FuNGI

A0A2H3BIX3

Protein Details

Accession

A0A2H3BIX3

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-47	ASILFHKKKPPVAKAQPKAGSSPQKPRPPKAVAPRKQEDD	Hydrophilic
145-169	ASKAKGAPAKKKFQKKTKQVFVVPE	Hydrophilic
569-593	GSGQAGGPPKPKKRKSNAGPVPPLE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-42	HKKKPPVAKAQPKAGSSPQKPRPPKAVAPR
147-160	KAKGAPAKKKFQKK
505-511	KAPKLKP
557-559	KRK
572-584	QAGGPPKPKKRKS

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, mito_nucl 12.5, mito 11.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPPKKDLASILFHKKKPPVAKAQPKAGSSPQKPRPPKAVAPRKQEDDDDDLHLPDGPYSDFKLFSSALNGWKYDVMKFDSRKPVDIATWPPPIKLNRKDLRKDDPAANVPGVPVGPMLGADGQPVLQDGKIVMVDAEGRIVQDEASKAKGAPAKKKFQKKTKQVFVVPEEVRLLRKEERYPWVLEDGMAKETWVAQLDDTTKAQTHAFFMPAANDVFKFVPAHRWYKFQKKMKHDLPTDTANVEAQYAKHQKRDPTAWLSQRTGRAISSQTAAMFKAEAEGTTVDGPNSLVHTSGQSLGPGGRRLKVVDNGMSGLFGDEEDGEGSRRQREKEYGEEGDLDEQEYEEEFADDDEKMEVDNDDEEAKELEERLKKEYKSANKTREGYIDDSDEEEKPKMSKEERRMQKLIRNREGGDPDDSDDENKNPYASSEESSEEEEEIPAQPVSQPPPPANETPANSQAPQTPKPSTSQPALNGSKSDVRATSPVGSSLSGHSVVAKRATSPKAPKLKPSGGSRGGSPLASRATSPVPVSNSRATSPVAGAGSRAGSPVVQNGKKRKADDGAASPQGSGQAGGPPKPKKRKSNAGPVPPLEDRMVIEWLKNTPNASTRDCIQHFTPFLRDEGKKAKFTALVKEVAQLKDGVLVLRAAYRNGGAPASPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.66
3	0.67
4	0.68
5	0.68
6	0.71
7	0.79
8	0.8
9	0.84
10	0.82
11	0.75
12	0.71
13	0.69
14	0.69
15	0.65
16	0.67
17	0.67
18	0.71
19	0.76
20	0.78
21	0.78
22	0.75
23	0.77
24	0.78
25	0.8
26	0.78
27	0.81
28	0.82
29	0.79
30	0.75
31	0.68
32	0.62
33	0.57
34	0.51
35	0.46
36	0.39
37	0.33
38	0.3
39	0.28
40	0.23
41	0.18
42	0.16
43	0.13
44	0.13
45	0.16
46	0.18
47	0.17
48	0.17
49	0.2
50	0.2
51	0.19
52	0.22
53	0.21
54	0.26
55	0.27
56	0.27
57	0.25
58	0.28
59	0.28
60	0.25
61	0.26
62	0.25
63	0.31
64	0.34
65	0.41
66	0.48
67	0.49
68	0.5
69	0.48
70	0.46
71	0.41
72	0.43
73	0.41
74	0.37
75	0.44
76	0.41
77	0.39
78	0.42
79	0.46
80	0.5
81	0.52
82	0.56
83	0.56
84	0.65
85	0.73
86	0.75
87	0.77
88	0.75
89	0.72
90	0.67
91	0.66
92	0.61
93	0.56
94	0.5
95	0.41
96	0.33
97	0.29
98	0.23
99	0.15
100	0.1
101	0.07
102	0.06
103	0.05
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.07
108	0.07
109	0.06
110	0.06
111	0.07
112	0.07
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.07
117	0.07
118	0.08
119	0.07
120	0.06
121	0.07
122	0.07
123	0.08
124	0.06
125	0.06
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.08
130	0.1
131	0.11
132	0.13
133	0.14
134	0.13
135	0.17
136	0.21
137	0.25
138	0.34
139	0.4
140	0.49
141	0.57
142	0.68
143	0.73
144	0.8
145	0.85
146	0.86
147	0.88
148	0.88
149	0.88
150	0.82
151	0.8
152	0.73
153	0.71
154	0.61
155	0.51
156	0.43
157	0.36
158	0.32
159	0.26
160	0.26
161	0.22
162	0.27
163	0.3
164	0.33
165	0.39
166	0.4
167	0.41
168	0.39
169	0.36
170	0.32
171	0.27
172	0.25
173	0.2
174	0.18
175	0.16
176	0.14
177	0.11
178	0.11
179	0.12
180	0.1
181	0.09
182	0.07
183	0.1
184	0.12
185	0.15
186	0.15
187	0.15
188	0.14
189	0.15
190	0.16
191	0.13
192	0.15
193	0.14
194	0.14
195	0.13
196	0.13
197	0.13
198	0.14
199	0.14
200	0.11
201	0.1
202	0.11
203	0.1
204	0.11
205	0.11
206	0.1
207	0.18
208	0.22
209	0.28
210	0.27
211	0.34
212	0.39
213	0.49
214	0.58
215	0.58
216	0.63
217	0.65
218	0.74
219	0.75
220	0.78
221	0.71
222	0.66
223	0.62
224	0.57
225	0.49
226	0.39
227	0.32
228	0.23
229	0.2
230	0.15
231	0.12
232	0.08
233	0.15
234	0.23
235	0.25
236	0.3
237	0.34
238	0.37
239	0.42
240	0.46
241	0.44
242	0.42
243	0.48
244	0.48
245	0.49
246	0.48
247	0.46
248	0.45
249	0.41
250	0.35
251	0.28
252	0.24
253	0.21
254	0.2
255	0.17
256	0.15
257	0.14
258	0.14
259	0.13
260	0.11
261	0.09
262	0.08
263	0.08
264	0.07
265	0.06
266	0.07
267	0.06
268	0.07
269	0.08
270	0.09
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.06
275	0.07
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.09
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.09
286	0.1
287	0.14
288	0.14
289	0.14
290	0.15
291	0.16
292	0.19
293	0.21
294	0.22
295	0.19
296	0.19
297	0.18
298	0.17
299	0.16
300	0.13
301	0.09
302	0.06
303	0.05
304	0.04
305	0.03
306	0.03
307	0.04
308	0.04
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.13
313	0.15
314	0.16
315	0.19
316	0.24
317	0.27
318	0.31
319	0.35
320	0.31
321	0.29
322	0.28
323	0.26
324	0.22
325	0.19
326	0.13
327	0.08
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.1
355	0.14
356	0.15
357	0.2
358	0.25
359	0.25
360	0.31
361	0.38
362	0.42
363	0.48
364	0.56
365	0.59
366	0.6
367	0.63
368	0.59
369	0.55
370	0.49
371	0.42
372	0.35
373	0.29
374	0.22
375	0.21
376	0.21
377	0.18
378	0.16
379	0.13
380	0.13
381	0.12
382	0.13
383	0.15
384	0.2
385	0.27
386	0.34
387	0.44
388	0.52
389	0.59
390	0.61
391	0.61
392	0.62
393	0.63
394	0.64
395	0.61
396	0.57
397	0.51
398	0.52
399	0.51
400	0.47
401	0.41
402	0.31
403	0.26
404	0.24
405	0.22
406	0.19
407	0.17
408	0.16
409	0.15
410	0.14
411	0.13
412	0.1
413	0.11
414	0.13
415	0.13
416	0.14
417	0.14
418	0.15
419	0.16
420	0.18
421	0.18
422	0.15
423	0.14
424	0.12
425	0.11
426	0.1
427	0.1
428	0.08
429	0.07
430	0.08
431	0.1
432	0.13
433	0.16
434	0.18
435	0.17
436	0.22
437	0.26
438	0.26
439	0.29
440	0.3
441	0.29
442	0.32
443	0.37
444	0.34
445	0.31
446	0.31
447	0.31
448	0.32
449	0.33
450	0.33
451	0.29
452	0.29
453	0.32
454	0.35
455	0.34
456	0.32
457	0.34
458	0.33
459	0.39
460	0.41
461	0.39
462	0.35
463	0.33
464	0.34
465	0.31
466	0.29
467	0.21
468	0.2
469	0.2
470	0.22
471	0.23
472	0.18
473	0.18
474	0.17
475	0.17
476	0.16
477	0.15
478	0.15
479	0.13
480	0.12
481	0.14
482	0.15
483	0.17
484	0.19
485	0.18
486	0.18
487	0.24
488	0.28
489	0.33
490	0.38
491	0.46
492	0.53
493	0.55
494	0.6
495	0.62
496	0.65
497	0.64
498	0.64
499	0.64
500	0.6
501	0.59
502	0.52
503	0.48
504	0.42
505	0.36
506	0.29
507	0.23
508	0.19
509	0.19
510	0.18
511	0.16
512	0.17
513	0.18
514	0.2
515	0.2
516	0.22
517	0.25
518	0.29
519	0.31
520	0.32
521	0.3
522	0.31
523	0.28
524	0.25
525	0.23
526	0.21
527	0.18
528	0.15
529	0.14
530	0.14
531	0.14
532	0.12
533	0.12
534	0.09
535	0.08
536	0.09
537	0.15
538	0.23
539	0.27
540	0.34
541	0.43
542	0.52
543	0.57
544	0.59
545	0.58
546	0.55
547	0.56
548	0.56
549	0.54
550	0.52
551	0.51
552	0.49
553	0.43
554	0.37
555	0.33
556	0.26
557	0.19
558	0.12
559	0.14
560	0.16
561	0.21
562	0.28
563	0.35
564	0.45
565	0.56
566	0.64
567	0.69
568	0.76
569	0.83
570	0.84
571	0.88
572	0.88
573	0.88
574	0.87
575	0.78
576	0.75
577	0.65
578	0.59
579	0.48
580	0.39
581	0.3
582	0.24
583	0.27
584	0.2
585	0.2
586	0.2
587	0.22
588	0.24
589	0.25
590	0.23
591	0.22
592	0.28
593	0.32
594	0.34
595	0.34
596	0.35
597	0.42
598	0.43
599	0.43
600	0.39
601	0.42
602	0.41
603	0.41
604	0.42
605	0.34
606	0.35
607	0.39
608	0.38
609	0.37
610	0.44
611	0.47
612	0.46
613	0.46
614	0.48
615	0.47
616	0.48
617	0.51
618	0.46
619	0.43
620	0.4
621	0.44
622	0.46
623	0.4
624	0.38
625	0.29
626	0.24
627	0.25
628	0.25
629	0.2
630	0.14
631	0.14
632	0.13
633	0.19
634	0.2
635	0.16
636	0.17
637	0.17
638	0.18
639	0.2
640	0.2

A0A2H3BIX3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer