Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6K723

Protein Details
Accession B6K723    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-42GNDVTSKKQKTKEPVETRHRLEVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
372-377KRERKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.666, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
IPR044449  Rnt1/Pac1_DSRM_fungi  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
GO:0000182  F:rDNA binding  
GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0035613  F:RNA stem-loop binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0106410  P:box C/D RNA 5'-end processing  
GO:0070125  P:mitochondrial translational elongation  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0030847  P:termination of RNA polymerase II transcription, exosome-dependent  
GO:0034474  P:U2 snRNA 3'-end processing  
GO:0034475  P:U4 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00035  dsrm  
PF00636  Ribonuclease_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50137  DS_RBD  
PS00517  RNASE_3_1  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd19876  DSRM_RNT1p-like  
cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MGHTGHEKRSVDEVCPSSGNDVTSKKQKTKEPVETRHRLEVQKKLKKLSSVLDSVLGLLDSMPEEEKLQEVDEKLCRKMKNVAAHLSSSLKGKGEKEPAADNIAAAEEEEGEVVEATNAPILASQFSSSHLPSLYPSDSENEEGEWPPPLPKLKSSKLEKQVFMHISRAYELYPNHSNSQDLLSVHNERLEFLGDSFFNFYTTRLIYERFAELNEGELSKLRSKLVGNETAEKYARLYGFDKRLVLSVSAEKDELREAKKVIADTFEAYLGALALDGQEREAYRWVRRLTEPKLRETVVDGPIDKRAKAKLYHRYKHQGFIEYAWVDGKGGSSDGYVVACKFNGDEIARSWGANQKDAGARAAMKALEILAKRERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.34
4 0.29
5 0.29
6 0.28
7 0.24
8 0.26
9 0.3
10 0.38
11 0.44
12 0.49
13 0.53
14 0.6
15 0.65
16 0.72
17 0.76
18 0.78
19 0.81
20 0.84
21 0.86
22 0.83
23 0.82
24 0.77
25 0.74
26 0.7
27 0.7
28 0.71
29 0.71
30 0.71
31 0.69
32 0.68
33 0.65
34 0.62
35 0.59
36 0.55
37 0.49
38 0.45
39 0.39
40 0.35
41 0.3
42 0.26
43 0.18
44 0.11
45 0.08
46 0.07
47 0.05
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.17
59 0.23
60 0.26
61 0.3
62 0.35
63 0.35
64 0.35
65 0.42
66 0.44
67 0.48
68 0.51
69 0.53
70 0.5
71 0.5
72 0.49
73 0.43
74 0.37
75 0.3
76 0.25
77 0.19
78 0.2
79 0.21
80 0.26
81 0.3
82 0.32
83 0.32
84 0.34
85 0.34
86 0.34
87 0.32
88 0.25
89 0.18
90 0.16
91 0.13
92 0.1
93 0.08
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.09
114 0.12
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.17
127 0.16
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.11
134 0.1
135 0.12
136 0.15
137 0.14
138 0.2
139 0.27
140 0.32
141 0.4
142 0.46
143 0.52
144 0.59
145 0.63
146 0.6
147 0.55
148 0.56
149 0.51
150 0.46
151 0.4
152 0.31
153 0.25
154 0.24
155 0.22
156 0.15
157 0.15
158 0.14
159 0.16
160 0.19
161 0.21
162 0.22
163 0.22
164 0.22
165 0.19
166 0.2
167 0.17
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.16
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.09
179 0.08
180 0.09
181 0.07
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.1
192 0.12
193 0.12
194 0.13
195 0.15
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.08
204 0.09
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.12
209 0.14
210 0.14
211 0.2
212 0.24
213 0.29
214 0.28
215 0.33
216 0.34
217 0.35
218 0.35
219 0.28
220 0.24
221 0.21
222 0.19
223 0.16
224 0.17
225 0.2
226 0.24
227 0.26
228 0.26
229 0.23
230 0.24
231 0.22
232 0.21
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.15
239 0.15
240 0.17
241 0.19
242 0.17
243 0.18
244 0.18
245 0.2
246 0.23
247 0.23
248 0.21
249 0.19
250 0.18
251 0.17
252 0.17
253 0.14
254 0.12
255 0.11
256 0.1
257 0.07
258 0.06
259 0.04
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.14
269 0.17
270 0.2
271 0.27
272 0.29
273 0.32
274 0.38
275 0.45
276 0.47
277 0.54
278 0.54
279 0.53
280 0.56
281 0.52
282 0.46
283 0.42
284 0.41
285 0.34
286 0.34
287 0.3
288 0.26
289 0.33
290 0.34
291 0.3
292 0.27
293 0.27
294 0.3
295 0.36
296 0.43
297 0.46
298 0.56
299 0.63
300 0.69
301 0.75
302 0.73
303 0.75
304 0.71
305 0.67
306 0.57
307 0.52
308 0.51
309 0.4
310 0.38
311 0.3
312 0.24
313 0.18
314 0.16
315 0.15
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.15
331 0.16
332 0.17
333 0.18
334 0.25
335 0.25
336 0.25
337 0.26
338 0.26
339 0.27
340 0.28
341 0.26
342 0.25
343 0.29
344 0.31
345 0.3
346 0.27
347 0.26
348 0.24
349 0.27
350 0.21
351 0.17
352 0.16
353 0.15
354 0.18
355 0.18
356 0.21
357 0.27