complex  
GO:0070913  C:Ddb1-Wdr21 complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035861  C:site of double-strand break  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0033621  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, meiosis-specific transcripts  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
GO:0006283  P:transcription-coupled nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03178  CPSF_A  
PF10433  MMS1_N  
Amino Acid Sequences MSYVSSIHKFSSVKDAVSCRLDGKNWNVVVLKTNRIEIYGFEGDKLVQLGSSTVFSKVRSIKSFRPPLSTKDHLIVTVSPFSYFTVTWDPDKKQFINEVTAQPPASTFFLNKQRNPKLLIDPSNRVICSHAFQGLLTFIPITQRITKKRQKDVPSQSVQDNFTVRIMELDVLDIVFLYTSKTPTLAVLYKDSRSVIHLKAYTVNLAEKELNEDESFACHDIEEGRLIAHYDGGVFVFGEVYVYYVSREKKSSKMLVSYPVTAYSAVFQSFQNGTEVCINERKYIVSDESGAVYMFNIGNNFNVTLEKIGEAPIASCIVALPNDQIFLGSHFGDSKLYRFQNKPGVAGSVELLEVQSFDNLAPISDFCIDHGNGGSFMVACCNAYNEGSLREMKSGIDISDYGVIEMPNVCSLYSVQLQSSVTKYLFVGSISETSVFEISQSGEMDLVDSLCLEEPTIFVGATSDSSCLYHVARSSVCLFDGKQLSYWFADGGAITCAAVYDNAVCLSMTNNQIVFLHKLQVVSKLQVDSDVTALSFLNDARTICVGLWNQKLLLLDSDNTTCTVRETLEVNEKAQSLVCVKLAGIASVALYMSTESGKLITFDIDPVTKGIKQRLTYPLTAVPLNMNTFQTPNGPVLITLGEHPYAVYGENQHLSFAYIGNSDIVCLSHLQHPGIPANTVYATRNALKLSNVNMLQKLHIRRIPVAGIPRRIAATKEHYFVLSVDLQDKLASQGSSIMSSLHVFKKLTYETVLQHEFEDYEIVECALTLPDNERVVVGTGFNYPDRDEPDGGRLIVFRLDEQEKLVTEAVYKTQGAIFSVEYQEGKLLVGMNAVLCTFRYENKTLRVVGSTRTPTYCLNIAASSKDIVVVGDMMKSLTLYNTEKDTAEEVARDFGALWVTSVQPLSETLFFCTTADGEAVTMLWDTKAPQSVERKKLRWKSCYRLGDMVNRTRRGCFVLSSPSRLVKPELMCVTVEGGILLIGDASQHADLLLQIQHNFLEAVPPLGGLDFYKWHERLFPARASAANKDFIDGDLLESIEDLPESTLQKIVQGTNGGQSLNISVPDLLGIISDLKRLH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.38
4 0.41
5 0.4
6 0.33
7 0.35
8 0.36
9 0.37
10 0.39
11 0.42
12 0.39
13 0.42
14 0.4
15 0.37
16 0.42
17 0.4
18 0.41
19 0.34
20 0.38
21 0.34
22 0.34
23 0.33
24 0.26
25 0.29
26 0.28
27 0.27
28 0.24
29 0.24
30 0.23
31 0.23
32 0.23
33 0.15
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.12
39 0.12
40 0.14
41 0.16
42 0.16
43 0.23
44 0.3
45 0.36
46 0.41
47 0.47
48 0.52
49 0.62
50 0.71
51 0.67
52 0.69
53 0.65
54 0.64
55 0.66
56 0.62
57 0.55
58 0.49
59 0.47
60 0.39
61 0.38
62 0.34
63 0.3
64 0.3
65 0.26
66 0.22
67 0.21
68 0.22
69 0.22
70 0.19
71 0.19
72 0.21
73 0.23
74 0.28
75 0.34
76 0.38
77 0.42
78 0.49
79 0.46
80 0.43
81 0.47
82 0.45
83 0.45
84 0.46
85 0.45
86 0.4
87 0.42
88 0.38
89 0.31
90 0.28
91 0.24
92 0.21
93 0.17
94 0.17
95 0.22
96 0.32
97 0.4
98 0.45
99 0.53
100 0.59
101 0.62
102 0.65
103 0.63
104 0.62
105 0.63
106 0.67
107 0.64
108 0.62
109 0.62
110 0.63
111 0.57
112 0.48
113 0.42
114 0.34
115 0.31
116 0.27
117 0.25
118 0.19
119 0.19
120 0.2
121 0.18
122 0.16
123 0.13
124 0.11
125 0.08
126 0.11
127 0.12
128 0.15
129 0.21
130 0.29
131 0.36
132 0.47
133 0.55
134 0.61
135 0.7
136 0.76
137 0.76
138 0.79
139 0.83
140 0.83
141 0.81
142 0.76
143 0.7
144 0.66
145 0.59
146 0.52
147 0.43
148 0.34
149 0.28
150 0.25
151 0.2
152 0.16
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.06
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.17
172 0.18
173 0.19
174 0.25
175 0.28
176 0.28
177 0.3
178 0.29
179 0.25
180 0.25
181 0.28
182 0.23
183 0.27
184 0.27
185 0.27
186 0.31
187 0.32
188 0.3
189 0.26
190 0.26
191 0.2
192 0.21
193 0.21
194 0.16
195 0.2
196 0.19
197 0.2
198 0.17
199 0.18
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.13
204 0.12
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.11
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.07
231 0.11
232 0.15
233 0.17
234 0.21
235 0.23
236 0.29
237 0.37
238 0.42
239 0.42
240 0.45
241 0.44
242 0.48
243 0.49
244 0.45
245 0.38
246 0.32
247 0.29
248 0.23
249 0.21
250 0.15
251 0.13
252 0.11
253 0.12
254 0.1
255 0.14
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.13
260 0.14
261 0.18
262 0.19
263 0.17
264 0.22
265 0.23
266 0.23
267 0.23
268 0.22
269 0.2
270 0.22
271 0.22
272 0.17
273 0.18
274 0.16
275 0.17
276 0.16
277 0.14
278 0.11
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.08
289 0.09
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.09
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.18
323 0.21
324 0.26
325 0.28
326 0.33
327 0.4
328 0.4
329 0.4
330 0.33
331 0.32
332 0.27
333 0.26
334 0.2
335 0.12
336 0.1
337 0.09
338 0.07
339 0.05
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.13
358 0.12
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.1
374 0.11
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.12
380 0.13
381 0.12
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.12
387 0.12
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.1
393 0.09
394 0.06
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.09
400 0.11
401 0.12
402 0.11
403 0.13
404 0.13
405 0.14
406 0.15
407 0.14
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.11
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.07
423 0.06
424 0.06
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.13
462 0.12
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.14
467 0.17
468 0.15
469 0.15
470 0.15
471 0.16
472 0.16
473 0.16
474 0.1
475 0.08
476 0.08
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.03
487 0.03
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.09
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.13
501 0.14
502 0.11
503 0.13
504 0.13
505 0.14
506 0.14
507 0.18
508 0.18
509 0.16
510 0.17
511 0.15
512 0.14
513 0.14
514 0.14
515 0.09
516 0.09
517 0.07
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.07
529 0.07
530 0.06
531 0.1
532 0.1
533 0.14
534 0.15
535 0.14
536 0.14
537 0.15
538 0.16
539 0.13
540 0.13
541 0.09
542 0.08
543 0.09
544 0.1
545 0.09
546 0.09
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.09
551 0.08
552 0.08
553 0.1
554 0.11
555 0.19
556 0.19
557 0.19
558 0.2
559 0.2
560 0.19
561 0.17
562 0.16
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.08
567 0.07
568 0.1
569 0.1
570 0.09
571 0.08
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.04
582 0.03
583 0.04
584 0.04
585 0.05
586 0.05
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.08
591 0.07
592 0.08
593 0.08
594 0.09
595 0.1
596 0.12
597 0.16
598 0.2
599 0.2
600 0.25
601 0.32
602 0.34
603 0.32
604 0.33
605 0.31
606 0.28
607 0.27
608 0.23
609 0.16
610 0.14
611 0.15
612 0.14
613 0.12
614 0.1
615 0.11
616 0.11
617 0.12
618 0.11
619 0.11
620 0.1
621 0.09
622 0.09
623 0.09
624 0.09
625 0.07
626 0.07
627 0.08
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.06
635 0.07
636 0.08
637 0.1
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.1
643 0.09
644 0.08
645 0.06
646 0.07
647 0.08
648 0.07
649 0.07
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.06
654 0.08
655 0.12
656 0.13
657 0.14
658 0.14
659 0.16
660 0.18
661 0.18
662 0.16
663 0.12
664 0.11
665 0.12
666 0.12
667 0.11
668 0.11
669 0.13
670 0.13
671 0.15
672 0.14
673 0.14
674 0.15
675 0.16
676 0.17
677 0.2
678 0.21
679 0.21
680 0.23
681 0.22
682 0.23
683 0.26
684 0.26
685 0.26
686 0.27
687 0.27
688 0.27
689 0.28
690 0.28
691 0.26
692 0.32
693 0.31
694 0.33
695 0.32
696 0.31
697 0.3
698 0.29
699 0.27
700 0.23
701 0.26
702 0.25
703 0.26
704 0.26
705 0.25
706 0.25
707 0.24
708 0.22
709 0.16
710 0.13
711 0.12
712 0.12
713 0.12
714 0.11
715 0.11
716 0.09
717 0.1
718 0.09
719 0.08
720 0.11
721 0.11
722 0.12
723 0.12
724 0.11
725 0.09
726 0.1
727 0.14
728 0.13
729 0.15
730 0.14
731 0.15
732 0.2
733 0.2
734 0.21
735 0.2
736 0.21
737 0.21
738 0.27
739 0.28
740 0.23
741 0.23
742 0.21
743 0.19
744 0.16
745 0.14
746 0.08
747 0.07
748 0.07
749 0.06
750 0.06
751 0.05
752 0.06
753 0.05
754 0.05
755 0.05
756 0.07
757 0.11
758 0.12
759 0.12
760 0.11
761 0.11
762 0.13
763 0.13
764 0.11
765 0.08
766 0.09
767 0.11
768 0.11
769 0.12
770 0.12
771 0.14
772 0.17
773 0.19
774 0.19
775 0.19
776 0.22
777 0.23
778 0.22
779 0.2
780 0.17
781 0.14
782 0.15
783 0.14
784 0.1
785 0.13
786 0.15
787 0.15
788 0.16
789 0.18
790 0.16
791 0.18
792 0.18
793 0.13
794 0.13
795 0.13
796 0.13
797 0.14
798 0.14
799 0.12
800 0.13
801 0.13
802 0.13
803 0.13
804 0.12
805 0.12
806 0.14
807 0.14
808 0.13
809 0.13
810 0.12
811 0.11
812 0.1
813 0.08
814 0.08
815 0.07
816 0.07
817 0.07
818 0.07
819 0.07
820 0.07
821 0.06
822 0.05
823 0.09
824 0.1
825 0.13
826 0.19
827 0.22
828 0.27
829 0.33
830 0.36
831 0.34
832 0.35
833 0.35
834 0.31
835 0.29
836 0.33
837 0.32
838 0.3
839 0.3
840 0.31
841 0.28
842 0.31
843 0.31
844 0.24
845 0.22
846 0.21
847 0.21
848 0.2
849 0.21
850 0.17
851 0.14
852 0.14
853 0.12
854 0.09
855 0.09
856 0.08
857 0.07
858 0.07
859 0.07
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.06
865 0.1
866 0.12
867 0.14
868 0.17
869 0.18
870 0.19
871 0.2
872 0.21
873 0.19
874 0.18
875 0.17
876 0.15
877 0.15
878 0.15
879 0.13
880 0.12
881 0.1
882 0.11
883 0.1
884 0.1
885 0.09
886 0.1
887 0.11
888 0.11
889 0.09
890 0.08
891 0.09
892 0.12
893 0.14
894 0.14
895 0.16
896 0.17
897 0.18
898 0.17
899 0.17
900 0.14
901 0.12
902 0.11
903 0.08
904 0.07
905 0.07
906 0.07
907 0.06
908 0.06
909 0.05
910 0.05
911 0.06
912 0.07
913 0.11
914 0.16
915 0.17
916 0.24
917 0.34
918 0.44
919 0.53
920 0.61
921 0.64
922 0.68
923 0.77
924 0.8
925 0.8
926 0.8
927 0.79
928 0.81
929 0.83
930 0.78
931 0.75
932 0.7
933 0.69
934 0.68
935 0.68
936 0.66
937 0.63
938 0.59
939 0.53
940 0.51
941 0.46
942 0.4
943 0.33
944 0.29
945 0.34
946 0.37
947 0.41
948 0.42
949 0.41
950 0.41
951 0.4
952 0.4
953 0.36
954 0.35
955 0.37
956 0.36
957 0.33
958 0.32
959 0.31
960 0.29
961 0.23
962 0.2
963 0.12
964 0.1
965 0.08
966 0.07
967 0.06
968 0.04
969 0.03
970 0.03
971 0.03
972 0.05
973 0.05
974 0.05
975 0.05
976 0.06
977 0.06
978 0.09
979 0.11
980 0.12
981 0.13
982 0.14
983 0.14
984 0.14
985 0.15
986 0.12
987 0.13
988 0.11
989 0.12
990 0.11
991 0.11
992 0.11
993 0.1
994 0.11
995 0.08
996 0.1
997 0.12
998 0.15
999 0.23
1000 0.24
1001 0.25
1002 0.29
1003 0.32
1004 0.38
1005 0.4
1006 0.41
1007 0.37
1008 0.39
1009 0.42
1010 0.42
1011 0.45
1012 0.41
1013 0.42
1014 0.38
1015 0.35
1016 0.33
1017 0.29
1018 0.28
1019 0.21
1020 0.19
1021 0.14
1022 0.14
1023 0.12
1024 0.12
1025 0.12
1026 0.08
1027 0.08
1028 0.07
1029 0.07
1030 0.1
1031 0.12
1032 0.13
1033 0.15
1034 0.15
1035 0.18
1036 0.21
1037 0.21
1038 0.22
1039 0.24
1040 0.24
1041 0.26
1042 0.28
1043 0.24
1044 0.21
1045 0.21
1046 0.19
1047 0.17
1048 0.17
1049 0.13
1050 0.11
1051 0.11
1052 0.11
1053 0.11
1054 0.08
1055 0.06
1056 0.07
1057 0.1
1058 0.1