FuNGI

B6JX83

Protein Details

Accession

B6JX83

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-31	LSALRAERSHFKRRLEKNETEENP	Hydrophilic
207-226	TEPVRTKRSRWDQPAPVKTE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 16, nucl 4.5, cyto_nucl 4.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR021133 HEAT_type_2 IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like IPR034085 TOG
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50077 HEAT_REPEAT

Amino Acid Sequences

MPIEDDELSALRAERSHFKRRLEKNETEENPVSTPWSTDGFAPGEPKTEKIQYDTHIYDSNKSMENYNTSIDVNEPEHSDDANDMDATDEVHSLVRQYEAPKALVNEFADEGYDPLKGRQLNKQIQNRETDYQKQRLQRQLTPTRVDAFGAETNPNARSYADVMREAEIEREERRVYMEIERRRKEGTLEEQPGAEPTKKRTTEKGTEPVRTKRSRWDQPAPVKTEEQAAHPLATETVTTSGKTTAPLRRSRWDQPKQITTVAEVVVEKGIPTTPIADKQLKDPRDRYLSDEELNSILPTEGYVILEPPEGYVPQKQEEEVPLGYQIPGAETDTQKVAAPTYLPTEIPGVGDLMFFKQEDVKYFGKILETKDEAKLSLAELKERKILRLLLKVKNGSPPMRKSALRQLTDQARDFGAAALFNQILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPFTHKILVVIEPLLIDEDYYARAEGREIISNLAKASGLAHMIATMRPDIDHVDEYVRNTTARAFSVVASALGVPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVRIVQQIALLMGCSVLPHLKNLVDCIGHGLEDEQTKVRTMTALALSALAEAATPYGIEAFDSVLKPLWGGVQRHRGKSLAAFLKATGFIIPLMEPEYASHFTRRIMKIVLREFSSPDEEMKKIVLKVVSQCASTDGVTPEYLSNEVLPEFFQCFWSRRLAADRRSYKQVVETTVVLSQKVGALRIIEHIVDNFKDESEPYRKMTAEAVDKVISSLGVDEIDERMEERLLDGVLFAFQEQAVEERVILNSFSTIINALNTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSANVREQAADLVSKIAVVLRACGEEALMRKLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKAIVSVIGMSSMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENIIDLVGRIADRGSEYVSAREWMRICFELIDMLKAHKKSIRRAAINTFGYISKAIGPQDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCMPFTVVPALMADYRTPEMNVQNGVLKSLAFMFEYIGDQARDYVYAVTPLLADALIDRDAVHRQTAASVVKHLALGCVGLGAEDAMLHLLNLLWPNILEESPHVINAVREGVDGIRNCVGVGVIMAYLMQGLFHPSRKVRRAFWTSYNSAYVQSADAMIPYYPKVNSDNHNTYERNDLFICL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.31
3	0.41
4	0.47
5	0.55
6	0.64
7	0.72
8	0.8
9	0.79
10	0.8
11	0.77
12	0.81
13	0.76
14	0.74
15	0.67
16	0.58
17	0.51
18	0.42
19	0.38
20	0.27
21	0.26
22	0.19
23	0.2
24	0.18
25	0.17
26	0.21
27	0.2
28	0.21
29	0.23
30	0.21
31	0.25
32	0.25
33	0.27
34	0.28
35	0.32
36	0.32
37	0.33
38	0.38
39	0.34
40	0.42
41	0.41
42	0.39
43	0.4
44	0.4
45	0.4
46	0.39
47	0.4
48	0.36
49	0.35
50	0.34
51	0.31
52	0.35
53	0.33
54	0.31
55	0.29
56	0.25
57	0.24
58	0.23
59	0.22
60	0.19
61	0.19
62	0.19
63	0.19
64	0.2
65	0.19
66	0.18
67	0.16
68	0.15
69	0.15
70	0.13
71	0.1
72	0.1
73	0.1
74	0.1
75	0.1
76	0.09
77	0.08
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.1
82	0.11
83	0.13
84	0.15
85	0.21
86	0.23
87	0.25
88	0.26
89	0.28
90	0.28
91	0.3
92	0.29
93	0.24
94	0.22
95	0.21
96	0.19
97	0.16
98	0.15
99	0.11
100	0.12
101	0.11
102	0.11
103	0.16
104	0.19
105	0.22
106	0.31
107	0.4
108	0.48
109	0.57
110	0.65
111	0.69
112	0.69
113	0.73
114	0.7
115	0.65
116	0.62
117	0.62
118	0.61
119	0.61
120	0.63
121	0.64
122	0.67
123	0.7
124	0.71
125	0.68
126	0.7
127	0.71
128	0.73
129	0.7
130	0.64
131	0.58
132	0.52
133	0.46
134	0.36
135	0.3
136	0.26
137	0.23
138	0.21
139	0.18
140	0.2
141	0.21
142	0.21
143	0.17
144	0.14
145	0.14
146	0.17
147	0.23
148	0.24
149	0.25
150	0.26
151	0.27
152	0.28
153	0.26
154	0.24
155	0.2
156	0.19
157	0.17
158	0.2
159	0.19
160	0.18
161	0.21
162	0.21
163	0.22
164	0.28
165	0.35
166	0.42
167	0.51
168	0.54
169	0.54
170	0.54
171	0.53
172	0.47
173	0.46
174	0.46
175	0.46
176	0.47
177	0.46
178	0.44
179	0.43
180	0.41
181	0.36
182	0.32
183	0.24
184	0.26
185	0.35
186	0.4
187	0.43
188	0.49
189	0.55
190	0.59
191	0.64
192	0.68
193	0.64
194	0.68
195	0.71
196	0.71
197	0.72
198	0.68
199	0.63
200	0.64
201	0.67
202	0.69
203	0.72
204	0.73
205	0.73
206	0.78
207	0.84
208	0.79
209	0.72
210	0.63
211	0.55
212	0.52
213	0.43
214	0.35
215	0.32
216	0.28
217	0.25
218	0.24
219	0.23
220	0.16
221	0.16
222	0.13
223	0.09
224	0.11
225	0.11
226	0.11
227	0.12
228	0.13
229	0.13
230	0.16
231	0.21
232	0.25
233	0.31
234	0.39
235	0.43
236	0.49
237	0.56
238	0.63
239	0.68
240	0.7
241	0.72
242	0.73
243	0.75
244	0.71
245	0.67
246	0.58
247	0.49
248	0.42
249	0.33
250	0.26
251	0.19
252	0.16
253	0.13
254	0.12
255	0.1
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.1
261	0.11
262	0.15
263	0.21
264	0.25
265	0.25
266	0.34
267	0.42
268	0.43
269	0.48
270	0.46
271	0.48
272	0.51
273	0.51
274	0.48
275	0.47
276	0.46
277	0.42
278	0.4
279	0.34
280	0.27
281	0.26
282	0.21
283	0.14
284	0.1
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.1
299	0.13
300	0.15
301	0.18
302	0.19
303	0.18
304	0.2
305	0.21
306	0.23
307	0.2
308	0.18
309	0.15
310	0.15
311	0.15
312	0.13
313	0.11
314	0.08
315	0.08
316	0.09
317	0.12
318	0.12
319	0.13
320	0.13
321	0.14
322	0.14
323	0.13
324	0.12
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.12
329	0.13
330	0.12
331	0.13
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.11
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.11
345	0.11
346	0.14
347	0.19
348	0.19
349	0.2
350	0.21
351	0.21
352	0.21
353	0.23
354	0.22
355	0.23
356	0.25
357	0.26
358	0.27
359	0.27
360	0.24
361	0.22
362	0.2
363	0.15
364	0.17
365	0.15
366	0.18
367	0.19
368	0.21
369	0.26
370	0.26
371	0.26
372	0.25
373	0.29
374	0.29
375	0.37
376	0.43
377	0.43
378	0.48
379	0.5
380	0.48
381	0.49
382	0.49
383	0.46
384	0.45
385	0.43
386	0.43
387	0.46
388	0.45
389	0.43
390	0.49
391	0.51
392	0.46
393	0.44
394	0.44
395	0.47
396	0.5
397	0.47
398	0.38
399	0.29
400	0.27
401	0.26
402	0.2
403	0.13
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.05
412	0.05
413	0.06
414	0.05
415	0.05
416	0.06
417	0.07
418	0.09
419	0.11
420	0.12
421	0.12
422	0.12
423	0.15
424	0.15
425	0.16
426	0.14
427	0.14
428	0.13
429	0.17
430	0.19
431	0.17
432	0.18
433	0.18
434	0.18
435	0.18
436	0.18
437	0.13
438	0.13
439	0.15
440	0.15
441	0.16
442	0.19
443	0.18
444	0.21
445	0.22
446	0.2
447	0.19
448	0.17
449	0.17
450	0.16
451	0.16
452	0.13
453	0.13
454	0.12
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.06
459	0.05
460	0.04
461	0.04
462	0.05
463	0.06
464	0.06
465	0.05
466	0.05
467	0.06
468	0.08
469	0.09
470	0.11
471	0.11
472	0.13
473	0.14
474	0.14
475	0.14
476	0.12
477	0.1
478	0.07
479	0.08
480	0.07
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.07
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.08
494	0.09
495	0.09
496	0.11
497	0.12
498	0.13
499	0.14
500	0.14
501	0.12
502	0.11
503	0.12
504	0.11
505	0.11
506	0.11
507	0.11
508	0.1
509	0.11
510	0.11
511	0.09
512	0.08
513	0.07
514	0.05
515	0.05
516	0.04
517	0.03
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.03
523	0.04
524	0.06
525	0.08
526	0.11
527	0.17
528	0.2
529	0.23
530	0.28
531	0.37
532	0.46
533	0.53
534	0.56
535	0.58
536	0.61
537	0.65
538	0.62
539	0.56
540	0.48
541	0.44
542	0.4
543	0.33
544	0.27
545	0.21
546	0.18
547	0.15
548	0.12
549	0.07
550	0.05
551	0.04
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.05
556	0.05
557	0.06
558	0.07
559	0.08
560	0.08
561	0.09
562	0.11
563	0.09
564	0.09
565	0.11
566	0.1
567	0.08
568	0.08
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.09
573	0.08
574	0.08
575	0.08
576	0.09
577	0.08
578	0.07
579	0.07
580	0.09
581	0.08
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.07
587	0.07
588	0.04
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.02
593	0.02
594	0.02
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.04
600	0.05
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.08
608	0.11
609	0.13
610	0.18
611	0.28
612	0.32
613	0.34
614	0.35
615	0.32
616	0.29
617	0.29
618	0.31
619	0.25
620	0.23
621	0.21
622	0.2
623	0.21
624	0.2
625	0.19
626	0.11
627	0.07
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.05
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.1
637	0.12
638	0.13
639	0.14
640	0.13
641	0.15
642	0.22
643	0.23
644	0.21
645	0.22
646	0.24
647	0.29
648	0.33
649	0.33
650	0.27
651	0.27
652	0.26
653	0.25
654	0.25
655	0.19
656	0.17
657	0.17
658	0.15
659	0.15
660	0.15
661	0.15
662	0.13
663	0.15
664	0.14
665	0.13
666	0.15
667	0.2
668	0.2
669	0.19
670	0.19
671	0.18
672	0.18
673	0.17
674	0.16
675	0.11
676	0.11
677	0.11
678	0.12
679	0.1
680	0.1
681	0.1
682	0.08
683	0.07
684	0.07
685	0.07
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.08
690	0.08
691	0.09
692	0.11
693	0.13
694	0.14
695	0.18
696	0.18
697	0.18
698	0.26
699	0.31
700	0.36
701	0.43
702	0.48
703	0.48
704	0.53
705	0.52
706	0.45
707	0.44
708	0.4
709	0.33
710	0.29
711	0.25
712	0.2
713	0.23
714	0.22
715	0.17
716	0.14
717	0.11
718	0.11
719	0.11
720	0.1
721	0.08
722	0.08
723	0.08
724	0.1
725	0.11
726	0.09
727	0.08
728	0.09
729	0.1
730	0.09
731	0.11
732	0.09
733	0.09
734	0.09
735	0.09
736	0.14
737	0.18
738	0.2
739	0.21
740	0.23
741	0.23
742	0.24
743	0.26
744	0.25
745	0.25
746	0.24
747	0.24
748	0.21
749	0.21
750	0.2
751	0.18
752	0.13
753	0.08
754	0.06
755	0.05
756	0.04
757	0.04
758	0.05
759	0.05
760	0.05
761	0.05
762	0.05
763	0.06
764	0.06
765	0.06
766	0.06
767	0.06
768	0.06
769	0.06
770	0.05
771	0.05
772	0.05
773	0.05
774	0.05
775	0.04
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.05
780	0.06
781	0.06
782	0.06
783	0.07
784	0.07
785	0.08
786	0.08
787	0.07
788	0.06
789	0.07
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.08
795	0.09
796	0.1
797	0.16
798	0.17
799	0.22
800	0.22
801	0.22
802	0.24
803	0.3
804	0.39
805	0.34
806	0.36
807	0.34
808	0.36
809	0.36
810	0.34
811	0.29
812	0.21
813	0.22
814	0.2
815	0.21
816	0.25
817	0.29
818	0.3
819	0.35
820	0.36
821	0.39
822	0.4
823	0.38
824	0.32
825	0.29
826	0.28
827	0.21
828	0.17
829	0.12
830	0.1
831	0.08
832	0.07
833	0.07
834	0.06
835	0.08
836	0.08
837	0.09
838	0.09
839	0.09
840	0.1
841	0.1
842	0.09
843	0.09
844	0.11
845	0.13
846	0.12
847	0.12
848	0.12
849	0.13
850	0.13
851	0.1
852	0.1
853	0.08
854	0.08
855	0.09
856	0.09
857	0.09
858	0.09
859	0.08
860	0.07
861	0.06
862	0.06
863	0.05
864	0.05
865	0.04
866	0.04
867	0.04
868	0.04
869	0.05
870	0.04
871	0.04
872	0.04
873	0.04
874	0.04
875	0.04
876	0.03
877	0.03
878	0.03
879	0.03
880	0.04
881	0.04
882	0.04
883	0.06
884	0.09
885	0.1
886	0.1
887	0.11
888	0.13
889	0.16
890	0.18
891	0.18
892	0.22
893	0.24
894	0.25
895	0.27
896	0.29
897	0.32
898	0.37
899	0.45
900	0.45
901	0.5
902	0.53
903	0.59
904	0.61
905	0.62
906	0.59
907	0.58
908	0.55
909	0.51
910	0.48
911	0.39
912	0.32
913	0.26
914	0.22
915	0.13
916	0.09
917	0.06
918	0.06
919	0.06
920	0.06
921	0.07
922	0.08
923	0.11
924	0.12
925	0.13
926	0.14
927	0.16
928	0.16
929	0.2
930	0.19
931	0.17
932	0.2
933	0.2
934	0.2
935	0.18
936	0.18
937	0.19
938	0.18
939	0.19
940	0.16
941	0.18
942	0.22
943	0.22
944	0.25
945	0.24
946	0.29
947	0.36
948	0.45
949	0.52
950	0.52
951	0.56
952	0.61
953	0.66
954	0.62
955	0.54
956	0.45
957	0.36
958	0.32
959	0.27
960	0.21
961	0.15
962	0.15
963	0.15
964	0.14
965	0.14
966	0.14
967	0.14
968	0.13
969	0.11
970	0.09
971	0.09
972	0.1
973	0.12
974	0.12
975	0.12
976	0.13
977	0.15
978	0.19
979	0.25
980	0.32
981	0.38
982	0.44
983	0.5
984	0.52
985	0.53
986	0.5
987	0.44
988	0.38
989	0.33
990	0.27
991	0.19
992	0.16
993	0.14
994	0.13
995	0.12
996	0.09
997	0.05
998	0.05
999	0.05
1000	0.06
1001	0.05
1002	0.06
1003	0.09
1004	0.09
1005	0.1
1006	0.1
1007	0.12
1008	0.12
1009	0.13
1010	0.13
1011	0.12
1012	0.13
1013	0.14
1014	0.14
1015	0.16
1016	0.17
1017	0.2
1018	0.21
1019	0.19
1020	0.23
1021	0.23
1022	0.23
1023	0.2
1024	0.17
1025	0.14
1026	0.14
1027	0.14
1028	0.09
1029	0.09
1030	0.09
1031	0.1
1032	0.11
1033	0.11
1034	0.12
1035	0.12
1036	0.11
1037	0.12
1038	0.12
1039	0.11
1040	0.11
1041	0.12
1042	0.1
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.1
1047	0.1
1048	0.09
1049	0.07
1050	0.06
1051	0.05
1052	0.07
1053	0.07
1054	0.07
1055	0.08
1056	0.09
1057	0.14
1058	0.15
1059	0.16
1060	0.14
1061	0.14
1062	0.15
1063	0.2
1064	0.22
1065	0.2
1066	0.21
1067	0.22
1068	0.22
1069	0.23
1070	0.22
1071	0.17
1072	0.13
1073	0.12
1074	0.09
1075	0.08
1076	0.07
1077	0.05
1078	0.05
1079	0.05
1080	0.04
1081	0.04
1082	0.04
1083	0.04
1084	0.04
1085	0.04
1086	0.04
1087	0.04
1088	0.06
1089	0.08
1090	0.08
1091	0.08
1092	0.08
1093	0.1
1094	0.12
1095	0.12
1096	0.11
1097	0.11
1098	0.17
1099	0.18
1100	0.18
1101	0.17
1102	0.16
1103	0.16
1104	0.18
1105	0.19
1106	0.13
1107	0.12
1108	0.13
1109	0.15
1110	0.2
1111	0.2
1112	0.21
1113	0.2
1114	0.2
1115	0.19
1116	0.18
1117	0.16
1118	0.11
1119	0.1
1120	0.08
1121	0.05
1122	0.05
1123	0.05
1124	0.05
1125	0.05
1126	0.05
1127	0.04
1128	0.04
1129	0.1
1130	0.13
1131	0.16
1132	0.23
1133	0.29
1134	0.39
1135	0.48
1136	0.53
1137	0.54
1138	0.62
1139	0.67
1140	0.68
1141	0.7
1142	0.69
1143	0.65
1144	0.63
1145	0.6
1146	0.5
1147	0.44
1148	0.38
1149	0.3
1150	0.22
1151	0.19
1152	0.16
1153	0.13
1154	0.12
1155	0.12
1156	0.11
1157	0.11
1158	0.12
1159	0.14
1160	0.13
1161	0.16
1162	0.19
1163	0.24
1164	0.3
1165	0.38
1166	0.45
1167	0.45
1168	0.52
1169	0.51
1170	0.49
1171	0.54
1172	0.48
1173	0.43

B6JX83

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer